FuNGI

A0A178ZVJ3

Protein Details

Accession

A0A178ZVJ3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
139-163	GWISSGPQKRKPSKNYANRKLLQRL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
94-104	KAPKSGKRAAH
503-509	KRVRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MRTRSGDADGMIRSNASFSRTYLTREHYSGPTLLRCIRAEEVDKQILNPVMQTDMREDENLIYAPPDSSSSDEDEDDYLAHETSLNSPEQPRVKAPKSGKRAAHIAASTSSKRRKIEIEQAPDSPKTVDDSPRIDPVPGWISSGPQKRKPSKNYANRKLLQRLEIVASTTTAHAEGNGIVSPQEETSQTQTTFIEAAEVPTPGTVNGSTKPGQRTTLPSPPSERSDPERAGNQISDLPNFSLSGGIDKPTSVDAFIPRRKGRSRSASASSVSSLSSVDEVFLVLHENEFSAEHGSRSAGVRCPVCQQTIYDSVSVFIPENLRTMPFKQQQKFCTDHRLKEARKQWEERGYPKLDWAELETFRIPKKTPQLKRVLSRTRPSYYRDQFDAMIKEARGNRKAIRSYLNEGLSDIAKPGYYGPKGTRIMVHAITELLSKNLIQVSQTDPSMQATGVGAYVSAVLVPELTMLLVMEDMKLRTGKDGRRVLDESSDIGILLNPDDDRVKRVRRRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.16
4	0.15
5	0.15
6	0.21
7	0.23
8	0.27
9	0.31
10	0.36
11	0.38
12	0.39
13	0.43
14	0.39
15	0.41
16	0.4
17	0.38
18	0.35
19	0.34
20	0.35
21	0.35
22	0.33
23	0.34
24	0.33
25	0.34
26	0.36
27	0.37
28	0.41
29	0.42
30	0.41
31	0.37
32	0.39
33	0.36
34	0.32
35	0.27
36	0.21
37	0.19
38	0.2
39	0.2
40	0.19
41	0.19
42	0.21
43	0.21
44	0.21
45	0.18
46	0.19
47	0.18
48	0.15
49	0.13
50	0.12
51	0.11
52	0.11
53	0.12
54	0.11
55	0.13
56	0.15
57	0.18
58	0.2
59	0.2
60	0.2
61	0.19
62	0.18
63	0.15
64	0.14
65	0.11
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.09
70	0.12
71	0.15
72	0.14
73	0.15
74	0.17
75	0.23
76	0.27
77	0.29
78	0.33
79	0.4
80	0.42
81	0.49
82	0.57
83	0.6
84	0.64
85	0.69
86	0.66
87	0.62
88	0.63
89	0.57
90	0.54
91	0.44
92	0.38
93	0.33
94	0.34
95	0.32
96	0.35
97	0.4
98	0.4
99	0.41
100	0.42
101	0.44
102	0.47
103	0.54
104	0.56
105	0.58
106	0.56
107	0.58
108	0.58
109	0.52
110	0.46
111	0.36
112	0.27
113	0.22
114	0.22
115	0.23
116	0.24
117	0.28
118	0.3
119	0.34
120	0.34
121	0.3
122	0.27
123	0.26
124	0.25
125	0.21
126	0.21
127	0.16
128	0.18
129	0.26
130	0.35
131	0.36
132	0.4
133	0.5
134	0.57
135	0.66
136	0.72
137	0.75
138	0.77
139	0.81
140	0.85
141	0.86
142	0.86
143	0.82
144	0.81
145	0.78
146	0.71
147	0.63
148	0.54
149	0.46
150	0.38
151	0.33
152	0.27
153	0.19
154	0.16
155	0.13
156	0.12
157	0.1
158	0.08
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.12
174	0.16
175	0.16
176	0.16
177	0.16
178	0.16
179	0.15
180	0.13
181	0.12
182	0.08
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.06
190	0.07
191	0.06
192	0.07
193	0.08
194	0.12
195	0.14
196	0.17
197	0.21
198	0.21
199	0.22
200	0.23
201	0.28
202	0.31
203	0.36
204	0.34
205	0.33
206	0.36
207	0.37
208	0.4
209	0.36
210	0.32
211	0.3
212	0.34
213	0.34
214	0.32
215	0.32
216	0.28
217	0.28
218	0.25
219	0.2
220	0.18
221	0.17
222	0.16
223	0.14
224	0.13
225	0.12
226	0.12
227	0.11
228	0.07
229	0.06
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.06
239	0.07
240	0.1
241	0.17
242	0.2
243	0.26
244	0.27
245	0.32
246	0.36
247	0.4
248	0.43
249	0.46
250	0.49
251	0.48
252	0.51
253	0.49
254	0.46
255	0.42
256	0.35
257	0.26
258	0.2
259	0.15
260	0.1
261	0.07
262	0.07
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.12
285	0.12
286	0.15
287	0.16
288	0.16
289	0.21
290	0.22
291	0.21
292	0.2
293	0.18
294	0.2
295	0.24
296	0.24
297	0.2
298	0.18
299	0.18
300	0.17
301	0.17
302	0.12
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.1
308	0.11
309	0.12
310	0.14
311	0.22
312	0.28
313	0.37
314	0.42
315	0.48
316	0.51
317	0.55
318	0.57
319	0.5
320	0.54
321	0.51
322	0.48
323	0.51
324	0.57
325	0.53
326	0.58
327	0.64
328	0.63
329	0.64
330	0.65
331	0.62
332	0.63
333	0.65
334	0.61
335	0.6
336	0.54
337	0.47
338	0.46
339	0.41
340	0.31
341	0.27
342	0.27
343	0.24
344	0.2
345	0.23
346	0.21
347	0.22
348	0.22
349	0.25
350	0.22
351	0.23
352	0.34
353	0.41
354	0.47
355	0.54
356	0.63
357	0.68
358	0.75
359	0.79
360	0.78
361	0.76
362	0.76
363	0.74
364	0.69
365	0.66
366	0.63
367	0.63
368	0.6
369	0.57
370	0.52
371	0.48
372	0.44
373	0.45
374	0.43
375	0.35
376	0.32
377	0.26
378	0.28
379	0.31
380	0.37
381	0.35
382	0.36
383	0.38
384	0.43
385	0.47
386	0.46
387	0.48
388	0.45
389	0.48
390	0.51
391	0.48
392	0.4
393	0.37
394	0.34
395	0.28
396	0.22
397	0.17
398	0.11
399	0.08
400	0.09
401	0.11
402	0.16
403	0.17
404	0.21
405	0.23
406	0.31
407	0.33
408	0.34
409	0.34
410	0.3
411	0.34
412	0.32
413	0.31
414	0.23
415	0.21
416	0.2
417	0.19
418	0.16
419	0.12
420	0.1
421	0.09
422	0.1
423	0.12
424	0.12
425	0.1
426	0.12
427	0.16
428	0.19
429	0.2
430	0.19
431	0.18
432	0.2
433	0.2
434	0.18
435	0.14
436	0.11
437	0.11
438	0.1
439	0.09
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.08
459	0.08
460	0.11
461	0.13
462	0.13
463	0.2
464	0.27
465	0.33
466	0.41
467	0.48
468	0.48
469	0.54
470	0.56
471	0.52
472	0.5
473	0.45
474	0.37
475	0.31
476	0.28
477	0.21
478	0.19
479	0.17
480	0.12
481	0.11
482	0.11
483	0.09
484	0.11
485	0.15
486	0.16
487	0.2
488	0.28
489	0.37

A0A178ZVJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer