FuNGI

A0A178Z3T2

Protein Details

Accession

A0A178Z3T2

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
879-898	LDPKERKKALRTAARLQRRL	Hydrophilic
964-985	GAYGTRQAEKKSKKGPKRRAGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
971-984	AEKKSKKGPKRRAG

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MADARRSGRHVHETRLLSYGHLGTAAYDDRNHKWTFLRQHQTQQGHDVQRTQASWTGSSHFLLVDERTWNSTPDSTQALRTVQDGRPSRGLQNFFLKRVADAAFVAVEFPVSLNTVTSWPKHRHSENVVAFAYARRPSDSSLHNNIPYTPIIAVRSCSSSDILLLFVIEARQVAIPNEEGLSDLYKVPAISNQLSGTWADSTDGILQVASSSHAKGTQILVVKPSGTTILRPMLSKSKALGELLDPCPVVTIPRSRTGTQPHAHATFNPHDQSLVALVDTGGQWSIWRLTGRKSRSARILHRVSLQASNNLGRIEQQSRSSKVSTYRNMWHRVCWFTNPEGVMDRLLVCNRRFAATFDRTGLYLGEVDMRLGPLSDRHLILDVKNSSRRSDRVFVLTTSRFLIFGSPPGSDDDRGASEALELVCSWSHYRDHTDLSLRMSVLEFSEDSWILLYSTIGHLAILYRFGQEDVHSTTISMQDPSTFQLPQQLKERMTDVSDITMCPVAFSTQSQPAGTIRFGLMKLVACLETGEIIEALYKHELGLFGRSNQVPETVSHLSIPRALDNNPISAKYVTDEDLDDFVVPDDEAIGDYARETDSAQPASENPQSGSPSSRDWQRLLQYEPFKENNDDSMSFGSALRQVTDRLLNGPKGENKKVPLHLMSDLAERCRITDVEHDSQIADQWFDALALEASTSVAPVAGNVGGVPMFPRRNLLLDLYEGSVRTYVESLSDQVTDRSRVNRERLVRQIVGDVFFGAFTSAFETAAAPLSASPRPNWTSTQASQAASPSIGLDSDDPESSQAPTPEALPETEEAAFTRLRRYVTFRDEEPALLLKNPQNSSNILAHLPNSIEEDPADYSYQQTNQKLKLAQEEMAAESLDPKERKKALRTAARLQRRLEKTQLMSQEVMMRRNLLPGISSGPKTSGLSTREVQSSQPAVPSSSQTIGQGQGRIPEFSMTQPERGAYGTRQAEKKSKKGPKRRAGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.53
3	0.45
4	0.36
5	0.36
6	0.3
7	0.21
8	0.18
9	0.16
10	0.12
11	0.16
12	0.17
13	0.14
14	0.17
15	0.22
16	0.25
17	0.31
18	0.31
19	0.3
20	0.33
21	0.41
22	0.47
23	0.54
24	0.59
25	0.59
26	0.68
27	0.75
28	0.76
29	0.7
30	0.67
31	0.65
32	0.62
33	0.6
34	0.54
35	0.48
36	0.47
37	0.44
38	0.4
39	0.35
40	0.31
41	0.3
42	0.28
43	0.29
44	0.26
45	0.26
46	0.23
47	0.19
48	0.17
49	0.17
50	0.17
51	0.16
52	0.17
53	0.18
54	0.22
55	0.23
56	0.23
57	0.24
58	0.25
59	0.24
60	0.24
61	0.29
62	0.26
63	0.28
64	0.3
65	0.28
66	0.26
67	0.28
68	0.3
69	0.27
70	0.35
71	0.37
72	0.39
73	0.44
74	0.46
75	0.49
76	0.5
77	0.51
78	0.47
79	0.53
80	0.52
81	0.47
82	0.49
83	0.43
84	0.36
85	0.36
86	0.32
87	0.23
88	0.19
89	0.17
90	0.14
91	0.13
92	0.13
93	0.09
94	0.08
95	0.06
96	0.06
97	0.05
98	0.06
99	0.06
100	0.07
101	0.08
102	0.12
103	0.15
104	0.18
105	0.25
106	0.3
107	0.37
108	0.44
109	0.47
110	0.52
111	0.56
112	0.63
113	0.6
114	0.61
115	0.55
116	0.47
117	0.44
118	0.37
119	0.35
120	0.27
121	0.24
122	0.2
123	0.21
124	0.24
125	0.29
126	0.34
127	0.38
128	0.42
129	0.46
130	0.46
131	0.46
132	0.43
133	0.4
134	0.34
135	0.28
136	0.2
137	0.17
138	0.17
139	0.17
140	0.18
141	0.17
142	0.19
143	0.19
144	0.19
145	0.18
146	0.15
147	0.16
148	0.14
149	0.13
150	0.1
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.06
156	0.05
157	0.06
158	0.07
159	0.08
160	0.08
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.12
176	0.16
177	0.16
178	0.18
179	0.18
180	0.17
181	0.18
182	0.18
183	0.17
184	0.12
185	0.11
186	0.09
187	0.09
188	0.1
189	0.1
190	0.11
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.12
203	0.13
204	0.16
205	0.18
206	0.19
207	0.2
208	0.19
209	0.19
210	0.17
211	0.16
212	0.15
213	0.12
214	0.12
215	0.14
216	0.19
217	0.2
218	0.2
219	0.23
220	0.28
221	0.3
222	0.3
223	0.28
224	0.27
225	0.28
226	0.28
227	0.26
228	0.19
229	0.24
230	0.24
