Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZQH6

Protein Details
Accession A0A178ZQH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-413QREKRMKDLLRRIKEIKKPFNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-426KRMKDLLRRIKEIKKPFNVKALLRRKDKPKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, cyto 6, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYAIETKKRKFDRILEALTDGAASTPPASPSHSSINASTTSLSLYAASDSSKRRRITPTRAIASHTSAPVTLSGQYLPSSRAAFLQRLETFRHVTQWHVPSTDPINAAAWAKRGWTCVDTDTVACGVCKERLYIDLNVDKELLKSSEKEGDKGADEDVAADEEDSFAISFEIYDKIVKTYQGMIVTAHAESCLWRKRGCDASIQRIEGLLNTASALSSLRARYVSLASHLDEIPQVEPLPLASVENPHELEQFRLGGQERPHFDTLRLAVCGWERKCDDVIECRHCFRSLGLWLYRGESPAIEKLDAIDNHLEYCPWRSAEAQDTEIPTGHSKTTTGEEIVPKKERVPGWVLVYQAITKDNKQRRGSTTTPSTAVSETVASEHGTESTTPEQREKRMKDLLRRIKEIKKPFNVKALLRRKDKPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.72
3 0.64
4 0.6
5 0.53
6 0.44
7 0.35
8 0.24
9 0.15
10 0.1
11 0.07
12 0.07
13 0.09
14 0.11
15 0.12
16 0.16
17 0.18
18 0.22
19 0.29
20 0.31
21 0.32
22 0.32
23 0.33
24 0.31
25 0.29
26 0.26
27 0.19
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.11
36 0.15
37 0.21
38 0.29
39 0.36
40 0.38
41 0.42
42 0.52
43 0.6
44 0.65
45 0.69
46 0.71
47 0.71
48 0.7
49 0.69
50 0.62
51 0.58
52 0.52
53 0.43
54 0.33
55 0.26
56 0.25
57 0.22
58 0.2
59 0.15
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.19
70 0.21
71 0.22
72 0.22
73 0.29
74 0.29
75 0.3
76 0.33
77 0.33
78 0.34
79 0.32
80 0.36
81 0.29
82 0.29
83 0.35
84 0.36
85 0.35
86 0.32
87 0.32
88 0.29
89 0.32
90 0.32
91 0.25
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.21
96 0.18
97 0.17
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.17
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.16
110 0.14
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.15
120 0.2
121 0.2
122 0.24
123 0.26
124 0.26
125 0.26
126 0.25
127 0.22
128 0.18
129 0.18
130 0.14
131 0.11
132 0.12
133 0.14
134 0.21
135 0.22
136 0.22
137 0.22
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.2
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.11
175 0.09
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.11
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.24
185 0.31
186 0.31
187 0.36
188 0.34
189 0.42
190 0.45
191 0.44
192 0.39
193 0.33
194 0.31
195 0.22
196 0.19
197 0.1
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.12
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.1
242 0.12
243 0.12
244 0.15
245 0.17
246 0.22
247 0.23
248 0.28
249 0.3
250 0.28
251 0.27
252 0.27
253 0.27
254 0.23
255 0.21
256 0.16
257 0.16
258 0.18
259 0.25
260 0.21
261 0.24
262 0.23
263 0.24
264 0.25
265 0.25
266 0.25
267 0.26
268 0.33
269 0.35
270 0.36
271 0.37
272 0.37
273 0.36
274 0.35
275 0.28
276 0.26
277 0.23
278 0.27
279 0.26
280 0.27
281 0.27
282 0.29
283 0.29
284 0.23
285 0.19
286 0.13
287 0.14
288 0.16
289 0.17
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.21
294 0.2
295 0.21
296 0.19
297 0.17
298 0.19
299 0.19
300 0.18
301 0.12
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.18
308 0.25
309 0.27
310 0.27
311 0.27
312 0.28
313 0.27
314 0.27
315 0.25
316 0.2
317 0.18
318 0.16
319 0.14
320 0.13
321 0.14
322 0.17
323 0.18
324 0.18
325 0.2
326 0.26
327 0.3
328 0.36
329 0.38
330 0.36
331 0.35
332 0.4
333 0.37
334 0.35
335 0.35
336 0.34
337 0.35
338 0.37
339 0.36
340 0.31
341 0.31
342 0.26
343 0.22
344 0.22
345 0.18
346 0.21
347 0.3
348 0.37
349 0.46
350 0.51
351 0.57
352 0.59
353 0.65
354 0.64
355 0.63
356 0.63
357 0.57
358 0.54
359 0.48
360 0.44
361 0.37
362 0.33
363 0.25
364 0.17
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.14
375 0.2
376 0.25
377 0.26
378 0.34
379 0.38
380 0.45
381 0.56
382 0.56
383 0.57
384 0.62
385 0.68
386 0.7
387 0.77
388 0.79
389 0.77
390 0.8
391 0.79
392 0.79
393 0.81
394 0.81
395 0.8
396 0.8
397 0.8
398 0.77
399 0.79
400 0.76
401 0.74
402 0.74
403 0.74
404 0.73
405 0.73
406 0.77