Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9DGC4

Protein Details
Accession J9DGC4    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-24VKYLWRLFPKKQSTPVNQKLAIHydrophilic
63-89FDGKTPHLKNRAIRKRQQQCEDTRKLAHydrophilic
221-250CDRLLKFSSDNKKRKKYPTRDKSINSNKGAHydrophilic
793-813YYKIKNFYKKPVVKEKNDFEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
234-234R
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09897  H3TH_FEN1-XPG-like  
Amino Acid Sequences MGVKYLWRLFPKKQSTPVNQKLAIDTSIWLHYYRKNDIETFKYLTIKRILKLLFYKNKPIFVFDGKTPHLKNRAIRKRQQQCEDTRKLAQKYLKGMICKTCNTSYNVCKHATILSKDIIDEIDYSQIAEITNIKPKNWGKYYDDEIAVIEDDEFKNKSDKTKLQILLKLREKRKLPVRMREKLSAEDFSSAQIQSVKRRNQVNSLIIELENERMKRVQSDCDRLLKFSSDNKKRKKYPTRDKSINSNKGACDSGRKNILSDVNKNPIYETSETDSDKDSYLTLDDIFKENNEETTENTFTDCKNDDIICISTSNKHHITEKEDEINENVNVLEELESFSSKKICEFGSKFKTDQTMQKDTFFDETTVQTVSNDFFDDACIDDSESSSDLENSEKKLQIDLIDNSIVSGIEEDSSFKNCLNIKRKGSTQKELKLSEEISAIKNSNTWDGIPHSEEKNSKNVSKKIKNKIEDCDSKCSEIEIMSADISIPISDIKKSETYELESTKKSHYKFLNKNKIENNDIMNKNNLDLKDKNISPSANIFIENNNENNEYLINLEKIRHNKDNRINFYGETTLGNSKMHTDKCLDENKNEEIRIVQIAKKSNIQSSDAEFVKKGEISSKYNDIFIDTLNTENTHELNILKNTIIDILKIFNLPFVEAPLEADSQCAYFSLKNIVDAVITEDNDIFLFGGKKIYRNYFKNGKNIDLYDINEIKKIISRDEMIMISLILGSDYCDGIKGFGLKKSLDLIKYSRNLAKIAENETKNPNIPTDYFSFLEDEFIKKIEEQQISKNEYYKIKNFYKKPVVKEKNDFEWGKTDFKKIRDYIDGCGFLRSQKDEINHLLYKLDSEKSVKFNKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.82
4 0.84
5 0.83
6 0.76
7 0.7
8 0.64
9 0.57
10 0.48
11 0.38
12 0.29
13 0.23
14 0.23
15 0.22
16 0.2
17 0.19
18 0.23
19 0.28
20 0.34
21 0.36
22 0.38
23 0.42
24 0.47
25 0.5
26 0.5
27 0.49
28 0.46
29 0.48
30 0.45
31 0.46
32 0.48
33 0.47
34 0.43
35 0.45
36 0.42
37 0.42
38 0.49
39 0.54
40 0.55
41 0.56
42 0.65
43 0.61
44 0.68
45 0.61
46 0.57
47 0.52
48 0.48
49 0.48
50 0.41
51 0.45
52 0.41
53 0.48
54 0.46
55 0.49
56 0.5
57 0.52
58 0.56
59 0.59
60 0.68
61 0.7
62 0.77
63 0.8
64 0.83
65 0.87
66 0.88
67 0.86
68 0.85
69 0.86
70 0.85
71 0.79
72 0.77
73 0.75
74 0.69
75 0.67
76 0.63
77 0.58
78 0.57
79 0.6
80 0.56
81 0.51
82 0.53
83 0.54
84 0.53
85 0.5
86 0.49
87 0.46
88 0.46
89 0.47
90 0.5
91 0.5
92 0.52
93 0.53
94 0.49
95 0.44
96 0.41
97 0.43
98 0.42
99 0.38
100 0.34
101 0.32
102 0.31
103 0.31
104 0.3
105 0.24
106 0.18
107 0.15
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.12
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.3
122 0.34
123 0.42
124 0.44
125 0.48
126 0.45
127 0.5
128 0.56
129 0.53
130 0.49
131 0.4
132 0.35
133 0.3
134 0.25
135 0.19
136 0.13
137 0.11
138 0.1
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.18
143 0.19
144 0.25
145 0.3
146 0.36
147 0.39
148 0.48
149 0.53
150 0.55
151 0.59
152 0.59
153 0.6
154 0.64
155 0.67
156 0.63
157 0.64
158 0.61
159 0.64
160 0.67
161 0.68
162 0.68
163 0.7
164 0.75
165 0.76
166 0.79
167 0.78
168 0.71
169 0.66
170 0.6
171 0.53
172 0.44
173 0.37
174 0.31
175 0.25
176 0.24
177 0.19
