Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZNT6

Protein Details
Accession A0A178ZNT6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-29SDKIRNKRLAKLQQSQPQPQPQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MADPSMDSDKIRNKRLAKLQQSQPQPQPQSQDTVAAASTPAQDGSDSTPSSRPETPQGDPSALPTPTDSATPSGTVTKEPSPPPTTRIRISPANVTPQKREMDGLERPNSRQSSRPNESIEQWEDRTLKSIFRLSLDPEQTKDIHGQQLYVLAQLREELESEGKPVLLNTDLLEQAIMEAGADLGKSTPHDWLFGCWKRITRMSKAVKDRSPENKKWAIISEARRLCMSWCILSITTPDVFGANYNGVAALADHLLADPDEDGGVCHDFLTEVITRFDEDETIKDAFVGAVENLSERLAKLTMDSDYRRYTAMLRHLIRYKPVAIAITQSNIFVDKSVPAAQLEVGTLLGPFFQLSPLQAEVTKQYFSAPKTMDPGRIRNSQQSLQMSLRSHQTELFDIVNTLVRASPEARERVLDWFALVVNSNHKRRALRVDKATVSSDGFMINVTAILDQLCEPFMDAQFSKIDRVDIGYLRRHPRVDIKEETKINADQEHSDEFYKDQLEGTNNFISECFFLAVASHYYGSEAARNMLKDMDRDLKHMAKQIEVFETERHKYVNNPAQLALFENALKRYKDQHDKGLSYKYAVQGVLLDEIAQTRSMQFMRFVTVWILRQVSPHGQFPKQKLTLPLPPDQPETFKNLPEYFLDVISGNFGFIMYNMPQVISATQSDELIMLCITFLRNSEYIKNPYLKASLVTILFRGTWSWRQGGRGILADQYNSMPFATEHLLHSLMKFFIEAEFMGGHGQFFDKFNVRFEIFQIIKCIWPNTVYRDNLLREAKVNMEFFVRFVNLLLNDVTFVLDESFTAFHTIYDISKELSLAGTSLDQQQRQEKEEALEAAKSKAKSYMQLTNETVAMLKLFTEALADAFTMPEIVQRLADMLDYNLDAMVGPKSTTLKVENLQEYNFNPKALLSEIIDVYLNLSERENFILAVARDGRSYKPENFINAGNIMRKFVLKAPEELNRWQRLIEKFAKAKEEDEAADADLGEIPDEYLDPLMFTLMEDPVRLPVSKIVIDRSTIRSHLLSDPHDPFNRVPLKIEDVIPATDVKEQIQKFKEERIGSRRKDFVETVKTEAGGTADGEAMDLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.69
3 0.73
4 0.74
5 0.76
6 0.79
7 0.79
8 0.83
9 0.82
10 0.8
11 0.8
12 0.75
13 0.69
14 0.67
15 0.61
16 0.59
17 0.51
18 0.47
19 0.38
20 0.34
21 0.3
22 0.23
23 0.2
24 0.16
25 0.16
26 0.12
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.17
32 0.21
33 0.2
34 0.22
35 0.26
36 0.28
37 0.33
38 0.35
39 0.33
40 0.36
41 0.41
42 0.42
43 0.45
44 0.47
45 0.44
46 0.41
47 0.42
48 0.4
49 0.34
50 0.31
51 0.25
52 0.24
53 0.21
54 0.22
55 0.2
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.25
65 0.3
66 0.32
67 0.38
68 0.4
69 0.41
70 0.43
71 0.49
72 0.5
73 0.47
74 0.5
75 0.48
76 0.5
77 0.52
78 0.56
79 0.51
80 0.56
81 0.59
82 0.58
83 0.56
84 0.55
85 0.54
86 0.46
87 0.44
88 0.37
89 0.37
90 0.41
91 0.45
92 0.47
93 0.47
94 0.48
95 0.54
96 0.54
97 0.49
98 0.48
99 0.49
100 0.52
101 0.56
102 0.6
103 0.58
104 0.58
105 0.59
106 0.59
107 0.55
108 0.5
109 0.44
110 0.44
111 0.39
112 0.36
113 0.37
114 0.3
115 0.27
116 0.26
117 0.3
118 0.26
119 0.27
120 0.29
121 0.3
122 0.38
123 0.42
124 0.4
125 0.37
126 0.39
127 0.36
128 0.36
129 0.35
130 0.3
131 0.3
132 0.28
133 0.27
134 0.24
135 0.28
136 0.26
137 0.24
138 0.23
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.17
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.1
155 0.11
156 0.1
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.07
174 0.08
175 0.13
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.2
180 0.3
181 0.34
182 0.37
183 0.35
184 0.38
185 0.41
186 0.48
187 0.5
188 0.47
189 0.52
190 0.58
191 0.64
192 0.7
193 0.73
194 0.7
195 0.68
196 0.68
197 0.69
198 0.69
199 0.66
200 0.65
201 0.63
202 0.6
203 0.58
204 0.53
205 0.48
206 0.46
207 0.46
208 0.48
209 0.45
210 0.44
211 0.42
212 0.39
213 0.35
214 0.33
215 0.29
216 0.2
217 0.18
218 0.19
219 0.19
220 0.2
221 0.2
222 0.17
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.05
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.11
290 0.15
291 0.17
292 0.2
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.21
297 0.22
298 0.23
