Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZUG4

Protein Details
Accession A0A178ZUG4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
367-394ANDPKKLATRKCPKKKESKKPKVIGGMQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-388KKLATRKCPKKKESKKPK
420-440KSPRRRAGANISAPRRSKPKS
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 6.5, cyto_mito 6.5, pero 6, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
Amino Acid Sequences MSKGLISLFQFPTHVAPGEAEAECAMLQREGVVDAVMTQDVDALMFGSGLTLRDWSKEANGKKGNKTPTHVSVLDLPRVKNMCGLDPEGMILVALLSGGDYDEDGVAGIGCKLACEIARAGFGSDLVELVRNGDEDGITEWRERLQFELETNESGYFKMKRKSVRIPDSFPNRKILGYYMNPAVTPVSEMERLERKWAKTWDEEIDVQALRDYAADMFEWLYKPGAWKFVRVMAPALLADGLRRDRATSHLTSVDQITEQRQHFVSDGIPELRVTVVPAKVVGLNLDAEEDSPTYLQLLAEEENEGAEGETEHAEIDENAPLSPSKKRKSPAWLPDAPEKMWIAQTIVEIGAREHVEQWKRIQFENANDPKKLATRKCPKKKESKKPKVIGGMQPGALLSYVVPADQSTELEVSIAVPIKSPRRRAGANISAPRRSKPKSSKLEEGYPPTMLGFFKSTKGSQPSHSTMPARDAASYDLVKPGAGNDDDPLTLSNESRGDKHPRPSTSSPPETGQRIGLHWIKAENFGNWDTGREAIRQPNERNDANHLFAKPGRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.21
6 0.2
7 0.17
8 0.14
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.09
39 0.1
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.21
44 0.28
45 0.32
46 0.39
47 0.48
48 0.53
49 0.6
50 0.66
51 0.68
52 0.66
53 0.68
54 0.65
55 0.63
56 0.63
57 0.55
58 0.5
59 0.49
60 0.48
61 0.49
62 0.45
63 0.39
64 0.39
65 0.4
66 0.38
67 0.34
68 0.31
69 0.28
70 0.28
71 0.3
72 0.25
73 0.23
74 0.23
75 0.19
76 0.17
77 0.12
78 0.08
79 0.05
80 0.04
81 0.03
82 0.03
83 0.02
84 0.02
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.07
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.17
141 0.15
142 0.18
143 0.18
144 0.22
145 0.27
146 0.31
147 0.37
148 0.44
149 0.54
150 0.61
151 0.66
152 0.67
153 0.67
154 0.71
155 0.74
156 0.74
157 0.66
158 0.6
159 0.51
160 0.45
161 0.4
162 0.34
163 0.3
164 0.25
165 0.26
166 0.24
167 0.23
168 0.23
169 0.22
170 0.2
171 0.13
172 0.12
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.14
178 0.2
179 0.2
180 0.27
181 0.31
182 0.3
183 0.35
184 0.4
185 0.41
186 0.39
187 0.43
188 0.38
189 0.37
190 0.36
191 0.29
192 0.28
193 0.23
194 0.19
195 0.16
196 0.12
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.11
212 0.19
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.26
217 0.28
218 0.26
219 0.27
220 0.19
221 0.19
222 0.17
223 0.16
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.13
234 0.18
235 0.16
236 0.18
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.16
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.15
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.09
310 0.16
311 0.22
312 0.25
313 0.3
314 0.34
315 0.39
316 0.48
317 0.57
318 0.59
319 0.6
320 0.61
321 0.59
322 0.63
323 0.6
324 0.51
325 0.43
326 0.34
327 0.26
328 0.23
329 0.19
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.16
343 0.18
344 0.2
345 0.25
346 0.27
347 0.29
348 0.29
349 0.33
350 0.31
351 0.33
352 0.42
353 0.46
354 0.45
355 0.43
356 0.43
357 0.38
358 0.4
359 0.43
360 0.37
361 0.39
362 0.46
363 0.58
364 0.68
365 0.77
366 0.79
367 0.83
368 0.89
369 0.9
370 0.91
371 0.91
372 0.91
373 0.87
374 0.86
375 0.83
376 0.79
377 0.74
378 0.7
379 0.62
380 0.51
381 0.45
382 0.38
383 0.29
384 0.22
385 0.15
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.06
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.13
406 0.22
407 0.28
408 0.33
409 0.37
410 0.41
411 0.43
412 0.47
413 0.54
414 0.55
415 0.58
416 0.61
417 0.61
418 0.62
419 0.61
420 0.59
421 0.57
422 0.51
423 0.52
424 0.54
425 0.6
426 0.63
427 0.69
428 0.75
429 0.73
430 0.78
431 0.73
432 0.71
433 0.62
434 0.52
435 0.46
436 0.36
437 0.32
438 0.23
439 0.19
440 0.15
441 0.14
442 0.17
443 0.2
444 0.21
445 0.26
446 0.32
447 0.33
448 0.35
449 0.41
450 0.44
451 0.44
452 0.49
453 0.45
454 0.4
455 0.42
456 0.41
457 0.34
458 0.3
459 0.26
460 0.23
461 0.25
462 0.25
463 0.21
464 0.19
465 0.18
466 0.18
467 0.16
468 0.15
469 0.16
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.15
474 0.15
475 0.16
476 0.16
477 0.13
478 0.13
479 0.13
480 0.15
481 0.17
482 0.19
483 0.22
484 0.27
485 0.34
486 0.4
487 0.49
488 0.54
489 0.54
490 0.61
491 0.64
492 0.68
493 0.69
494 0.69
495 0.63
496 0.59
497 0.6
498 0.55
499 0.51
500 0.46
501 0.37
502 0.33
503 0.37
504 0.37
505 0.33
506 0.31
507 0.33
508 0.29
509 0.34
510 0.34
511 0.29
512 0.28
513 0.27
514 0.3
515 0.26
516 0.27
517 0.22
518 0.23
519 0.23
520 0.22
521 0.26
522 0.3
523 0.39
524 0.45
525 0.49
526 0.56
527 0.61
528 0.61
529 0.59
530 0.59
531 0.56
532 0.52
533 0.53
534 0.43
535 0.41