231	0.25
232	0.2
233	0.18
234	0.18
235	0.17
236	0.16
237	0.13
238	0.19
239	0.2
240	0.28
241	0.32
242	0.32
243	0.38
244	0.44
245	0.49
246	0.45
247	0.46
248	0.43
249	0.42
250	0.41
251	0.38
252	0.37
253	0.33
254	0.35
255	0.31
256	0.26
257	0.24
258	0.23
259	0.22
260	0.17
261	0.13
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.05
269	0.04
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.09
274	0.11
275	0.12
276	0.2
277	0.28
278	0.32
279	0.41
280	0.43
281	0.46
282	0.52
283	0.59
284	0.59
285	0.61
286	0.61
287	0.55
288	0.55
289	0.52
290	0.46
291	0.44
292	0.38
293	0.32
294	0.29
295	0.28
296	0.25
297	0.23
298	0.2
299	0.16
300	0.19
301	0.19
302	0.19
303	0.24
304	0.28
305	0.31
306	0.34
307	0.34
308	0.32
309	0.36
310	0.42
311	0.4
312	0.41
313	0.46
314	0.5
315	0.57
316	0.55
317	0.53
318	0.49
319	0.5
320	0.46
321	0.42
322	0.39
323	0.32
324	0.35
325	0.3
326	0.27
327	0.22
328	0.21
329	0.17
330	0.14
331	0.13
332	0.11
333	0.13
334	0.17
335	0.15
336	0.19
337	0.19
338	0.2
339	0.2
340	0.21
341	0.27
342	0.26
343	0.28
344	0.25
345	0.25
346	0.24
347	0.24
348	0.21
349	0.13
350	0.1
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.09
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.14
366	0.14
367	0.15
368	0.2
369	0.2
370	0.22
371	0.27
372	0.28
373	0.28
374	0.31
375	0.33
376	0.32
377	0.34
378	0.32
379	0.32
380	0.33
381	0.31
382	0.33
383	0.31
384	0.27
385	0.23
386	0.21
387	0.16
388	0.14
389	0.15
390	0.1
391	0.12
392	0.13
393	0.11
394	0.12
395	0.14
396	0.16
397	0.14
398	0.14
399	0.13
400	0.12
401	0.12
402	0.12
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.08
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.1
416	0.14
417	0.15
418	0.17
419	0.18
420	0.21
421	0.21
422	0.22
423	0.22
424	0.18
425	0.17
426	0.15
427	0.13
428	0.1
429	0.09
430	0.07
431	0.06
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.04
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.06
455	0.09
456	0.11
457	0.12
458	0.11
459	0.11
460	0.12
461	0.14
462	0.14
463	0.12
464	0.09
465	0.08
466	0.09
467	0.1
468	0.11
469	0.09
470	0.08
471	0.16
472	0.17
473	0.19
474	0.25
475	0.27
476	0.26
477	0.27
478	0.29
479	0.21
480	0.21
481	0.2
482	0.14
483	0.12
484	0.11
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.09
489	0.08
490	0.08
491	0.06
492	0.06
493	0.08
494	0.1
495	0.12
496	0.13
497	0.13
498	0.13
499	0.14
500	0.15
501	0.14
502	0.12
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.14
533	0.14
534	0.15
535	0.14
536	0.15
537	0.12
538	0.12
539	0.17
540	0.15
541	0.15
542	0.15
543	0.16
544	0.15
545	0.17
546	0.17
547	0.13
548	0.13
549	0.13
550	0.18
551	0.18
552	0.21
553	0.19
554	0.19
555	0.19
556	0.17
557	0.17
558	0.12
559	0.13
560	0.11
561	0.11
562	0.11
563	0.1
564	0.1
565	0.1
566	0.09
567	0.08
568	0.07
569	0.06
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.03
578	0.04
579	0.05
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.08
584	0.11
585	0.12
586	0.12
587	0.12
588	0.12
589	0.17
590	0.18
591	0.16
592	0.14
593	0.16
594	0.17
595	0.18
596	0.2
597	0.16
598	0.18
599	0.19
600	0.25
601	0.25
602	0.25
603	0.29
604	0.32
605	0.34
606	0.35
607	0.39
608	0.39
609	0.38
610	0.41
611	0.39
612	0.36
613	0.34
614	0.31
615	0.27
616	0.25
617	0.23