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.24
182 0.33
183 0.38
184 0.42
185 0.49
186 0.51
187 0.54
188 0.59
189 0.56
190 0.49
191 0.45
192 0.41
193 0.34
194 0.32
195 0.25
196 0.21
197 0.19
198 0.17
199 0.17
200 0.16
201 0.17
202 0.21
203 0.23
204 0.29
205 0.32
206 0.4
207 0.43
208 0.51
209 0.51
210 0.47
211 0.46
212 0.39
213 0.35
214 0.35
215 0.42
216 0.44
217 0.53
218 0.61
219 0.69
220 0.75
221 0.84
222 0.86
223 0.86
224 0.87
225 0.89
226 0.89
227 0.89
228 0.84
229 0.84
230 0.84
231 0.82
232 0.75
233 0.68
234 0.58
235 0.51
236 0.49
237 0.38
238 0.36
239 0.3
240 0.31
241 0.33
242 0.33
243 0.31
244 0.33
245 0.4
246 0.36
247 0.4
248 0.4
249 0.41
250 0.42
251 0.42
252 0.38
253 0.32
254 0.32
255 0.28
256 0.25
257 0.22
258 0.24
259 0.25
260 0.25
261 0.25
262 0.21
263 0.2
264 0.17
265 0.13
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.14
279 0.13
280 0.14
281 0.18
282 0.19
283 0.17
284 0.18
285 0.17
286 0.15
287 0.18
288 0.17
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.17
294 0.18
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.16
299 0.17
300 0.23
301 0.22
302 0.22
303 0.26
304 0.28
305 0.33
306 0.33
307 0.36
308 0.35
309 0.34
310 0.33
311 0.3
312 0.3
313 0.24
314 0.18
315 0.14
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.18
332 0.21
333 0.3
334 0.35
335 0.38
336 0.38
337 0.38
338 0.41
339 0.36
340 0.39
341 0.37
342 0.38
343 0.36
344 0.39
345 0.37
346 0.34
347 0.34
348 0.28
349 0.22
350 0.15
351 0.15
352 0.13
353 0.13
354 0.11
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.08
377 0.09
378 0.12
379 0.14
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.16
384 0.16
385 0.19
386 0.17
387 0.16
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.1
393 0.06
394 0.06
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.12
404 0.15
405 0.23
406 0.29
407 0.36
408 0.38
409 0.4
410 0.46
411 0.52
412 0.55
413 0.55
414 0.55
415 0.55
416 0.57
417 0.55
418 0.51
419 0.43
420 0.38
421 0.31
422 0.25
423 0.2
424 0.15
425 0.15
426 0.14
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.11
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.13
436 0.13
437 0.15
438 0.14
439 0.17
440 0.2
441 0.21
442 0.26
443 0.27
444 0.29
445 0.33
446 0.39
447 0.46
448 0.52
449 0.6
450 0.63
451 0.69
452 0.71
453 0.68
454 0.68
455 0.67
456 0.66
457 0.61
458 0.58
459 0.51
460 0.46
461 0.42
462 0.36
463 0.28
464 0.19
465 0.16
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.08
480 0.11
481 0.12
482 0.14
483 0.15
484 0.18
485 0.21
486 0.24
487 0.25
488 0.25
489 0.26
490 0.28
491 0.32
492 0.29
493 0.32
494 0.36
495 0.44
496 0.52
497 0.62
498 0.68
499 0.65
500 0.71
501 0.69
502 0.67
503 0.6
504 0.52
505 0.45
506 0.43
507 0.42
508 0.37
509 0.34
510 0.29
511 0.27
512 0.27
513 0.24
514 0.2
515 0.19
516 0.22
517 0.26
518 0.26
519 0.27
520 0.27
521 0.27
522 0.23
523 0.24
524 0.23
525 0.17
526 0.17
527 0.15
