Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZTP4

Protein Details
Accession A0A178ZTP4    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
814-838HEQGERDRSSKKRKRNTGAGDQMRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
803-808RKRQKL
814-828HEQGERDRSSKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MDIHRCRFVQYPPQPINAVAFSHSSNPKKKAPSDLRLALGRNNGDIEIWNPENGLWVQENILKGSRNTTIEQLAWTQDLVWEESHNTITPKASRGPLRLFSTGGSTSVTEWDLTTGTPRSRAEGNFGDIWCFAAQPQLEDAKSQEALQGGAGSQLLAAGCSDGTIILFSTEDDDLRYLRPLAQPPVKKPKVLSLVWRDRNTVVAGYEDSMIRVIDVSSRRILRNMSLGKPIEGNNSVVWTVKCLPDGTIVSGDSSGELKIWDSKNYSLVQRLKSHKADILDIAMNTSGDMIFSVGVDRRTVTHKMVPLHSGTQKMRWAEVSHKRIHQHDVKCAASFESIELSVLVSGGMDARPVVVPIRRSQTEYHRALSHLPQRSHISSSKASRVFISWWDHEIVVYHVRKFSPLSPADGSLEGTAESYYDTLTKLVIQDDESIQDAHISPDGRLITAATSNGVKMFQLRNTHVSGKPCLRTRQIELPPSIARLGARRIGFSPDGKWLYCVRKDNAVVMMKLSSSDDSKDRPAIHEKIVKLYRQPRKTAQSALGSYLQTIKQVAFSTDSRVLGVGDISGAIDVWVLEGHEDVNFIDDAGSESSNDSSGSSTSSTTSDDEDDDSSSPIIHGQKWIRNPSGSSLPQLDSSILVLTFRPPPDSPKSSSAGAHDNRGLHATRHNPHPVSHELPDEANTKLIAVTAKHQLVEFDILTAKLSEWSRRNPSKFLPHDFTKIKDRVVGCFWDCHDRTRNGERLWLYGPSWIFMFDVSRDLLKDHPNGVTSGSREGEVDKIGRLGRYEVVEPLIKGGHANRKRQKLLEPAAHEQGERDRSSKKRKRNTGAGDQMRLEDREGGLGSELRRFKNASGDDAEVIDLDIENAGNEMDLDDDLGEDERQDDALALMRRGESGSSATEKVTPNGQDTAPLSSQRTPRMYWSTFDYQSILGIEVIGTPEPSPPASNGFTTEVATTERNNIEEGSSGNIEVIIVERPMHDVGQEPRFDGGQEWDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.53
3 0.5
4 0.41
5 0.34
6 0.26
7 0.24
8 0.21
9 0.27
10 0.34
11 0.38
12 0.44
13 0.49
14 0.54
15 0.6
16 0.63
17 0.67
18 0.69
19 0.69
20 0.71
21 0.7
22 0.68
23 0.65
24 0.62
25 0.55
26 0.52
27 0.45
28 0.37
29 0.32
30 0.27
31 0.23
32 0.22
33 0.19
34 0.2
35 0.2
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.2
40 0.2
41 0.21
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.19
46 0.21
47 0.19
48 0.22
49 0.21
50 0.2
51 0.24
52 0.27
53 0.27
54 0.28
55 0.3
56 0.3
57 0.29
58 0.31
59 0.28
60 0.25
61 0.22
62 0.2
63 0.17
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.16
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.21
76 0.23
77 0.25
78 0.28
79 0.33
80 0.37
81 0.42
82 0.48
83 0.51
84 0.53
85 0.51
86 0.47
87 0.41
88 0.4
89 0.34
90 0.28
91 0.22
92 0.17
93 0.16
94 0.17
95 0.17
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.14
102 0.16
103 0.17
104 0.22
105 0.22
106 0.24
107 0.29
108 0.3
109 0.33
110 0.32
111 0.35
112 0.35
113 0.35
114 0.33
115 0.28
116 0.29
117 0.22
118 0.18
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.17
124 0.19
125 0.19
126 0.2
127 0.21
128 0.21
129 0.21
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.12
165 0.15
166 0.2
167 0.24
168 0.32
169 0.39
170 0.44
171 0.51
172 0.61
173 0.6
174 0.58
175 0.54
176 0.55
177 0.54
178 0.51
179 0.52
180 0.51
181 0.59
182 0.65
183 0.66
184 0.59
185 0.52
186 0.51
187 0.44
188 0.34
189 0.24
190 0.18
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.1
202 0.13
203 0.15
204 0.2
205 0.23
206 0.24
207 0.26
208 0.28
209 0.25
210 0.32
211 0.35
212 0.33
213 0.37
214 0.37
215 0.36
216 0.37
217 0.35
218 0.31
219 0.27
220 0.26
221 0.19
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.18
230 0.17
231 0.17
