Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z945

Protein Details
Accession A0A178Z945    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
412-434EERLRQLDKMKKEERERKMKGMSBasic
438-461QRKFLERENEKMRKKQEKKMTRRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-461KLKKISDKEAEEERLRQLDKMKKEERERKMKGMSAEEQRKFLERENEKMRKKQEKKMTRRG
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11.5, nucl 9, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MDIFKAFLGQKPSQAPIVADDADFADFAAAPAPSPASIPASPADAQAATATGAAVEGRPVVYTKWYRVWERTQLSDFMMEGVLVPFILLALLVHFWGTRTNRRKAKKWMAVHAPVLEREFAVVGYSAVPNTESTGEGGVSPVDASFFKQIVQNKGDSISDDLLKEKAAWEYESYATGRQNVAFMDVKIYLKRRMNPFMMLAEEITGMFIESIKPKPERMEAVIYTFDGKEKEFVPPAVPGSEEAGKAKSVGNSTYDPFVFAVVNKLAMRKLREERYDLSLTFTKDHAKLPDWATCMSESAEISDWMLTKELIDALHQAGPDYFQYLIITDQPQDKPSNLNETVPKKRLHISLRLPSDGNYLPTLPLFAVFLRLPDYLVSQSHLRPEVLRKINTIREQEKSKLKKISDKEAEEERLRQLDKMKKEERERKMKGMSAEEQRKFLERENEKMRKKQEKKMTRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.32
3 0.27
4 0.3
5 0.26
6 0.21
7 0.19
8 0.18
9 0.17
10 0.16
11 0.12
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.11
23 0.14
24 0.14
25 0.16
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.19
30 0.2
31 0.14
32 0.15
33 0.13
34 0.13
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.16
49 0.2
50 0.24
51 0.31
52 0.36
53 0.4
54 0.46
55 0.52
56 0.54
57 0.55
58 0.57
59 0.52
60 0.49
61 0.45
62 0.4
63 0.33
64 0.24
65 0.2
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.03
76 0.02
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.11
84 0.16
85 0.25
86 0.33
87 0.43
88 0.51
89 0.59
90 0.67
91 0.72
92 0.79
93 0.79
94 0.78
95 0.78
96 0.79
97 0.76
98 0.71
99 0.64
100 0.55
101 0.47
102 0.41
103 0.32
104 0.22
105 0.17
106 0.14
107 0.1
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.14
136 0.19
137 0.24
138 0.26
139 0.25
140 0.23
141 0.25
142 0.24
143 0.21
144 0.2
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.11
168 0.14
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.16
175 0.19
176 0.22
177 0.25
178 0.3
179 0.34
180 0.38
181 0.39
182 0.39
183 0.38
184 0.32
185 0.29
186 0.24
187 0.18
188 0.13
189 0.11
190 0.09
191 0.07
192 0.05
193 0.04
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.07
198 0.08
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.19
204 0.2
205 0.21
206 0.25
207 0.22
208 0.23
209 0.22
210 0.2
211 0.19
212 0.16
213 0.14
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.1
247 0.08
248 0.1
249 0.08
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.17
256 0.2
257 0.27
258 0.32
259 0.34
260 0.38
261 0.38
262 0.42
263 0.42
264 0.36
265 0.34
266 0.31
267 0.29
268 0.26
269 0.24
270 0.22
271 0.21
272 0.23
273 0.22
274 0.2
275 0.24
276 0.25
277 0.29
278 0.27
279 0.26
280 0.25
281 0.22
282 0.21
283 0.17
284 0.15
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.17
318 0.17
319 0.2
320 0.21
321 0.21
322 0.23
323 0.24
324 0.31
325 0.27
326 0.3
327 0.34
328 0.41
329 0.48
330 0.49
331 0.48
332 0.42
333 0.47
334 0.5
335 0.48
336 0.5
337 0.51
338 0.54
339 0.58
340 0.57
341 0.52
342 0.46
343 0.45
344 0.37
345 0.31
346 0.23
347 0.19
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.07
355 0.11
356 0.1
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.16
366 0.16
367 0.18
368 0.22
369 0.24
370 0.22
371 0.24
372 0.3
373 0.37
374 0.42
375 0.42
376 0.42
377 0.46
378 0.54
379 0.57
380 0.59
381 0.53
382 0.52
383 0.56
384 0.59
385 0.63
386 0.62
387 0.63
388 0.63
389 0.62
390 0.65
391 0.65
392 0.69
393 0.68
394 0.66
395 0.63
396 0.63
397 0.65
398 0.59
399 0.56
400 0.49
401 0.46
402 0.42
403 0.39
404 0.4
405 0.42
406 0.47
407 0.54
408 0.58
409 0.61
410 0.71
411 0.79
412 0.8
413 0.83
414 0.81
415 0.8
416 0.79
417 0.75
418 0.7
419 0.67
420 0.65
421 0.64
422 0.68
423 0.62
424 0.58
425 0.55
426 0.54
427 0.49
428 0.48
429 0.48
430 0.42
431 0.5
432 0.57
433 0.66
434 0.68
435 0.74
436 0.77
437 0.78
438 0.81
439 0.82
440 0.82
441 0.83