528 0.14
529 0.17
530 0.17
531 0.16
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.14
536 0.13
537 0.1
538 0.09
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.11
543 0.15
544 0.21
545 0.27
546 0.34
547 0.36
548 0.44
549 0.53
550 0.61
551 0.62
552 0.61
553 0.56
554 0.49
555 0.47
556 0.39
557 0.31
558 0.22
559 0.18
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.12
564 0.14
565 0.19
566 0.19
567 0.19
568 0.2
569 0.21
570 0.27
571 0.36
572 0.35
573 0.32
574 0.35
575 0.4
576 0.41
577 0.38
578 0.33
579 0.24
580 0.23
581 0.25
582 0.23
583 0.19
584 0.19
585 0.24
586 0.26
587 0.3
588 0.31
589 0.31
590 0.31
591 0.31
592 0.29
593 0.28
594 0.32
595 0.28
596 0.27
597 0.23
598 0.21
599 0.2
600 0.19
601 0.16
602 0.16
603 0.19
604 0.22
605 0.26
606 0.32
607 0.31
608 0.31
609 0.31
610 0.26
611 0.23
612 0.19
613 0.19
614 0.13
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.13
619 0.13
620 0.13
621 0.1
622 0.11
623 0.1
624 0.13
625 0.14
626 0.14
627 0.13
628 0.13
629 0.13
630 0.15
631 0.15
632 0.11
633 0.11
634 0.11
635 0.12
636 0.13
637 0.12
638 0.1
639 0.11
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.1
645 0.12
646 0.12
647 0.12
648 0.11
649 0.12
650 0.1
651 0.09
652 0.1
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.09
657 0.16
658 0.16
659 0.17
660 0.17
661 0.17
662 0.15
663 0.15
664 0.19
665 0.14
666 0.14
667 0.14
668 0.13
669 0.13
670 0.13
671 0.13
672 0.08
673 0.07
674 0.08
675 0.08
676 0.14
677 0.15
678 0.19
679 0.24
680 0.33
681 0.4
682 0.43
683 0.51
684 0.54
685 0.59
686 0.64
687 0.63
688 0.59
689 0.55
690 0.52
691 0.49
692 0.42
693 0.38
694 0.36
695 0.36
696 0.32
697 0.29
698 0.28
699 0.24
700 0.25
701 0.25
702 0.2
703 0.2
704 0.22
705 0.22
706 0.25
707 0.25
708 0.21
709 0.19
710 0.17
711 0.13
712 0.1
713 0.08
714 0.05
715 0.04
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.1
724 0.14
725 0.15
726 0.18
727 0.22
728 0.21
729 0.22
730 0.28
731 0.31
732 0.28
733 0.3
734 0.3
735 0.36
736 0.39
737 0.43
738 0.41
739 0.38
740 0.37
741 0.36
742 0.38
743 0.34
744 0.38
745 0.41
746 0.39
747 0.41
748 0.45
749 0.47
750 0.43
751 0.4
752 0.35
753 0.31
754 0.3
755 0.31
756 0.29
757 0.3
758 0.28
759 0.28
760 0.27
761 0.23
762 0.25
763 0.22
764 0.21
765 0.17
766 0.18
767 0.18
768 0.16
769 0.23
770 0.27
771 0.32
772 0.33
773 0.4
774 0.48
775 0.53
776 0.55
777 0.52
778 0.5
779 0.51
780 0.55
781 0.53
782 0.54
783 0.57
784 0.65
785 0.66
786 0.71
787 0.74
788 0.75
789 0.77
790 0.79
791 0.79
792 0.79
793 0.84
794 0.81
795 0.78
796 0.8
797 0.72
798 0.63
799 0.61
800 0.55
801 0.54
802 0.49
803 0.5
804 0.47
805 0.49
806 0.56
807 0.51
808 0.54
809 0.55
810 0.55
811 0.52
812 0.55
813 0.55
814 0.47
815 0.47
816 0.41
817 0.34
818 0.37
819 0.34
820 0.29
821 0.29
822 0.32
823 0.35
824 0.4
825 0.44
826 0.41
827 0.38
828 0.37
829 0.32
830 0.32
831 0.3
832 0.27
833 0.23
834 0.25
835 0.3
836 0.36