299 0.29
300 0.34
301 0.33
302 0.38
303 0.43
304 0.44
305 0.44
306 0.41
307 0.35
308 0.28
309 0.27
310 0.23
311 0.17
312 0.19
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.09
321 0.09
322 0.07
323 0.09
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.08
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.13
349 0.15
350 0.14
351 0.12
352 0.14
353 0.17
354 0.17
355 0.23
356 0.21
357 0.2
358 0.25
359 0.27
360 0.33
361 0.33
362 0.38
363 0.37
364 0.42
365 0.43
366 0.45
367 0.48
368 0.42
369 0.45
370 0.41
371 0.39
372 0.34
373 0.36
374 0.31
375 0.28
376 0.3
377 0.26
378 0.24
379 0.22
380 0.22
381 0.19
382 0.2
383 0.19
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.12
395 0.14
396 0.16
397 0.17
398 0.17
399 0.18
400 0.2
401 0.2
402 0.17
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.07
409 0.14
410 0.2
411 0.22
412 0.24
413 0.27
414 0.28
415 0.31
416 0.41
417 0.41
418 0.43
419 0.47
420 0.51
421 0.5
422 0.51
423 0.49
424 0.39
425 0.32
426 0.24
427 0.18
428 0.12
429 0.1
430 0.08
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.11
450 0.12
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.13
458 0.15
459 0.18
460 0.24
461 0.28
462 0.3
463 0.29
464 0.29
465 0.35
466 0.37
467 0.39
468 0.41
469 0.41
470 0.45
471 0.45
472 0.45
473 0.38
474 0.34
475 0.28
476 0.23
477 0.2
478 0.14
479 0.15
480 0.16
481 0.14
482 0.14
483 0.13
484 0.11
485 0.12
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.11
491 0.12
492 0.15
493 0.15
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.13
498 0.11
499 0.1
500 0.07
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.1
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.13
522 0.19
523 0.18
524 0.2
525 0.23
526 0.24
527 0.25
528 0.29
529 0.27
530 0.21
531 0.22
532 0.21
533 0.19
534 0.18
535 0.17
536 0.15
537 0.18
538 0.17
539 0.16
540 0.16
541 0.15
542 0.15
543 0.23
544 0.27
545 0.26
546 0.26
547 0.26
548 0.26
549 0.25
550 0.25
551 0.17
552 0.11
553 0.09
554 0.09
555 0.11
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.18
560 0.25
561 0.34
562 0.36
563 0.42
564 0.45
565 0.47
566 0.49
567 0.48
568 0.41
569 0.33
570 0.33
571 0.25
572 0.21
573 0.19
574 0.16
575 0.12
576 0.12
577 0.11
578 0.09
579 0.07
580 0.05
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.04
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.12
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.14
596 0.14
597 0.14
598 0.16
599 0.13
600 0.13
601 0.15
602 0.18
603 0.19
604 0.23
605 0.25
606 0.27
607 0.32
608 0.35
609 0.41
610 0.38
611 0.38
612 0.38
613 0.39
614 0.41
615 0.4
616 0.42
617 0.36
618 0.36
619 0.38
620 0.34
621 0.32
622 0.27
623 0.31
624 0.27
625 0.25
626 0.27
627 0.24
628 0.24
629 0.22
630 0.25
631 0.17
632 0.16
633 0.15
634 0.12
635 0.11
636 0.11
637 0.1
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.04
642 0.04
643 0.07
644 0.06
645 0.07
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.07
660 0.06
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.05
667 0.08
668 0.09
669 0.11
670 0.16
671 0.21
672 0.24
673 0.28
674 0.3
675 0.28
676 0.29
677 0.28
678 0.24
679 0.2
680 0.18
681 0.16
682 0.14
683 0.14
684 0.13
685 0.12
686 0.11
687 0.11
688 0.1
689 0.11
690 0.14
691 0.16
692 0.2
693 0.21
694 0.23
695 0.25
696 0.26
697 0.25
698 0.22
699 0.21
700 0.2
701 0.19
702 0.17
703 0.15
704 0.14
705 0.12
706 0.1
707 0.09
708 0.07
709 0.07
710 0.09
711 0.1
712 0.1
713 0.11
714 0.12
715 0.14
716 0.13
717 0.14
718 0.13
719 0.11
720 0.1
721 0.09
722 0.08
723 0.07
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.06
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.07
736 0.1
737 0.14
738 0.15
739 0.17
740 0.22
741 0.22
742 0.22
743 0.22
744 0.28
745 0.24
746 0.24
747 0.25
748 0.21
749 0.22
750 0.23
751 0.22
752 0.14
753 0.16
754 0.17
755 0.22
756 0.28
757 0.27
758 0.28
759 0.33
760 0.34
761 0.38
762 0.38
763 0.32
764 0.26
765 0.27
766 0.27
767 0.26
768 0.24
769 0.18
770 0.19
771 0.18
772 0.17
773 0.17
774 0.14
775 0.11
776 0.11
777 0.13
778 0.1
779 0.12
780 0.12
781 0.1
782 0.1
783 0.1
784 0.09
785 0.06
786 0.06
787 0.06
788 0.05
789 0.05
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.08
794 0.08
795 0.07
796 0.08
797 0.09
798 0.09
799 0.11
800 0.11
801 0.11
802 0.11
803 0.11
804 0.1
805 0.09
806 0.09
807 0.07
808 0.07
809 0.06
810 0.07
811 0.14
812 0.18
813 0.18
814 0.21
815 0.28
816 0.31
817 0.34
818 0.35
819 0.3
820 0.29
821 0.3
822 0.3
823 0.24
824 0.24
825 0.21
826 0.22
827 0.24
828 0.22
829 0.2
830 0.23
831 0.23
832 0.26
833 0.3
834 0.36
835 0.35
836 0.4
837 0.41
838 0.37
839 0.36
840 0.3
841 0.25
842 0.17
843 0.14
844 0.08
845 0.07
846 0.06
847 0.05
848 0.05
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.06
857 0.05
858 0.05
859 0.07
860 0.08
861 0.09
862 0.08
863 0.08
864 0.09
865 0.09
866 0.1
867 0.08
868 0.07
869 0.08
870 0.08
871 0.08
872 0.07
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.07
877 0.06
878 0.06
879 0.08
880 0.1
881 0.11
882 0.14
883 0.16
884 0.19
885 0.23
886 0.3
887 0.33
888 0.34
889 0.34
890 0.34
891 0.33
892 0.37
893 0.35
894 0.27
895 0.22
896 0.2
897 0.21
898 0.2
899 0.21
900 0.14
901 0.16
902 0.16
903 0.16
904 0.16
905 0.14
906 0.13
907 0.13
908 0.11
909 0.09
910 0.1
911 0.1
912 0.11
913 0.14
914 0.13
915 0.11
916 0.11
917 0.16
918 0.15
919 0.19
920 0.2
921 0.19
922 0.2
923 0.21
924 0.23
925 0.24
926 0.29
927 0.28
928 0.33
929 0.36
930 0.39
931 0.4
932 0.4
933 0.37
934 0.35
935 0.34
936 0.32
937 0.29
938 0.26
939 0.24
940 0.23
941 0.22
942 0.24
943 0.29
944 0.26
945 0.3
946 0.32
947 0.39
948 0.42
949 0.48
950 0.51
951 0.48
952 0.46
953 0.43
954 0.46
955 0.42
956 0.47
957 0.47
958 0.47
959 0.48
960 0.52
961 0.56
962 0.51
963 0.48
964 0.43
965 0.39
966 0.31
967 0.27
968 0.24
969 0.19
970 0.18
971 0.17
972 0.14
973 0.12
974 0.1
975 0.09
976 0.08
977 0.07
978 0.07
979 0.07
980 0.07
981 0.06
982 0.06
983 0.06
984 0.06
985 0.07
986 0.06
987 0.06
988 0.08
989 0.09
990 0.1
991 0.1
992 0.11
993 0.14
994 0.16
995 0.16
996 0.16
997 0.17
998 0.21
999 0.25
1000 0.26
1001 0.28
1002 0.28
1003 0.31
1004 0.34
1005 0.35
1006 0.35
1007 0.32
1008 0.33
1009 0.29
1010 0.3
1011 0.33
1012 0.35
1013 0.33
1014 0.37
1015 0.4
1016 0.44
1017 0.46
1018 0.46
1019 0.41
1020 0.45
1021 0.48
1022 0.41
1023 0.4
1024 0.37
1025 0.41
1026 0.41
1027 0.42
1028 0.36
1029 0.32
1030 0.32
1031 0.29
1032 0.25
1033 0.2
1034 0.2
1035 0.2
1036 0.18
1037 0.23
1038 0.24
1039 0.32
1040 0.36
1041 0.42
1042 0.4
1043 0.48
1044 0.54
1045 0.52
1046 0.59
1047 0.61
1048 0.67
1049 0.66
1050 0.72
1051 0.7
1052 0.65
1053 0.65
1054 0.61
1055 0.6
1056 0.6
1057 0.56
1058 0.54
1059 0.5
1060 0.47
1061 0.41
1062 0.38
1063 0.29
1064 0.2
1065 0.17
1066 0.12
1067 0.1
1068 0.1