Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZYW5

Protein Details
Accession A0A178ZYW5    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-86ADVPLSSPPKKRKRDTEGIESSKKKKKPRTGEVAEPPAAVAEPPVENKEKKKKKKKQKQKSEDKNDAAARHydrophilic
288-313NGPSREQLQKNKKGRKGRLRDENSLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-77PKKRKRDTEGIESSKKKKKPRTGEVAEPPAAVAEPPVENKEKKKKKKKQKQKS
297-305KNKKGRKGR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSVPTKNKHATSSNIVADVPLSSPPKKRKRDTEGIESSKKKKKPRTGEVAEPPAAVAEPPVENKEKKKKKKKQKQKSEDKNDAAARRVEEEEEVPVSPDMEPRDEDAAEGDMESIMETDTAGLNGSEEVDEAELMLLESEDPSSFYSTRLSLYLSIPAVSLEAAKSSILAAHLAPLLLTYFPPARGIVLGFSDPVLSAQPNSGINLPLLPPQTGDIEAQAEVLADTADEFGVCWVWLTATFLVFRPERGDELYGWTNVSSEGFVGLVSYNYFQTAIGKTRIPAEWTWNGPSREQLQKNKKGRKGRLRDENSLDDGEEHGTQETSITAVEAPSSQPLLVDDGGYFTDASGTRIKSTLKFRVADTEIVPAHDRHKWSLQIDGTLLDDEAERNVLEEERGKFERAQETSRSRSLGGEDAPVMSGALSRSLSREGSVGSRISGHTPARHRVTY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.37
4 0.32
5 0.26
6 0.19
7 0.16
8 0.18
9 0.21
10 0.3
11 0.4
12 0.5
13 0.59
14 0.68
15 0.73
16 0.79
17 0.86
18 0.85
19 0.86
20 0.86
21 0.84
22 0.84
23 0.8
24 0.79
25 0.77
26 0.76
27 0.75
28 0.74
29 0.77
30 0.79
31 0.82
32 0.85
33 0.84
34 0.87
35 0.87
36 0.85
37 0.75
38 0.64
39 0.53
40 0.42
41 0.34
42 0.24
43 0.14
44 0.09
45 0.1
46 0.12
47 0.16
48 0.21
49 0.25
50 0.34
51 0.45
52 0.53
53 0.63
54 0.72
55 0.79
56 0.85
57 0.93
58 0.95
59 0.96
60 0.96
61 0.96
62 0.96
63 0.97
64 0.96
65 0.95
66 0.88
67 0.84
68 0.79
69 0.71
70 0.63
71 0.55
72 0.46
73 0.39
74 0.35
75 0.28
76 0.23
77 0.21
78 0.2
79 0.18
80 0.17
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.14
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.12
96 0.12
97 0.09
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.02
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.11
238 0.16
239 0.18
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.06
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.08
261 0.1
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.21
271 0.23
272 0.25
273 0.28
274 0.31
275 0.32
276 0.29
277 0.32
278 0.31
279 0.36
280 0.4
281 0.46
282 0.51
283 0.6
284 0.69
285 0.75
286 0.78
287 0.79
288 0.83
289 0.83
290 0.83
291 0.83
292 0.84
293 0.82
294 0.82
295 0.77
296 0.71
297 0.63
298 0.53
299 0.44
300 0.33
301 0.27
302 0.21
303 0.15
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.06
332 0.09
333 0.09
334 0.12
335 0.15
336 0.16
337 0.16
338 0.19
339 0.21
340 0.24
341 0.31
342 0.38
343 0.4
344 0.4
345 0.4
346 0.46
347 0.47
348 0.44
349 0.37
350 0.34
351 0.29
352 0.29
353 0.3
354 0.23
355 0.23
356 0.25
357 0.26
358 0.25
359 0.3
360 0.34
361 0.33
362 0.39
363 0.38
364 0.35
365 0.34
366 0.3
367 0.25
368 0.2
369 0.19
370 0.12
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.07
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.16
381 0.18
382 0.23
383 0.26
384 0.27
385 0.28
386 0.33
387 0.4
388 0.39
389 0.41
390 0.43
391 0.48
392 0.52
393 0.54
394 0.5
395 0.42
396 0.4
397 0.38
398 0.35
399 0.29
400 0.26
401 0.23
402 0.22
403 0.22
404 0.2
405 0.16
406 0.11
407 0.11
408 0.08
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.13
413 0.17
414 0.18
415 0.17
416 0.18
417 0.17
418 0.19
419 0.22
420 0.21
421 0.18
422 0.2
423 0.21
424 0.23
425 0.27
426 0.28
427 0.32
428 0.38
429 0.46