FuNGI

A0A178ZN25

Protein Details

Accession

A0A178ZN25

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
439-460	TTGSPVKPPKPKFAKLRFPVEF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-9	KKKRKA
448-453	KPKFAK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MAEKKKRKASSLESERPAKKPQTSTIKVTHLSGPAVAKPVVASSPGVTLPSNLSFDVYSKKELSGRSSLLLQSSDHPTIDYVATESSTTNGGEQHVKHYIAVFDPASNKLKVVEARQMTVRSTVRQLDKEGDDGEDDAETKPAATPSRAALTQAFGTKKSKRAVASSAENRLLARDGENRDDAVSNAVLSSIREEDDPDVVLDAGAASRANKPLPQANLDTTDITLVYDLSSLVFPGPYRTTLSQMPIAYWRECAKNKKSVSTHLRFVATRIGYLTQRHLKQPDNQDILLKLQILRYIQLLVEIHKYVSHLPRQRRIAPPEQWPPGTTSDSALSTAFKGKLMAHFFPTRTASTFNKTLLTATILALTLHIPPPNFTPGDTPKMLFTEPSDITLDLAMPHAEVHKLYRELGCKMESMTDAELQRYGWDKVSSRQQQQQQTTGSPVKPPKPKFAKLRFPVEFPRISTGRPARR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.78
3	0.73
4	0.71
5	0.67
6	0.64
7	0.61
8	0.63
9	0.65
10	0.66
11	0.69
12	0.68
13	0.68
14	0.62
15	0.58
16	0.54
17	0.45
18	0.4
19	0.36
20	0.31
21	0.26
22	0.29
23	0.26
24	0.21
25	0.18
26	0.19
27	0.16
28	0.15
29	0.14
30	0.11
31	0.13
32	0.14
33	0.15
34	0.13
35	0.14
36	0.16
37	0.18
38	0.19
39	0.16
40	0.17
41	0.16
42	0.18
43	0.23
44	0.22
45	0.23
46	0.23
47	0.25
48	0.28
49	0.3
50	0.34
51	0.33
52	0.33
53	0.31
54	0.32
55	0.31
56	0.29
57	0.28
58	0.23
59	0.21
60	0.25
61	0.25
62	0.22
63	0.21
64	0.19
65	0.2
66	0.19
67	0.16
68	0.11
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.09
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.1
78	0.11
79	0.16
80	0.17
81	0.21
82	0.24
83	0.24
84	0.24
85	0.24
86	0.23
87	0.19
88	0.22
89	0.17
90	0.15
91	0.17
92	0.21
93	0.23
94	0.22
95	0.21
96	0.18
97	0.22
98	0.23
99	0.25
100	0.29
101	0.27
102	0.29
103	0.33
104	0.33
105	0.3
106	0.33
107	0.31
108	0.25
109	0.28
110	0.32
111	0.33
112	0.34
113	0.35
114	0.34
115	0.33
116	0.33
117	0.3
118	0.24
119	0.19
120	0.18
121	0.16
122	0.1
123	0.1
124	0.08
125	0.08
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.09
130	0.11
131	0.11
132	0.12
133	0.14
134	0.17
135	0.17
136	0.18
137	0.16
138	0.16
139	0.18
140	0.21
141	0.2
142	0.18
143	0.24
144	0.26
145	0.32
146	0.32
147	0.35
148	0.33
149	0.35
150	0.38
151	0.38
152	0.44
153	0.42
154	0.44
155	0.41
156	0.39
157	0.35
158	0.31
159	0.26
160	0.18
161	0.15
162	0.17
163	0.18
164	0.21
165	0.21
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.14
171	0.11
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.07
178	0.06
179	0.07
180	0.07
181	0.08
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.05
190	0.04
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.04
195	0.06
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.11
200	0.16
201	0.18
202	0.19
203	0.2
204	0.2
205	0.23
206	0.23
207	0.22
208	0.17
209	0.15
210	0.12
211	0.1
212	0.08
213	0.05
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.06
224	0.07
225	0.08
226	0.11
227	0.11
228	0.14
229	0.15
230	0.18
231	0.19
232	0.18
233	0.18
234	0.2
235	0.21
236	0.19
237	0.19
238	0.19
239	0.21
240	0.26
241	0.33
242	0.33
243	0.39
244	0.4
245	0.46
246	0.46
247	0.5
248	0.55
249	0.52
250	0.51
251	0.46
252	0.47
253	0.39
254	0.38
255	0.35
256	0.26
257	0.21
258	0.18
259	0.18
260	0.17
261	0.18
262	0.23
263	0.23
264	0.25
265	0.29
266	0.31
267	0.33
268	0.38
269	0.46
270	0.49
271	0.46
272	0.45
273	0.43
274	0.4
275	0.38
276	0.31
277	0.23
278	0.15
279	0.11
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.1
286	0.12
287	0.11
288	0.11
289	0.13
290	0.13
291	0.12
292	0.12
293	0.13
294	0.15
295	0.19
296	0.26
297	0.3
298	0.37
299	0.45
300	0.51
301	0.57
302	0.6
303	0.62
304	0.63
305	0.62
306	0.64
307	0.64
308	0.62
309	0.56
310	0.49
311	0.45
312	0.4
313	0.37
314	0.28
315	0.22
316	0.19
317	0.19
318	0.19
319	0.16
320	0.13
321	0.12
322	0.16
323	0.15
324	0.13
325	0.14
326	0.14
327	0.2
328	0.25
329	0.25
330	0.26
331	0.29
332	0.3
333	0.32
334	0.34
335	0.29
336	0.25
337	0.28
338	0.26
339	0.28
340	0.31
341	0.28
342	0.27
343	0.26
344	0.25
345	0.21
346	0.21
347	0.16
348	0.13
349	0.13
350	0.12
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.1
355	0.11
356	0.12
357	0.11
358	0.12
359	0.16
360	0.2
361	0.19
362	0.18
363	0.23
364	0.27
365	0.33
366	0.33
367	0.31
368	0.28
369	0.3
370	0.3
371	0.23
372	0.2
373	0.21
374	0.2
375	0.22
376	0.22
377	0.19
378	0.2
379	0.19
380	0.17
381	0.1
382	0.11
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.11
390	0.17
391	0.18
392	0.21
393	0.25
394	0.28
395	0.29
396	0.32
397	0.31
398	0.25
399	0.25
400	0.25
401	0.22
402	0.21
403	0.21
404	0.22
405	0.22
406	0.22
407	0.22
408	0.19
409	0.2
410	0.21
411	0.2
412	0.19
413	0.23
414	0.24
415	0.3
416	0.41
417	0.47
418	0.5
419	0.57
420	0.62
421	0.67
422	0.71
423	0.71
424	0.65
425	0.59
426	0.59
427	0.58
428	0.51
429	0.5
430	0.52
431	0.54
432	0.59
433	0.61
434	0.64
435	0.67
436	0.74
437	0.77
438	0.79
439	0.82
440	0.8
441	0.86
442	0.78
443	0.75
444	0.75
445	0.71
446	0.64
447	0.56
448	0.56
449	0.47
450	0.44
451	0.48

A0A178ZN25

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer