Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z3X6

Protein Details
Accession A0A178Z3X6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MARRKKQKTKHSSTGQELSQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MARRKKQKTKHSSTGQELSQAEIWDDSALIRSWNDALAEYEYYHSIHARGEDVEEILRKAEMGELDDDDDDDSNNGNNENETNINAGGHASAQWRPVHPEPPAEAAVSNGNENADVARDTRSESGELEDGECVSSQEDAHGSKPLDLEQKRRAAMDQFQSMLVEPEKQQERPPQSTLGQPSSTRTATTAVPLIGPSLPPATAGANGQATPTPSQDQTLENIKMAYYWAGYYSGLYDGQRQAQAQAQTEAQQGTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.72
3 0.68
4 0.58
5 0.51
6 0.43
7 0.34
8 0.27
9 0.2
10 0.2
11 0.13
12 0.13
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.12
22 0.1
23 0.12
24 0.13
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.19
83 0.21
84 0.24
85 0.24
86 0.26
87 0.24
88 0.27
89 0.27
90 0.22
91 0.19
92 0.16
93 0.17
94 0.14
95 0.12
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.14
132 0.21
133 0.22
134 0.27
135 0.3
136 0.34
137 0.34
138 0.34
139 0.33
140 0.28
141 0.32
142 0.32
143 0.28
144 0.24
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.2
149 0.15
150 0.11
151 0.09
152 0.15
153 0.18
154 0.19
155 0.23
156 0.29
157 0.36
158 0.38
159 0.4
160 0.38
161 0.36
162 0.41
163 0.42
164 0.38
165 0.34
166 0.3
167 0.31
168 0.32
169 0.31
170 0.25
171 0.21
172 0.19
173 0.17
174 0.19
175 0.18
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.13
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.18
201 0.19
202 0.19
203 0.21
204 0.28
205 0.26
206 0.24
207 0.24
208 0.21
209 0.2
210 0.19
211 0.16
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.17
223 0.18
224 0.23
225 0.25
226 0.24
227 0.25
228 0.29
229 0.32
230 0.31
231 0.3
232 0.28
233 0.28
234 0.3