FuNGI

A0A178ZM48

Protein Details

Accession

A0A178ZM48

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-38	GATDQPLKKSKKSKTTDKKDASEPKLKD	Hydrophilic
62-84	SDNVAVTKSKKSRKRASDFMIED	Hydrophilic
103-129	EELAEPVKKKSKKSKKSKASSNGETLT	Hydrophilic
220-244	TIPPLPKYKKTQKKLEKARAKGKDD	Basic
355-384	APKTEKQWQKKIDKERRKRDKKAEKLKAIG	Basic
434-464	VAVEGGKKSKRDKKEKKEKKNQKGKQDEVDI	Basic
501-520	MSKAERKALKKAKKAAKEST	Hydrophilic
572-605	SSPAGGNKSKPWKVKKPKKERKNLVKARGPKSNL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-28	LKKSKKSKTTDK
110-120	KKKSKKSKKSK
226-242	KYKKTQKKLEKARAKGK
335-381	GANKKFRKIPHEKLERERLAAPKTEKQWQKKIDKERRKRDKKAEKLK
439-458	GKKSKRDKKEKKEKKNQKGK
503-517	KAERKALKKAKKAAK
576-640	GGNKSKPWKVKKPKKERKNLVKARGPKSNLVSTKPKPDPNATGKMGLPLLGKGKYDRPRVKRIRS

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12307 RRM_NIFK_like

Amino Acid Sequences

MGDKKRKESSGATDQPLKKSKKSKTTDKKDASEPKLKDNTMPAEASKAPKGLPNDKQEILPSDNVAVTKSKKSRKRASDFMIEDEPPVTADTVTKAGGDEPAEELAEPVKKKSKKSKKSKASSNGETLTADGVNGVIEHTGAEDLETATPHKPVSTSMQAEAERTVEHELEDGFGGFASEDDPEDAASEVEADDNAAALLAGFDSDTEDKQDDERVDLGTIPPLPKYKKTQKKLEKARAKGKDDGPGTVYVGRIPHGFYEKEMRAYFSQFGDITRLRLSRNKRTGASKHFAFIEFASDEVAKIVAETMDNYLMFGHILKCKYAEPGSLHPDVWKGANKKFRKIPHEKLERERLAAPKTEKQWQKKIDKERRKRDKKAEKLKAIGLDMPPSTLTAPSTVLSQRLADREEPKQIENGPSAASAAVETSGDLAKGEVAVEGGKKSKRDKKEKKEKKNQKGKQDEVDIALNSEATLDPGDEKEPQSTGVEDEAQPQSAETTTKEMSKAERKALKKAKKAAKESTGAAESSKAPEMAEESADIPAPDEEATAKEELSADFISFGRFDDGAGKPEASSSPAGGNKSKPWKVKKPKKERKNLVKARGPKSNLVSTKPKPDPNATGKMGLPLLGKGKYDRPRVKRIRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.68
3	0.7
4	0.67
5	0.64
6	0.66
7	0.7
8	0.71
9	0.76
10	0.79
11	0.81
12	0.87
13	0.89
14	0.89
15	0.85
16	0.84
17	0.86
18	0.83
19	0.81
20	0.73
21	0.71
22	0.71
23	0.65
24	0.59
25	0.56
26	0.53
27	0.48
28	0.47
29	0.38
30	0.35
31	0.37
32	0.38
33	0.34
34	0.29
35	0.26
36	0.29
37	0.36
38	0.39
39	0.44
40	0.48
41	0.51
42	0.51
43	0.52
44	0.51
45	0.49
46	0.44
47	0.37
48	0.3
49	0.26
50	0.26
51	0.24
52	0.22
53	0.22
54	0.21
55	0.29
56	0.36
57	0.44
58	0.51
59	0.61
60	0.7
61	0.76
62	0.81
63	0.82
64	0.8
65	0.81
66	0.76
67	0.71
68	0.65
69	0.55
70	0.46
71	0.37
72	0.3
73	0.2
74	0.18
75	0.13
76	0.08
77	0.09
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.11
84	0.13
85	0.13
86	0.12
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.12
91	0.11
92	0.12
93	0.16
94	0.16
95	0.18
96	0.26
97	0.3
98	0.39
99	0.5
100	0.58
101	0.65
102	0.75
103	0.83
104	0.85
105	0.91
106	0.93
107	0.92
108	0.91
109	0.86
110	0.82
111	0.73
112	0.63
113	0.53
114	0.43
115	0.33
116	0.24
117	0.17
118	0.09
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.05
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.04
130	0.05
131	0.06
132	0.07
133	0.07
134	0.09
135	0.09
136	0.11
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.12
141	0.18
142	0.24
143	0.26
144	0.27
145	0.32
146	0.31
147	0.32
148	0.3
149	0.24
150	0.16
151	0.15
152	0.16
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.09
158	0.1
159	0.08
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.02
186	0.03
187	0.02
188	0.02
189	0.02
190	0.02
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.14
199	0.12
200	0.13
201	0.14
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.12
206	0.11
207	0.12
208	0.11
209	0.12
210	0.16
211	0.18
212	0.23
213	0.31
214	0.4
215	0.49
216	0.56
217	0.65
218	0.71
219	0.79
220	0.86
221	0.87
222	0.86
223	0.84
224	0.86
225	0.84
226	0.78
227	0.75
228	0.66
229	0.63
230	0.55
231	0.48
232	0.4
233	0.31
234	0.28
235	0.22
236	0.19
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.12
244	0.12
245	0.13
246	0.19
247	0.2
248	0.24
249	0.23
250	0.24
251	0.22
252	0.24
253	0.25
254	0.18
255	0.19
256	0.15
257	0.15
258	0.17
259	0.16
260	0.15
261	0.16
262	0.17
263	0.16
264	0.22
265	0.29
266	0.34
267	0.41
268	0.44
269	0.45
270	0.51
271	0.56
272	0.58
273	0.57
274	0.48
275	0.42
276	0.39
277	0.36
278	0.3
279	0.23
280	0.18
281	0.12
282	0.11
283	0.1
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.03
292	0.03
293	0.04
294	0.05
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.07
303	0.09
304	0.1
305	0.1
306	0.11
307	0.11
308	0.14
309	0.14
310	0.15
311	0.15
312	0.2
313	0.24
314	0.24
315	0.24
316	0.22
317	0.22
318	0.19
319	0.18
320	0.19
321	0.17
322	0.22
323	0.31
324	0.33
325	0.38
326	0.44
327	0.49
328	0.53
329	0.59
330	0.63
331	0.64
332	0.72
333	0.71
334	0.71
335	0.74
336	0.65
337	0.59
338	0.53
339	0.47
340	0.39
341	0.39
342	0.36
343	0.31
344	0.33
345	0.39
346	0.42
347	0.45
348	0.51
349	0.55
350	0.6
351	0.63
352	0.71
353	0.74
354	0.78
355	0.82
356	0.85
357	0.87
358	0.89
359	0.91
360	0.91
361	0.91
362	0.9
363	0.91
364	0.9
365	0.85
366	0.78
367	0.72
368	0.63
369	0.53
370	0.46
371	0.35
372	0.27
373	0.21
374	0.18
375	0.15
376	0.12
377	0.12
378	0.09
379	0.09
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.16
391	0.17
392	0.21
393	0.23
394	0.29
395	0.29
396	0.28
397	0.29
398	0.29
399	0.28
400	0.25
401	0.23
402	0.17
403	0.15
404	0.15
405	0.12
406	0.1
407	0.07
408	0.06
409	0.05
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.06
424	0.07
425	0.11
426	0.13
427	0.16
428	0.25
429	0.33
430	0.43
431	0.54
432	0.64
433	0.71
434	0.81
435	0.89
436	0.92
437	0.95
438	0.96
439	0.95
440	0.96
441	0.91
442	0.91
443	0.9
444	0.84
445	0.8
446	0.75
447	0.65
448	0.57
449	0.52
450	0.41
451	0.32
452	0.26
453	0.18
454	0.12
455	0.11
456	0.08
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.06
461	0.07
462	0.09
463	0.1
464	0.12
465	0.12
466	0.13
467	0.14
468	0.14
469	0.14
470	0.14
471	0.13
472	0.15
473	0.14
474	0.18
475	0.17
476	0.17
477	0.16
478	0.15
479	0.14
480	0.12
481	0.13
482	0.1
483	0.13
484	0.14
485	0.16
486	0.17
487	0.18
488	0.24
489	0.32
490	0.35
491	0.39
492	0.46
493	0.47
494	0.56
495	0.65
496	0.68
497	0.68
498	0.73
499	0.74
500	0.76
501	0.81
502	0.78
503	0.75
504	0.7
505	0.63
506	0.58
507	0.51
508	0.41
509	0.34
510	0.28
511	0.22
512	0.21
513	0.2
514	0.15
515	0.13
516	0.13
517	0.15
518	0.14
519	0.14
520	0.12
521	0.11
522	0.12
523	0.12
524	0.12
525	0.1
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.08
531	0.09
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.1
536	0.11
537	0.11
538	0.14
539	0.13
540	0.1
541	0.11
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.12
547	0.11
548	0.11
549	0.16
550	0.18
551	0.2
552	0.22
553	0.21
554	0.18
555	0.2
556	0.2
557	0.17
558	0.16
559	0.14
560	0.19
561	0.22
562	0.25
563	0.27
564	0.3
565	0.36
566	0.45
567	0.51
568	0.54
569	0.6
570	0.68
571	0.76
572	0.84
573	0.86
574	0.88
575	0.92
576	0.94
577	0.96
578	0.96
579	0.96
580	0.96
581	0.95
582	0.94
583	0.92
584	0.91
585	0.87
586	0.85
587	0.78
588	0.74
589	0.7
590	0.69
591	0.64
592	0.61
593	0.64
594	0.59
595	0.66
596	0.66
597	0.66
598	0.62
599	0.65
600	0.68
601	0.66
602	0.7
603	0.62
604	0.58
605	0.53
606	0.5
607	0.43
608	0.37
609	0.29
610	0.24
611	0.26
612	0.24
613	0.25
614	0.25
615	0.34
616	0.4
617	0.5
618	0.56
619	0.59
620	0.68

A0A178ZM48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer