FuNGI

A0A178ZHQ6

Protein Details

Accession

A0A178ZHQ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-446	KRRKETEDRRARNEQRRNQANEAREARFAKRRRS

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 7, mito 6, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLTKKYPKIITPVIEEQPYEVDGVQYPVDTTQPNPNGEEMHNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPANESEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKEADEKKAEFQTLLRQQQRDMDDDEDEETVDDVIKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRYWVQWKLNTDPAWAQLKVIISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPAYDPNTRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVDVRDAKAKTCRLCGQQGHYAENCRGEAKKKSGHFDEKGTTEELKPFVWLNVPILREYLGAEMFVPGQTFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREDGIDKLIAIWRDNIPIMGGYLTCDGRVDLARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKETEDRRARNEQRRNQANEAREARFAKRRRSSPDYNKGGRADTRVPTGPVETFEASNFPVLDYNSIVNRAAVDKTLVSNKSAAAVLKEQMLAKRAAETAAKNGANGINGPPSSSDASPSSILGKRKAATLEDEAENDGTPASAGDKRKAALMDEDEESAGTPGRNTPIEKKTFNNGDPNDPPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFHVDPKDLAFRHKVAEAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIEKKTVKFDKGTPFKPYEQLMGVLPASSNHAIPSAFHPLMTDPDSDIVDFYPQEFDLDLNGAKQSWKAIVLLPFIDEKRLLAAMATKYPLLTDDEHARNERGHDALIISDQNPLYDILAMKFYSKKAKDGPSTVKLSMQKSQLAGEVTKNEDFLPHMYLTGPQEDIRLEPEVDDDRSLNVFFTMPPPTHVHKSMLFPGVVLPAPVLDKGDLAMVRSKARVSGRDFGGAPLYDNTRRDRFDTQNRGGRINYAADRPPFDAGPPGMPPPNQWPPGMPPPPPPGYGNQGGYNRGPPPANGYGGYGTHTAQGYGGQDQGYYGNQGQQNHGGTNQYHGSNGQYQQNGGRSFSDGYYQGQSRGPPARDNRSGNYGSGGYNQGGYGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.68
5	0.65
6	0.63
7	0.62
8	0.59
9	0.52
10	0.47
11	0.4
12	0.35
13	0.3
14	0.24
15	0.17
16	0.13
17	0.12
18	0.15
19	0.14
20	0.12
21	0.12
22	0.11
23	0.14
24	0.13
25	0.15
26	0.23
27	0.28
28	0.3
29	0.31
30	0.32
31	0.33
32	0.33
33	0.38
34	0.32
35	0.3
36	0.28
37	0.27
38	0.26
39	0.23
40	0.22
41	0.14
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.11
46	0.12
47	0.13
48	0.15
49	0.21
50	0.27
51	0.28
52	0.37
53	0.46
54	0.53
55	0.6
56	0.59
57	0.6
58	0.59
59	0.6
60	0.51
61	0.44
62	0.38
63	0.32
64	0.3
65	0.24
66	0.19
67	0.14
68	0.14
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.13
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.47
80	0.46
81	0.47
82	0.46
83	0.45
84	0.39
85	0.31
86	0.29
87	0.26
88	0.24
89	0.23
90	0.19
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.82
105	0.8
106	0.77
107	0.79
108	0.79
109	0.75
110	0.76
111	0.69
112	0.62
113	0.67
114	0.63
115	0.56
116	0.53
117	0.47
118	0.42
119	0.43
120	0.41
121	0.31
122	0.3
123	0.35
124	0.37
125	0.46
126	0.48
127	0.45
128	0.46
129	0.52
130	0.53
131	0.46
132	0.4
133	0.33
134	0.28
135	0.28
136	0.28
137	0.21
138	0.18
139	0.15
140	0.12
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.08
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.12
149	0.15
150	0.2
151	0.23
152	0.26
153	0.31
154	0.32
155	0.32
156	0.31
157	0.3
158	0.25
159	0.21
160	0.17
161	0.12
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.12
166	0.13
167	0.13
168	0.16
169	0.15
170	0.15
171	0.18
172	0.18
173	0.25
174	0.28
175	0.33
176	0.35
177	0.42
178	0.41
179	0.42
180	0.4
181	0.38
182	0.38
183	0.34
184	0.28
185	0.24
186	0.25
187	0.22
188	0.21
189	0.16
190	0.11
191	0.12
192	0.13
193	0.11
194	0.1
195	0.09
196	0.08
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.1
202	0.13
203	0.14
204	0.15
205	0.18
206	0.24
207	0.3
208	0.31
209	0.33
210	0.36
211	0.39
212	0.4
213	0.37
214	0.4
215	0.37
216	0.4
217	0.41
218	0.42
219	0.42
220	0.4
221	0.38
222	0.3
223	0.26
224	0.21
225	0.21
226	0.16
227	0.11
228	0.11
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.06
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.05
239	0.07
240	0.08
241	0.11
242	0.13
243	0.14
244	0.18
245	0.19
246	0.2
247	0.23
248	0.25
249	0.23
250	0.28
251	0.28
252	0.25
253	0.29
254	0.28
255	0.26
256	0.31
257	0.35
258	0.31
259	0.36
260	0.41
261	0.39
262	0.47
263	0.48
264	0.47
265	0.49
266	0.49
267	0.48
268	0.44
269	0.42
270	0.36
271	0.34
272	0.29
273	0.24
274	0.23
275	0.24
276	0.29
277	0.32
278	0.37
279	0.39
280	0.45
281	0.51
282	0.57
283	0.55
284	0.53
285	0.51
286	0.46
287	0.44
288	0.4
289	0.33
290	0.26
291	0.26
292	0.22
293	0.18
294	0.17
295	0.16
296	0.14
297	0.15
298	0.14
299	0.14
300	0.17
301	0.18
302	0.17
303	0.17
304	0.17
305	0.14
306	0.14
307	0.13
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.17
327	0.15
328	0.13
329	0.13
330	0.13
331	0.1
332	0.08
333	0.08
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.08
347	0.11
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.13
353	0.12
354	0.13
355	0.09
356	0.07
357	0.08
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.12
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.1
367	0.09
368	0.09
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.11
387	0.1
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.07
394	0.08
395	0.12
396	0.14
397	0.21
398	0.26
399	0.27
400	0.33
401	0.36
402	0.39
403	0.44
404	0.52
405	0.55
406	0.6
407	0.65
408	0.66
409	0.73
410	0.78
411	0.78
412	0.78
413	0.75
414	0.74
415	0.77
416	0.76
417	0.73
418	0.7
419	0.62
420	0.61
421	0.57
422	0.49
423	0.44
424	0.41
425	0.37
426	0.4
427	0.43
428	0.44
429	0.47
430	0.51
431	0.55
432	0.61
433	0.67
434	0.7
435	0.75
436	0.74
437	0.69
438	0.68
439	0.61
440	0.55
441	0.46
442	0.4
443	0.33
444	0.26
445	0.27
446	0.24
447	0.24
448	0.22
449	0.22
450	0.18
451	0.15
452	0.16
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.11
458	0.11
459	0.1
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.09
466	0.08
467	0.1
468	0.09
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.13
478	0.13
479	0.12
480	0.13
481	0.12
482	0.13
483	0.13
484	0.12
485	0.09
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.11
490	0.11
491	0.11
492	0.13
493	0.12
494	0.1
495	0.11
496	0.11
497	0.11
498	0.12
499	0.11
500	0.12
501	0.17
502	0.17
503	0.16
504	0.16
505	0.16
506	0.14
507	0.14
508	0.12
509	0.09
510	0.09
511	0.09
512	0.08
513	0.1
514	0.11
515	0.11
516	0.12
517	0.1
518	0.12
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.16
523	0.18
524	0.18
525	0.2
526	0.18
527	0.2
528	0.21
529	0.18
530	0.18
531	0.19
532	0.2
533	0.18
534	0.18
535	0.16
536	0.15
537	0.14
538	0.11
539	0.08
540	0.05
541	0.04
542	0.03
543	0.05
544	0.09
545	0.1
546	0.12
547	0.13
548	0.14
549	0.16
550	0.16
551	0.15
552	0.14
553	0.15
554	0.15
555	0.15
556	0.15
557	0.13
558	0.13
559	0.12
560	0.09
561	0.08
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.07
566	0.09
567	0.11
568	0.17
569	0.24
570	0.29
571	0.31
572	0.32
573	0.37
574	0.4
575	0.41
576	0.42
577	0.37
578	0.38
579	0.39
580	0.39
581	0.36
582	0.3
583	0.29
584	0.22
585	0.25
586	0.19
587	0.18
588	0.17
589	0.16
590	0.17
591	0.17
592	0.16
593	0.14
594	0.17
595	0.16
596	0.14
597	0.12
598	0.14
599	0.14
600	0.15
601	0.14
602	0.15
603	0.16
604	0.22
605	0.26
606	0.27
607	0.27
608	0.28
609	0.36
610	0.34
611	0.35
612	0.31
613	0.28
614	0.26
615	0.27
616	0.24
617	0.15
618	0.17
619	0.14
620	0.14
621	0.13
622	0.11
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.06
627	0.05
628	0.03
629	0.03
630	0.04
631	0.06
632	0.06
633	0.07
634	0.08
635	0.08
636	0.09
637	0.14
638	0.17
639	0.16
640	0.19
641	0.21
642	0.25
643	0.29
644	0.31
645	0.28
646	0.24
647	0.24
648	0.21
649	0.2
650	0.16
651	0.12
652	0.1
653	0.08
654	0.09
655	0.14
656	0.14
657	0.13
658	0.16
659	0.16
660	0.19
661	0.24
662	0.24
663	0.21
664	0.28
665	0.37
666	0.42
667	0.45
668	0.47
669	0.47
670	0.47
671	0.47
672	0.42
673	0.35
674	0.28
675	0.26
676	0.2
677	0.18
678	0.16
679	0.12
680	0.11
681	0.09
682	0.11
683	0.1
684	0.1
685	0.08
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.14
690	0.18
691	0.17
692	0.17
693	0.17
694	0.17
695	0.2
696	0.21
697	0.18
698	0.11
699	0.12
700	0.13
701	0.12
702	0.12
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.08
707	0.08
708	0.07
709	0.08
710	0.08
711	0.08
712	0.07
713	0.09
714	0.08
715	0.07
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.08
720	0.09
721	0.08
722	0.09
723	0.09
724	0.12
725	0.15
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.18
730	0.17
731	0.18
732	0.14
733	0.11
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.08
738	0.12
739	0.13
740	0.15
741	0.16
742	0.14
743	0.14
744	0.14
745	0.15
746	0.13
747	0.13
748	0.14
749	0.21
750	0.24
751	0.27
752	0.28
753	0.28
754	0.26
755	0.27
756	0.26
757	0.19
758	0.16
759	0.14
760	0.13
761	0.12
762	0.13
763	0.12
764	0.1
765	0.13
766	0.12
767	0.11
768	0.12
769	0.12
770	0.1
771	0.11
772	0.11
773	0.09
774	0.11
775	0.11
776	0.12
777	0.14
778	0.16
779	0.24
780	0.25
781	0.29
782	0.34
783	0.42
784	0.46
785	0.52
786	0.57
787	0.55
788	0.59
789	0.54
790	0.53
791	0.5
792	0.47
793	0.45
794	0.4
795	0.36
796	0.32
797	0.32
798	0.3
799	0.27
800	0.25
801	0.22
802	0.22
803	0.23
804	0.22
805	0.22
806	0.18
807	0.17
808	0.17
809	0.16
810	0.17
811	0.13
812	0.13
813	0.13
814	0.16
815	0.17
816	0.17
817	0.17
818	0.14
819	0.15
820	0.15
821	0.15
822	0.15
823	0.15
824	0.13
825	0.12
826	0.15
827	0.17
828	0.17
829	0.18
830	0.15
831	0.15
832	0.16
833	0.16
834	0.13
835	0.11
836	0.1
837	0.09
838	0.12
839	0.14
840	0.14
841	0.17
842	0.22
843	0.27
844	0.31
845	0.34
846	0.35
847	0.34
848	0.39
849	0.41
850	0.4
851	0.34
852	0.29
853	0.27
854	0.26
855	0.23
856	0.18
857	0.12
858	0.09
859	0.1
860	0.1
861	0.1
862	0.08
863	0.08
864	0.08
865	0.11
866	0.11
867	0.11
868	0.16
869	0.17
870	0.19
871	0.2
872	0.21
873	0.23
874	0.27
875	0.32
876	0.33
877	0.38
878	0.39
879	0.42
880	0.42
881	0.38
882	0.38
883	0.31
884	0.27
885	0.22
886	0.24
887	0.24
888	0.26
889	0.31
890	0.33
891	0.35
892	0.38
893	0.42
894	0.47
895	0.54
896	0.61
897	0.64
898	0.66
899	0.66
900	0.64
901	0.57
902	0.51
903	0.43
904	0.39
905	0.33
906	0.3
907	0.33
908	0.33
909	0.35
910	0.34
911	0.34
912	0.28
913	0.26
914	0.26
915	0.22
916	0.23
917	0.22
918	0.24
919	0.25
920	0.25
921	0.27
922	0.3
923	0.38
924	0.37
925	0.35
926	0.35
927	0.39
928	0.49
929	0.51
930	0.46
931	0.44
932	0.49
933	0.52
934	0.51
935	0.46
936	0.4
937	0.42
938	0.45
939	0.42
940	0.41
941	0.4
942	0.41
943	0.41
944	0.41
945	0.36
946	0.34
947	0.31
948	0.25
949	0.3
950	0.3
951	0.31
952	0.27
953	0.28
954	0.26
955	0.26
956	0.28
957	0.21
958	0.18
959	0.19
960	0.18
961	0.16
962	0.13
963	0.15
964	0.15
965	0.15
966	0.16
967	0.13
968	0.13
969	0.13
970	0.15
971	0.13
972	0.15
973	0.14
974	0.19
975	0.22
976	0.24
977	0.27
978	0.32
979	0.33
980	0.31
981	0.32
982	0.29
983	0.27
984	0.3
985	0.31
986	0.25
987	0.24
988	0.23
989	0.26
990	0.29
991	0.33
992	0.34
993	0.32
994	0.33
995	0.37
996	0.43
997	0.41
998	0.36
999	0.33
1000	0.29
1001	0.3
1002	0.29
1003	0.28
1004	0.22
1005	0.24
1006	0.28
1007	0.28
1008	0.28
1009	0.29
1010	0.29
1011	0.32
1012	0.39
1013	0.38
1014	0.4
1015	0.47
1016	0.54
1017	0.6
1018	0.65
1019	0.63
1020	0.62
1021	0.62
1022	0.54
1023	0.5
1024	0.42
1025	0.34
1026	0.32
1027	0.3
1028	0.22
1029	0.21
1030	0.2

A0A178ZHQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer