Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9D1X7

Protein Details
Accession J9D1X7    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
478-504EHCLNAIKKIRKKRSLIKNVKKSENSTHydrophilic
584-611KENSLKPKKKFFFLQQTVKRRRKKNHFRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
485-496KKIRKKRSLIKN
590-593PKKK
601-611VKRRRKKNHFR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026854  VPS13-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF12624  Chorein_N  
Amino Acid Sequences MLITDYKLDIGNGEKMLNPSLLKNKMKTLILNKLKKIIASHIEGIDINKLEVGILSGTLKFENCRLTINKQLVMHFFKLSGLHLHYAEASKIVVEFNALQFFTSPITLYADGLNVFVSNGQDLCKNSNFVDMLGESIRQSCIEIEKVKGESFFDDWYEKIIFRGSKIQFVFVDSPFPIDTNLQKDFIDEVFDKKCCDGSTAIDFDEKCGVNGINCGGNDDGSEFRVNSLSPGKTLDSRENSEYVNGVNVKEKERYNFYENRNFYSDVSLNKYLNVNMDLEVGNQKVNVKDQKSEESKNSNKIGVNCEEKKYSDDDNSKDEHLCVDNIKAATKKNLCDLIKDRYTLFVDKITSSNEIISSKRSKLYKIEGLSFLRNNKYIISPQDIHIHLMNEKDSALQINLSTDTFSTHITENSIHLILNLCKYFKNKEKLLKKIKFDLENVVNSVEFFQCMMKSEEKNISWDDICDLAKNNRQDFVEHCLNAIKKIRKKRSLIKNVKKSENSTIEDKFTVNNNKNSENKNFLSFEDKSTEEIAEKLLTIEKYRKLYKRFTESSLSVAEQKEIESLESKLAVKEINFHRKEVIKENSLKPKKKFFFLQQTVKRRRKKNHFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.24
4 0.25
5 0.22
6 0.23
7 0.3
8 0.39
9 0.42
10 0.43
11 0.47
12 0.51
13 0.53
14 0.55
15 0.55
16 0.57
17 0.61
18 0.67
19 0.63
20 0.64
21 0.62
22 0.57
23 0.51
24 0.49
25 0.44
26 0.42
27 0.43
28 0.36
29 0.37
30 0.35
31 0.33
32 0.3
33 0.24
34 0.18
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.11
48 0.14
49 0.18
50 0.18
51 0.23
52 0.27
53 0.32
54 0.4
55 0.43
56 0.45
57 0.43
58 0.46
59 0.46
60 0.48
61 0.44
62 0.36
63 0.32
64 0.28
65 0.27
66 0.25
67 0.23
68 0.2
69 0.21
70 0.2
71 0.2
72 0.21
73 0.21
74 0.2
75 0.16
76 0.13
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.11
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.08
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.17
111 0.18
112 0.2
113 0.2
114 0.24
115 0.24
116 0.21
117 0.22
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.16
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.12
129 0.16
130 0.18
131 0.19
132 0.22
133 0.24
134 0.24
135 0.23
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.16
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.17
145 0.15
146 0.14
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.26
151 0.24
152 0.3
153 0.3
154 0.33
155 0.28
156 0.32
157 0.33
158 0.24
159 0.26
160 0.19
161 0.21
162 0.18
163 0.18
164 0.14
165 0.13
166 0.16
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.18
171 0.19
172 0.2
173 0.18
174 0.19
175 0.15
176 0.17
177 0.19
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.2
182 0.16
183 0.18
184 0.15
185 0.16
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.22
190 0.21
191 0.2
192 0.24
193 0.2
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.15
219 0.16
220 0.19
221 0.21
222 0.26
223 0.26
224 0.29
225 0.3
226 0.3
227 0.28
228 0.26
229 0.23
230 0.16
231 0.15
232 0.13
233 0.11
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.27
241 0.31
242 0.32
243 0.38
244 0.41
245 0.46
246 0.46
247 0.47
248 0.45
249 0.41
250 0.36
251 0.33
252 0.3
253 0.23
254 0.28
255 0.26
256 0.23
257 0.23
258 0.24
259 0.19
260 0.19
261 0.18
262 0.12
263 0.1
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.13
274 0.17
275 0.17
276 0.21
277 0.23
278 0.3
279 0.34
280 0.36
281 0.36
282 0.39
283 0.41
284 0.43
285 0.43
286 0.38
287 0.36
288 0.35
289 0.35
290 0.31
291 0.34
292 0.3
293 0.31
294 0.29
295 0.27
296 0.27
297 0.25
298 0.23
299 0.23
300 0.26
301 0.26
302 0.27
303 0.29
304 0.28
305 0.26
306 0.23
307 0.18
308 0.15
309 0.13
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.19
318 0.21
319 0.22
320 0.23
321 0.3
322 0.29
323 0.32
324 0.35
325 0.36
326 0.35
327 0.35
328 0.32
329 0.27
330 0.29
331 0.25
332 0.22
333 0.17
334 0.16
335 0.16
336 0.17
337 0.15
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.12
342 0.13
343 0.12
344 0.16
345 0.18
346 0.18
347 0.23
348 0.23
349 0.24
350 0.28
351 0.34
352 0.36
353 0.35
354 0.37
355 0.36
356 0.38
357 0.39
358 0.37
359 0.34
360 0.3
361 0.28
362 0.25
363 0.21
364 0.21
365 0.21
366 0.21
367 0.24
368 0.23
369 0.24
370 0.3
371 0.29
372 0.29
373 0.27
374 0.25
375 0.2
376 0.2
377 0.18
378 0.12
379 0.12
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.12
400 0.13
401 0.13
402 0.11
403 0.1
404 0.13
405 0.13
406 0.16
407 0.16
408 0.14
409 0.16
410 0.19
411 0.26
412 0.32
413 0.38
414 0.41
415 0.5
416 0.58
417 0.67
418 0.75
419 0.75
420 0.72
421 0.73
422 0.73
423 0.67
424 0.6
425 0.58
426 0.52
427 0.47
428 0.43
429 0.34
430 0.27
431 0.23
432 0.23
433 0.15
434 0.1
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.1
439 0.14
440 0.17
441 0.18
442 0.23
443 0.29
444 0.29
445 0.32
446 0.31
447 0.3
448 0.26
449 0.25
450 0.22
451 0.18
452 0.18
453 0.16
454 0.18
455 0.2
456 0.25
457 0.31
458 0.3
459 0.31
460 0.32
461 0.32
462 0.32
463 0.35
464 0.36
465 0.31
466 0.3
467 0.31
468 0.31
469 0.34
470 0.4
471 0.41
472 0.41
473 0.52
474 0.62
475 0.66
476 0.74
477 0.79
478 0.82
479 0.84
480 0.88
481 0.88
482 0.88
483 0.88
484 0.89
485 0.84
486 0.77
487 0.75
488 0.71
489 0.64
490 0.59
491 0.53
492 0.47
493 0.44
494 0.39
495 0.32
496 0.32
497 0.38
498 0.38
499 0.42
500 0.43
501 0.49
502 0.55
503 0.58
504 0.57
505 0.54
506 0.49
507 0.48
508 0.46
509 0.41
510 0.41
511 0.37
512 0.34
513 0.31
514 0.3
515 0.27
516 0.27
517 0.26
518 0.2
519 0.19
520 0.17
521 0.14
522 0.13
523 0.12
524 0.15
525 0.15
526 0.18
527 0.24
528 0.28
529 0.34
530 0.43
531 0.5
532 0.52
533 0.6
534 0.66
535 0.7
536 0.69
537 0.67
538 0.66
539 0.59
540 0.57
541 0.5
542 0.43
543 0.37
544 0.33
545 0.3
546 0.22
547 0.22
548 0.2
549 0.17
550 0.17
551 0.14
552 0.15
553 0.15
554 0.18
555 0.18
556 0.17
557 0.17
558 0.18
559 0.16
560 0.24
561 0.32
562 0.4
563 0.41
564 0.41
565 0.46
566 0.5
567 0.54
568 0.55
569 0.53
570 0.51
571 0.58
572 0.65
573 0.7
574 0.75
575 0.78
576 0.75
577 0.79
578 0.75
579 0.75
580 0.75
581 0.74
582 0.76
583 0.77
584 0.82
585 0.81
586 0.86
587 0.9
588 0.91
589 0.89
590 0.88
591 0.89