Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZBE8

Protein Details
Accession A0A178ZBE8    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-76QPTAQQQHPQHQQQQHQHHHHHHPDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MAQSPTHLKEEAPDQYDPTHPNNANNRETQRPKSRGSTTSLQSIGVGSAFQPTAQQQHPQHQQQQHQHHHHHHPDEPTMPLDQNTFFMQHGAHPAAGVYGPNPEEMLMHYQHNMPPHHHQQPIDPNTGLPPHEMRPMSQQAFQEIQHYPMQYPHGLPYAVAPQHMHHMRHHSEQFEGSPAPEDSNNENGGAKRRKGTASSVANDQELRRLLAQYQGKSLKEVAVEVQKNEGAGGKSEKAKQVFAMLWLQENCQRSSNSVRRDRVFTRYTERCGNERVPTLNPASFGKLVRIIFPNVQTRRLGVRGESKYHYVDLSLIMDDDDRQYSLVPERPGTSSGSQHERHGSVQEANKLFKSNVTPPLDRPMSRATMETADFPAPSAAFLSKEADVPGNKTTTPVEPQMERLDCRYINTPTIRFPVKSMPMNVVLSLPSIRGHLPASMATYLGMPTLNSLSQPSPSSQDTPIDFPDIQPYLEGENYDASIAKALFHLYRSYCIDVIDAFRKCKEKPFFNHHSAFNGKMTVPVSKLFSMPCLAPWIQECDMRMYKQIVRFIAPLAIQNVPEVVWNVFDRIGSKLVDHLITAFEEKCPVHVIVAKIVPAARFVHVLKKLKGANAATLQLSRMLEDPQQRTQMWLDLMSIVDPDRLLEDSMPPPESLEKMLGMLKHDMRPLVDPIDDALVHAAEDDTASAYATFINDHADSCDGILLPESSDASTPLLERWINWLERLPQLFDGHHPQCMINWHTRLWRSVMTQMGQGGAHSYQSWWFVESFTTQMLDWMTQMEGLLLNSQIQKLADEREQEKREETKTHPDVLFRGTKRKRAVQDVDADANAPAEPDSRKLVKVEMGPGSPTLPAVSVEQQAGQQIDDDETDAELDELRRGGPLDLPSFHTGLSSPVKHRATGNHDDSGIDLGLDVDVEAEKEARKFNKRDWLLSSDPADAAMGLVVLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.39
4 0.4
5 0.37
6 0.39
7 0.37
8 0.45
9 0.53
10 0.58
11 0.58
12 0.61
13 0.62
14 0.63
15 0.68
16 0.69
17 0.7
18 0.68
19 0.69
20 0.7
21 0.72
22 0.66
23 0.66
24 0.65
25 0.58
26 0.6
27 0.55
28 0.46
29 0.39
30 0.35
31 0.28
32 0.19
33 0.16
34 0.08
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.19
41 0.21
42 0.3
43 0.31
44 0.41
45 0.51
46 0.57
47 0.64
48 0.65
49 0.73
50 0.74
51 0.81
52 0.81
53 0.81
54 0.81
55 0.81
56 0.84
57 0.84
58 0.79
59 0.74
60 0.69
61 0.64
62 0.58
63 0.51
64 0.43
65 0.36
66 0.32
67 0.27
68 0.25
69 0.2
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.2
78 0.2
79 0.18
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.14
85 0.09
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.13
93 0.18
94 0.15
95 0.16
96 0.18
97 0.21
98 0.23
99 0.29
100 0.29
101 0.28
102 0.35
103 0.42
104 0.48
105 0.5
106 0.49
107 0.51
108 0.59
109 0.61
110 0.57
111 0.48
112 0.41
113 0.4
114 0.42
115 0.34
116 0.27
117 0.24
118 0.22
119 0.29
120 0.29
121 0.27
122 0.32
123 0.4
124 0.4
125 0.41
126 0.39
127 0.37
128 0.39
129 0.38
130 0.35
131 0.27
132 0.28
133 0.27
134 0.27
135 0.22
136 0.23
137 0.26
138 0.23
139 0.24
140 0.23
141 0.23
142 0.22
143 0.21
144 0.2
145 0.24
146 0.23
147 0.23
148 0.21
149 0.19
150 0.28
151 0.33
152 0.33
153 0.29
154 0.37
155 0.4
156 0.47
157 0.5
158 0.43
159 0.39
160 0.39
161 0.36
162 0.31
163 0.28
164 0.2
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.19
170 0.19
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.22
175 0.22
176 0.3
177 0.34
178 0.33
179 0.33
180 0.36
181 0.39
182 0.4
183 0.44
184 0.44
185 0.45
186 0.45
187 0.46
188 0.43
189 0.42
190 0.4
191 0.35
192 0.3
193 0.23
194 0.23
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.24
199 0.29
200 0.26
201 0.32
202 0.35
203 0.35
204 0.35
205 0.35
206 0.3
207 0.25
208 0.24
209 0.2
210 0.24
211 0.25
212 0.24
213 0.25
214 0.23
215 0.23
216 0.22
217 0.22
218 0.13
219 0.14
220 0.17
221 0.18
222 0.22
223 0.26
224 0.31
225 0.29
226 0.29
227 0.27
228 0.28
229 0.25
230 0.23
231 0.24
232 0.2
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.23
237 0.25
238 0.24
239 0.23
240 0.23
241 0.22
242 0.32
243 0.38
244 0.43
245 0.49
246 0.54
247 0.54
248 0.6
249 0.59
250 0.57
251 0.53
252 0.47
253 0.47
254 0.46
255 0.47
256 0.48
257 0.48
258 0.43
259 0.45
260 0.45
261 0.4
262 0.39
263 0.37
264 0.32
265 0.32
266 0.33
267 0.28
268 0.26
269 0.23
270 0.23
271 0.23
272 0.21
273 0.19
274 0.21
275 0.2
276 0.22
277 0.23
278 0.22
279 0.22
280 0.27
281 0.34
282 0.31
283 0.34
284 0.31
285 0.3
286 0.31
287 0.31
288 0.28
289 0.22
290 0.3
291 0.31
292 0.35
293 0.35
294 0.34
295 0.33
296 0.32
297 0.29
298 0.2
299 0.17
300 0.14
301 0.12
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.11
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.18
318 0.19
319 0.2
320 0.22
321 0.21
322 0.2
323 0.22
324 0.28
325 0.27
326 0.28
327 0.3
328 0.28
329 0.27
330 0.25
331 0.24
332 0.22
333 0.24
334 0.29
335 0.28
336 0.28
337 0.28
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.24
342 0.23
343 0.29
344 0.33
345 0.34
346 0.34
347 0.42
348 0.42
349 0.37
350 0.35
351 0.31
352 0.28
353 0.28
354 0.27
355 0.21
356 0.2
357 0.21
358 0.18
359 0.17
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.11
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.17
384 0.18
385 0.18
386 0.18
387 0.2
388 0.24
389 0.25
390 0.23
391 0.22
392 0.22
393 0.2
394 0.22
395 0.24
396 0.2
397 0.23
398 0.25
399 0.25
400 0.24
401 0.27
402 0.27
403 0.23
404 0.23
405 0.25
406 0.27
407 0.28
408 0.27
409 0.26
410 0.27
411 0.27
412 0.25
413 0.19
414 0.14
415 0.12
416 0.11
417 0.09
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.1
443 0.1
444 0.12
445 0.13
446 0.16
447 0.15
448 0.18
449 0.17
450 0.18
451 0.18
452 0.18
453 0.17
454 0.15
455 0.17
456 0.15
457 0.14
458 0.12
459 0.12
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.1
477 0.09
478 0.12
479 0.13
480 0.15
481 0.14
482 0.14
483 0.13
484 0.11
485 0.14
486 0.17
487 0.16
488 0.16
489 0.18
490 0.2
491 0.21
492 0.29
493 0.33
494 0.35
495 0.4
496 0.49
497 0.54
498 0.58
499 0.62
500 0.54
501 0.52
502 0.46
503 0.4
504 0.32
505 0.26
506 0.19
507 0.17
508 0.17
509 0.14
510 0.13
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.1
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.13
524 0.17
525 0.17
526 0.18
527 0.18
528 0.19
529 0.21
530 0.21
531 0.22
532 0.2
533 0.22
534 0.25
535 0.28
536 0.23
537 0.24
538 0.23
539 0.22
540 0.21
541 0.18
542 0.16
543 0.14
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.09
558 0.1
559 0.12
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.12
565 0.11
566 0.09
567 0.08
568 0.08
569 0.1
570 0.09
571 0.07
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.14
579 0.15
580 0.16
581 0.17
582 0.16
583 0.14
584 0.15
585 0.14
586 0.13
587 0.13
588 0.1
589 0.12
590 0.13