618	0.2
619	0.19
620	0.17
621	0.15
622	0.15
623	0.12
624	0.12
625	0.12
626	0.11
627	0.11
628	0.11
629	0.13
630	0.15
631	0.14
632	0.15
633	0.18
634	0.19
635	0.19
636	0.22
637	0.27
638	0.31
639	0.35
640	0.34
641	0.35
642	0.4
643	0.41
644	0.42
645	0.37
646	0.34
647	0.31
648	0.29
649	0.26
650	0.25
651	0.23
652	0.2
653	0.2
654	0.17
655	0.16
656	0.17
657	0.16
658	0.13
659	0.19
660	0.25
661	0.27
662	0.27
663	0.27
664	0.25
665	0.25
666	0.25
667	0.19
668	0.12
669	0.08
670	0.08
671	0.07
672	0.07
673	0.07
674	0.05
675	0.05
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.05
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.05
691	0.04
692	0.04
693	0.06
694	0.09
695	0.1
696	0.11
697	0.13
698	0.14
699	0.17
700	0.18
701	0.2
702	0.16
703	0.17
704	0.18
705	0.17
706	0.17
707	0.15
708	0.13
709	0.12
710	0.1
711	0.09
712	0.08
713	0.07
714	0.08
715	0.09
716	0.1
717	0.11
718	0.12
719	0.12
720	0.14
721	0.16
722	0.17
723	0.18
724	0.22
725	0.28
726	0.33
727	0.38
728	0.42
729	0.46
730	0.51
731	0.56
732	0.58
733	0.52
734	0.47
735	0.46
736	0.41
737	0.36
738	0.29
739	0.22
740	0.15
741	0.13
742	0.13
743	0.08
744	0.06
745	0.05
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.07
750	0.08
751	0.08
752	0.1
753	0.09
754	0.07
755	0.07
756	0.11
757	0.13
758	0.14
759	0.15
760	0.2
761	0.22
762	0.25
763	0.27
764	0.29
765	0.34
766	0.34
767	0.41
768	0.38
769	0.36
770	0.34
771	0.33
772	0.29
773	0.21
774	0.2
775	0.12
776	0.09
777	0.09
778	0.08
779	0.08
780	0.09
781	0.1
782	0.11
783	0.1
784	0.11
785	0.12
786	0.13
787	0.16
788	0.14
789	0.14
790	0.14
791	0.15
792	0.16
793	0.16
794	0.15
795	0.13
796	0.13
797	0.14
798	0.14
799	0.14
800	0.12
801	0.13
802	0.14
803	0.13
804	0.17
805	0.18
806	0.19
807	0.22
808	0.28
809	0.34
810	0.41
811	0.44
812	0.41
813	0.43
814	0.42
815	0.39
816	0.35
817	0.3
818	0.23
819	0.19
820	0.23
821	0.21
822	0.28
823	0.29
824	0.28
825	0.28
826	0.28
827	0.32
828	0.31
829	0.29
830	0.24
831	0.23
832	0.22
833	0.22
834	0.2
835	0.17
836	0.18
837	0.17
838	0.16
839	0.15
840	0.17
841	0.16
842	0.17
843	0.18
844	0.13
845	0.15
846	0.18
847	0.24
848	0.28
849	0.33
850	0.38
851	0.4
852	0.46
853	0.46
854	0.46
855	0.49
856	0.45
857	0.4
858	0.36
859	0.35
860	0.3
861	0.28
862	0.25
863	0.16
864	0.15
865	0.16
866	0.2
867	0.2
868	0.21
869	0.28
870	0.35
871	0.42
872	0.47
873	0.54
874	0.57
875	0.66
876	0.71
877	0.73
878	0.77
879	0.8
880	0.78
881	0.74
882	0.74
883	0.7
884	0.69
885	0.65
886	0.63
887	0.58
888	0.6
889	0.61
890	0.55
891	0.5
892	0.45
893	0.47
894	0.42
895	0.4
896	0.33
897	0.31
898	0.27
899	0.29
900	0.28
901	0.2
902	0.18
903	0.17
904	0.22
905	0.23
906	0.24
907	0.22
908	0.23
909	0.25
910	0.25
911	0.27
912	0.28
913	0.26
914	0.3
915	0.31
916	0.34
917	0.36
918	0.35
919	0.33
920	0.33
921	0.34
922	0.3
923	0.31
924	0.28
925	0.26
926	0.27
927	0.3
928	0.27
929	0.26
930	0.25
931	0.23
932	0.25
933	0.27
934	0.29
935	0.28
936	0.25
937	0.29
938	0.3
939	0.3
940	0.28
941	0.25
942	0.23
943	0.23
944	0.32
945	0.28
946	0.28
947	0.28
948	0.28
949	0.27
950	0.27
951	0.28
952	0.21
953	0.27
954	0.33
955	0.39
956	0.43
957	0.48
958	0.56
959	0.61
960	0.68
961	0.69
962	0.73
963	0.76
964	0.82
965	0.88

A0A178Z3T2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer