Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZZJ4

Protein Details
Accession A0A178ZZJ4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-446VDDQPKPKNKARKEGESRGGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
430-469KPKNKARKEGESRGGRGRGGGRGRGRGGGGGRGRGRGRGF
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 8, cyto_nucl 7, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR041698  Methyltransf_25  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR047575  Sm  
IPR034102  Sm_D1  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF13649  Methyltransf_25  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
cd01724  Sm_D1  
Amino Acid Sequences MASTTSRQSNDRDPTFRNYDPVSAAKYLQSRPRYTDVLIDLVISKHTSSGGGLDLVVDVGCGPGIATLNLAPHFQHAIGADPGQSMIEAAKTVPSTTKSGEPIKYEVCPAEALSTLSALKEISGAGKDGMESVDLITAATAAHWFDMPRFWGEAAKILKPGGSVIIWCYGGHFCNPSTPNAEKLQEWLKTFEEEVLGPYELPGNRVARELYVNLGLPWECLDRIDGDGDDSQELKTLLKEFDEQQFERIETDREGRLPTGDAFSAFRRLEFAKIKTVMATASPITRWREANKEKVERGELEDVLDLLIRRAKEILEEVPEGKGRDWIENGSRMVILVVKKRKFLMKCANESVTIELKNGTIVSGTITSVSPQMNTALRAVKMTTKNRSNPSAPGDTVSLDTINIRGSTIRYYILPDSLPLDTLLVDDQPKPKNKARKEGESRGGRGRGGGRGRGRGGGGGRGRGRGRGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.59
4 0.55
5 0.48
6 0.44
7 0.43
8 0.42
9 0.38
10 0.33
11 0.32
12 0.32
13 0.35
14 0.37
15 0.42
16 0.46
17 0.45
18 0.49
19 0.54
20 0.52
21 0.48
22 0.49
23 0.43
24 0.38
25 0.34
26 0.29
27 0.24
28 0.21
29 0.21
30 0.15
31 0.13
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.06
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.03
49 0.03
50 0.04
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.08
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.14
61 0.13
62 0.14
63 0.12
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.12
81 0.15
82 0.17
83 0.19
84 0.24
85 0.26
86 0.32
87 0.35
88 0.35
89 0.36
90 0.36
91 0.35
92 0.32
93 0.28
94 0.23
95 0.2
96 0.17
97 0.15
98 0.13
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.19
141 0.2
142 0.2
143 0.19
144 0.18
145 0.18
146 0.16
147 0.16
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.16
162 0.18
163 0.18
164 0.22
165 0.22
166 0.25
167 0.27
168 0.28
169 0.22
170 0.24
171 0.28
172 0.26
173 0.27
174 0.26
175 0.23
176 0.22
177 0.23
178 0.2
179 0.15
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.16
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.15
237 0.11
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.16
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.2
257 0.24
258 0.25
259 0.26
260 0.27
261 0.27
262 0.25
263 0.25
264 0.2
265 0.15
266 0.15
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.13
271 0.15
272 0.18
273 0.19
274 0.21
275 0.3
276 0.34
277 0.43
278 0.48
279 0.51
280 0.5
281 0.52
282 0.52
283 0.43
284 0.42
285 0.37
286 0.28
287 0.23
288 0.21
289 0.18
290 0.15
291 0.14
292 0.09
293 0.06
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.16
304 0.16
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.17
309 0.19
310 0.16
311 0.17
312 0.18
313 0.2
314 0.21
315 0.25
316 0.25
317 0.21
318 0.2
319 0.18
320 0.17
321 0.16
322 0.16
323 0.2
324 0.28
325 0.29
326 0.31
327 0.34
328 0.41
329 0.4
330 0.46
331 0.49
332 0.5
333 0.55
334 0.59
335 0.58
336 0.52
337 0.51
338 0.45
339 0.38
340 0.3
341 0.23
342 0.18
343 0.16
344 0.16
345 0.15
346 0.11
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.12
357 0.1
358 0.1
359 0.13
360 0.14
361 0.15
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.25
368 0.32
369 0.38
370 0.44
371 0.49
372 0.56
373 0.61
374 0.66
375 0.61
376 0.59
377 0.58
378 0.55
379 0.47
380 0.42
381 0.37
382 0.31
383 0.29
384 0.25
385 0.18
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.14
395 0.15
396 0.16
397 0.14
398 0.19
399 0.2
400 0.21
401 0.2
402 0.18
403 0.19
404 0.18
405 0.18
406 0.14
407 0.13
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.12
413 0.15
414 0.21
415 0.28
416 0.36
417 0.42
418 0.49
419 0.57
420 0.64
421 0.71
422 0.73
423 0.77
424 0.8
425 0.83
426 0.85
427 0.83
428 0.8
429 0.78
430 0.72
431 0.61
432 0.56
433 0.5
434 0.48
435 0.45
436 0.49
437 0.46
438 0.5
439 0.52
440 0.5
441 0.47
442 0.43
443 0.4
444 0.4
445 0.38
446 0.39
447 0.4
448 0.43
449 0.44