Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZX08

Protein Details
Accession A0A178ZX08    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-420AAEEARRQKRAKRRAAKKDEAGATHydrophilic
436-455LDADKRTTKKEKKLAESRFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-414ARRQKRAKRRAAKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAHSPPAPSRPPLPQTQTSFPRNFSSANGRPSPLGPQSPPLAMNFSSPPPQAFSPQQYFQPPAAKRPRLSPDVQSPSTAPSYPPTPTAQATTPSGNTPMNGSAVSSTRQGLMPPPQRPPDKAEDRNYEDILVGTGINIEEEARMLVQNDYFGGSTPRTATSGSFEYQNNSFPRPGSSGGATASQEEPGEGLTQEHQPSEEEMKERIEARADWEASRYSQYPLWDMFLLGGALNEKIRNISITEHLVDPQSGVLVNTQKHMPPPMVRVNGLEGASRVIDKGQAILDTGQKGERLSDIMKVISLATRARMTGLLSASSRLAKERRQHSAGKVPEEWQDIAVQAKPATDVPDGAASPAASSSLKRTHSQAESESSFRHDQIPGPIRLISTFERVSQAERAAEEARRQKRAKRRAAKKDEAGATATETTITPEAAPVANLDADKRTTKKEKKLAESRFSEQQQHRSANEAARMAVAGLFGSRLGGKKSRTYDWMNAGKGGASPAAIPGRPPPSSAPSTAGTPAPDRARTTPKEKQLGQWDEDKDAQIQARDVLLVLESDGRASRSYVRGLSLPEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.61
3 0.66
4 0.7
5 0.69
6 0.68
7 0.62
8 0.59
9 0.53
10 0.47
11 0.43
12 0.44
13 0.43
14 0.47
15 0.48
16 0.44
17 0.43
18 0.43
19 0.46
20 0.42
21 0.4
22 0.34
23 0.35
24 0.37
25 0.38
26 0.38
27 0.32
28 0.3
29 0.25
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.27
35 0.27
36 0.27
37 0.28
38 0.3
39 0.33
40 0.38
41 0.4
42 0.41
43 0.45
44 0.45
45 0.47
46 0.46
47 0.49
48 0.42
49 0.46
50 0.54
51 0.56
52 0.53
53 0.58
54 0.62
55 0.59
56 0.61
57 0.59
58 0.59
59 0.61
60 0.6
61 0.53
62 0.46
63 0.44
64 0.43
65 0.36
66 0.26
67 0.21
68 0.23
69 0.23
70 0.25
71 0.24
72 0.25
73 0.25
74 0.28
75 0.27
76 0.27
77 0.29
78 0.29
79 0.27
80 0.25
81 0.27
82 0.24
83 0.22
84 0.2
85 0.19
86 0.17
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.16
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.18
98 0.26
99 0.32
100 0.35
101 0.41
102 0.48
103 0.51
104 0.53
105 0.54
106 0.55
107 0.57
108 0.61
109 0.62
110 0.63
111 0.66
112 0.68
113 0.62
114 0.52
115 0.42
116 0.34
117 0.26
118 0.18
119 0.11
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.15
148 0.18
149 0.17
150 0.19
151 0.19
152 0.21
153 0.21
154 0.26
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.21
159 0.23
160 0.23
161 0.24
162 0.21
163 0.2
164 0.18
165 0.18
166 0.2
167 0.17
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.12
172 0.1
173 0.09
174 0.07
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.17
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.16
196 0.21
197 0.21
198 0.19
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.21
203 0.18
204 0.14
205 0.15
206 0.16
207 0.17
208 0.16
209 0.17
210 0.15
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.1
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.08
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.19
250 0.24
251 0.25
252 0.25
253 0.25
254 0.25
255 0.26
256 0.24
257 0.18
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.09
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.14
306 0.18
307 0.25
308 0.31
309 0.37
310 0.4
311 0.43
312 0.45
313 0.51
314 0.49
315 0.46
316 0.41
317 0.36
318 0.36
319 0.35
320 0.31
321 0.22
322 0.19
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.11
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.05
344 0.06
345 0.1
346 0.15
347 0.18
348 0.19
349 0.22
350 0.27
351 0.29
352 0.32
353 0.3
354 0.3
355 0.3
356 0.3
357 0.28
358 0.26
359 0.25
360 0.23
361 0.23
362 0.18
363 0.18
364 0.26
365 0.32
366 0.29
367 0.29
368 0.29
369 0.27
370 0.26
371 0.27
372 0.2
373 0.18
374 0.18
375 0.17
376 0.19
377 0.2
378 0.22
379 0.21
380 0.2
381 0.17
382 0.16
383 0.18
384 0.18
385 0.19
386 0.23
387 0.3
388 0.33
389 0.41
390 0.43
391 0.48
392 0.57
393 0.65
394 0.7
395 0.72
396 0.77
397 0.8
398 0.88
399 0.89
400 0.85
401 0.83
402 0.75
403 0.66
404 0.56
405 0.45
406 0.37
407 0.29
408 0.22
409 0.14
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.09
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.13
426 0.17
427 0.18
428 0.25
429 0.34
430 0.43
431 0.52
432 0.59
433 0.65
434 0.71
435 0.79
436 0.81
437 0.8
438 0.77
439 0.71
440 0.71
441 0.65
442 0.65
443 0.59
444 0.59
445 0.57
446 0.56
447 0.52
448 0.48
449 0.49
450 0.44
451 0.43
452 0.36
453 0.28
454 0.24
455 0.24
456 0.19
457 0.15
458 0.11
459 0.07
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.12
467 0.18
468 0.21
469 0.28
470 0.33
471 0.37
472 0.41
473 0.47
474 0.49
475 0.54
476 0.58
477 0.52
478 0.48
479 0.44
480 0.38
481 0.32
482 0.27
483 0.18
484 0.1
485 0.09
486 0.12
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.2
491 0.26
492 0.26
493 0.28
494 0.28
495 0.32
496 0.35
497 0.37
498 0.34
499 0.31
500 0.33
501 0.33
502 0.3
503 0.26
504 0.24
505 0.28
506 0.29
507 0.31
508 0.32
509 0.36
510 0.44
511 0.47
512 0.54
513 0.57
514 0.61
515 0.67
516 0.65
517 0.67
518 0.69
519 0.69
520 0.64
521 0.63
522 0.56
523 0.52
524 0.52
525 0.45
526 0.36
527 0.33
528 0.32
529 0.26
530 0.25
531 0.22
532 0.2
533 0.19
534 0.17
535 0.14
536 0.11
537 0.09
538 0.09
539 0.1
540 0.09
541 0.1
542 0.12
543 0.13
544 0.13
545 0.15
546 0.2
547 0.22
548 0.26
549 0.27
550 0.29
551 0.3