232 0.2
233 0.21
234 0.19
235 0.19
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.13
247 0.15
248 0.17
249 0.19
250 0.21
251 0.24
252 0.27
253 0.28
254 0.3
255 0.34
256 0.37
257 0.42
258 0.47
259 0.5
260 0.51
261 0.51
262 0.46
263 0.42
264 0.39
265 0.32
266 0.29
267 0.23
268 0.2
269 0.18
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.1
274 0.06
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.14
287 0.17
288 0.19
289 0.22
290 0.26
291 0.29
292 0.31
293 0.31
294 0.3
295 0.32
296 0.31
297 0.33
298 0.3
299 0.31
300 0.33
301 0.32
302 0.3
303 0.28
304 0.27
305 0.3
306 0.39
307 0.41
308 0.42
309 0.45
310 0.48
311 0.48
312 0.53
313 0.53
314 0.47
315 0.48
316 0.5
317 0.46
318 0.43
319 0.41
320 0.35
321 0.27
322 0.23
323 0.15
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.03
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.07
342 0.09
343 0.11
344 0.15
345 0.21
346 0.21
347 0.24
348 0.27
349 0.34
350 0.41
351 0.42
352 0.42
353 0.37
354 0.37
355 0.37
356 0.4
357 0.39
358 0.37
359 0.35
360 0.35
361 0.38
362 0.39
363 0.41
364 0.36
365 0.34
366 0.31
367 0.35
368 0.39
369 0.36
370 0.35
371 0.31
372 0.3
373 0.27
374 0.26
375 0.28
376 0.21
377 0.21
378 0.22
379 0.21
380 0.2
381 0.19
382 0.16
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.18
387 0.18
388 0.19
389 0.2
390 0.2
391 0.21
392 0.21
393 0.24
394 0.24
395 0.25
396 0.25
397 0.24
398 0.22
399 0.14
400 0.13
401 0.09
402 0.08
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.08
444 0.1
445 0.13
446 0.17
447 0.19
448 0.21
449 0.24
450 0.28
451 0.28
452 0.29
453 0.3
454 0.3
455 0.33
456 0.34
457 0.35
458 0.35
459 0.36
460 0.38
461 0.43
462 0.44
463 0.44
464 0.41
465 0.4
466 0.36
467 0.34
468 0.3
469 0.2
470 0.15
471 0.13
472 0.14
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.15
477 0.18
478 0.19
479 0.18
480 0.17
481 0.18
482 0.2
483 0.19
484 0.2
485 0.21
486 0.24
487 0.28
488 0.31
489 0.26
490 0.3
491 0.31
492 0.3
493 0.32
494 0.3
495 0.25
496 0.21
497 0.2
498 0.15
499 0.14
500 0.13
501 0.08
502 0.07
503 0.08
504 0.09
505 0.11
506 0.13
507 0.15
508 0.15
509 0.17
510 0.23
511 0.24
512 0.27
513 0.3
514 0.29
515 0.34
516 0.36
517 0.34
518 0.34
519 0.41
520 0.45
521 0.45
522 0.49
523 0.48
524 0.51
525 0.53
526 0.51
527 0.46
528 0.43
529 0.39
530 0.38
531 0.34
532 0.27
533 0.25
534 0.23
535 0.18
536 0.13
537 0.13
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.16
545 0.18
546 0.18
547 0.16
548 0.15
549 0.15
550 0.11
551 0.11
552 0.06
553 0.04
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.02
559 0.02
560 0.02
561 0.02
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.04
569 0.04
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.08
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.1
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.1
605 0.1
606 0.1
607 0.15
608 0.19
609 0.24
610 0.3
611 0.35
612 0.34
613 0.34
614 0.34
615 0.32
616 0.36
617 0.32
618 0.29
619 0.26
620 0.25
621 0.24
622 0.24
623 0.2
624 0.13
625 0.12
626 0.1
627 0.08
628 0.07
629 0.06
630 0.08
631 0.11
632 0.11
633 0.14
634 0.14
635 0.2
636 0.27
637 0.32
638 0.34
639 0.34
640 0.37
641 0.35
642 0.36
643 0.33
644 0.34
645 0.31
646 0.3
647 0.28
648 0.26
649 0.25
650 0.26
651 0.24
652 0.16
653 0.21
654 0.25
655 0.26
656 0.32
657 0.37
658 0.36
659 0.37
660 0.41
661 0.41
662 0.38
663 0.36
664 0.31
665 0.26
666 0.26
667 0.27
668 0.23
669 0.18
670 0.15
671 0.13
672 0.11
673 0.1
674 0.11
675 0.09
676 0.08
677 0.11
678 0.17
679 0.17
680 0.18
681 0.18
682 0.17
683 0.17
684 0.19
685 0.16
686 0.11
687 0.11
688 0.1
689 0.11
690 0.11
691 0.09
692 0.11
693 0.12
694 0.18
695 0.21
696 0.28
697 0.37
698 0.46
699 0.49
700 0.48
701 0.54
702 0.58
703 0.6
704 0.61
705 0.58
706 0.53
707 0.58
708 0.56
709 0.53
710 0.52
711 0.48
712 0.41
713 0.4
714 0.37
715 0.33
716 0.34
717 0.35
718 0.27
719 0.27
720 0.28
721 0.32
722 0.32
723 0.34
724 0.38
725 0.36
726 0.42
727 0.46
728 0.52
729 0.43
730 0.49
731 0.44
732 0.41
733 0.4
734 0.35
735 0.28
736 0.24
737 0.24
738 0.18
739 0.17
740 0.14
741 0.12
742 0.1
743 0.11
744 0.08
745 0.1
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.12
750 0.15
751 0.18
752 0.2
753 0.21
754 0.22
755 0.22
756 0.22
757 0.24
758 0.23
759 0.19
760 0.21
761 0.19
762 0.18
763 0.17
764 0.18
765 0.17
766 0.16
767 0.15
768 0.12
769 0.14
770 0.15
771 0.16
772 0.16
773 0.16
774 0.17
775 0.18
776 0.19
777 0.17
778 0.19
779 0.19
780 0.18
781 0.18
782 0.15
783 0.13
784 0.13
785 0.17
786 0.25
787 0.3
788 0.41
789 0.47
790 0.56
791 0.61
792 0.64
793 0.65
794 0.65
795 0.67
796 0.65
797 0.63
798 0.59
799 0.6
800 0.57
801 0.5
802 0.41
803 0.39
804 0.36
805 0.31
806 0.28
807 0.3
808 0.38
809 0.5
810 0.57
811 0.61
812 0.66
813 0.75
814 0.82
815 0.86
816 0.86
817 0.86
818 0.88
819 0.84
820 0.77
821 0.67
822 0.6
823 0.52
824 0.44
825 0.34
826 0.26
827 0.19
828 0.17
829 0.17
830 0.15
831 0.14
832 0.15
833 0.15
834 0.2
835 0.24
836 0.22
837 0.25
838 0.26
839 0.26
840 0.33
841 0.34
842 0.32
843 0.32
844 0.33
845 0.31
846 0.3
847 0.29
848 0.19
849 0.17
850 0.12
851 0.08
852 0.06
853 0.05
854 0.05
855 0.04
856 0.05
857 0.04
858 0.04
859 0.04
860 0.04
861 0.05
862 0.05
863 0.05
864 0.05
865 0.05
866 0.06
867 0.07
868 0.07
869 0.06
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.07
874 0.07
875 0.06
876 0.13
877 0.15
878 0.15
879 0.16
880 0.16
881 0.16
882 0.17
883 0.17
884 0.12
885 0.12
886 0.15
887 0.18
888 0.18
889 0.19
890 0.23
891 0.25
892 0.25
893 0.28
894 0.26
895 0.26
896 0.29
897 0.28
898 0.27
899 0.27
900 0.31
901 0.28
902 0.29
903 0.29
904 0.32
905 0.37
906 0.4
907 0.43
908 0.38
909 0.43
910 0.49
911 0.48
912 0.44
913 0.47
914 0.47
915 0.45
916 0.44
917 0.39
918 0.3
919 0.29
920 0.28
921 0.21
922 0.13
923 0.11
924 0.1
925 0.09
926 0.1
927 0.09
928 0.09
929 0.08
930 0.1
931 0.11
932 0.13
933 0.13
934 0.14
935 0.19
936 0.21
937 0.22
938 0.24
939 0.26
940 0.25
941 0.25
942 0.24
943 0.2
944 0.2
945 0.21
946 0.19
947 0.22
948 0.23
949 0.22
950 0.23
951 0.22
952 0.2
953 0.2
954 0.19
955 0.18
956 0.17
957 0.16
958 0.14
959 0.14
960 0.12
961 0.11
962 0.11
963 0.08
964 0.08
965 0.08
966 0.09
967 0.12
968 0.13
969 0.13
970 0.13
971 0.17
972 0.23
973 0.3
974 0.3
975 0.29
976 0.29
977 0.29
978 0.29
979 0.26