591 0.2
592 0.25
593 0.31
594 0.3
595 0.35
596 0.36
597 0.35
598 0.4
599 0.33
600 0.31
601 0.28
602 0.28
603 0.23
604 0.22
605 0.2
606 0.17
607 0.16
608 0.13
609 0.11
610 0.11
611 0.15
612 0.21
613 0.24
614 0.26
615 0.3
616 0.29
617 0.3
618 0.29
619 0.28
620 0.23
621 0.19
622 0.16
623 0.13
624 0.13
625 0.11
626 0.1
627 0.07
628 0.07
629 0.06
630 0.05
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.07
635 0.1
636 0.12
637 0.14
638 0.15
639 0.14
640 0.14
641 0.15
642 0.15
643 0.14
644 0.13
645 0.11
646 0.11
647 0.13
648 0.13
649 0.14
650 0.17
651 0.19
652 0.2
653 0.21
654 0.21
655 0.2
656 0.21
657 0.22
658 0.19
659 0.16
660 0.14
661 0.14
662 0.15
663 0.13
664 0.11
665 0.09
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.06
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.05
682 0.08
683 0.08
684 0.08
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.07
694 0.06
695 0.07
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.16
708 0.21
709 0.21
710 0.21
711 0.24
712 0.24
713 0.29
714 0.3
715 0.27
716 0.25
717 0.26
718 0.26
719 0.26
720 0.32
721 0.28
722 0.28
723 0.26
724 0.24
725 0.24
726 0.29
727 0.29
728 0.27
729 0.28
730 0.29
731 0.34
732 0.36
733 0.37
734 0.34
735 0.34
736 0.3
737 0.33
738 0.35
739 0.3
740 0.3
741 0.28
742 0.26
743 0.22
744 0.19
745 0.16
746 0.11
747 0.11
748 0.09
749 0.1
750 0.1
751 0.13
752 0.13
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.13
757 0.14
758 0.13
759 0.12
760 0.12
761 0.11
762 0.12
763 0.12
764 0.11
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.08
769 0.09
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.08
774 0.07
775 0.09
776 0.1
777 0.11
778 0.12
779 0.11
780 0.12
781 0.13
782 0.17
783 0.19
784 0.23
785 0.27
786 0.35
787 0.38
788 0.39
789 0.42
790 0.43
791 0.44
792 0.44
793 0.45
794 0.46
795 0.48
796 0.53
797 0.49
798 0.46
799 0.44
800 0.44
801 0.48
802 0.4
803 0.47
804 0.45
805 0.52
806 0.56
807 0.63
808 0.64
809 0.65
810 0.69
811 0.65
812 0.68
813 0.65
814 0.61
815 0.53
816 0.46
817 0.36
818 0.3
819 0.22
820 0.14
821 0.09
822 0.09
823 0.1
824 0.12
825 0.18
826 0.2
827 0.22
828 0.23
829 0.25
830 0.28
831 0.31
832 0.35
833 0.33
834 0.32
835 0.31
836 0.31
837 0.29
838 0.24
839 0.2
840 0.14
841 0.11
842 0.1
843 0.12
844 0.15
845 0.16
846 0.17
847 0.17
848 0.17
849 0.19
850 0.19
851 0.16
852 0.14
853 0.12
854 0.13
855 0.12
856 0.13
857 0.1
858 0.1
859 0.1
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.09
865 0.09
866 0.09
867 0.1
868 0.11
869 0.12
870 0.15
871 0.19
872 0.22
873 0.24
874 0.29
875 0.3
876 0.3
877 0.29
878 0.25
879 0.2
880 0.21
881 0.27
882 0.26
883 0.27
884 0.36
885 0.38
886 0.4
887 0.43
888 0.46
889 0.47
890 0.52
891 0.53
892 0.48
893 0.47
894 0.45
895 0.42
896 0.37
897 0.28
898 0.18
899 0.12
900 0.09
901 0.08
902 0.08
903 0.07
904 0.04
905 0.05
906 0.05
907 0.06
908 0.07
909 0.1
910 0.12
911 0.19
912 0.26
913 0.35
914 0.4
915 0.47
916 0.56
917 0.59
918 0.63
919 0.62
920 0.62
921 0.58
922 0.59
923 0.55
924 0.46
925 0.41
926 0.36
927 0.29
928 0.22
929 0.17
930 0.11