Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z5I3

Protein Details
Accession A0A178Z5I3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-250RQLKRERKGHKITQQEKKETKKDIKGRLRRELIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-247KRERKGHKITQQEKKETKKDIKGRLRR
270-276RRRKRAG
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019189  Ribosomal_L27/L41_mit  
Gene Ontology GO:0005762  C:mitochondrial large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF09809  MRP-L27  
Amino Acid Sequences MVKPSPQLCARLRFTTKQVGRGFYRGNRAGAMGAHTEYGRYVIDWRKTVHYNMPEMKDFPLTPFVTMEMEPKSRAEDRPDGTTYVPDRVDALEFLRTWKKINPLEYDGIVAHQEEERRRFAAATIEQNREEAQEQARQEAQQEAQQWAREQGQQQTKKQIQKQVQQQTRSLHTSRRLRTPAQAPVAPEQPDQPVKEWSQMSRAEKKGLVNQATTSELRQLKRERKGHKITQQEKKETKKDIKGRLRRELIGEGIFQDEKELQKLLTEEGRRRKRAGLPRATDEEKSRFLEGLQRKPESRGLFDRIFGGGKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.6
4 0.6
5 0.59
6 0.56
7 0.54
8 0.56
9 0.57
10 0.52
11 0.58
12 0.53
13 0.49
14 0.44
15 0.41
16 0.36
17 0.3
18 0.27
19 0.19
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.1
27 0.09
28 0.14
29 0.2
30 0.26
31 0.29
32 0.32
33 0.36
34 0.39
35 0.42
36 0.45
37 0.43
38 0.45
39 0.48
40 0.5
41 0.47
42 0.45
43 0.43
44 0.38
45 0.33
46 0.28
47 0.28
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.2
55 0.17
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.21
60 0.22
61 0.25
62 0.28
63 0.32
64 0.33
65 0.38
66 0.39
67 0.36
68 0.33
69 0.36
70 0.31
71 0.28
72 0.25
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.14
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.15
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.23
86 0.3
87 0.31
88 0.36
89 0.39
90 0.39
91 0.4
92 0.39
93 0.36
94 0.28
95 0.24
96 0.19
97 0.14
98 0.1
99 0.09
100 0.12
101 0.14
102 0.17
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.18
108 0.22
109 0.22
110 0.28
111 0.31
112 0.33
113 0.33
114 0.33
115 0.33
116 0.27
117 0.24
118 0.17
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.18
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.22
139 0.29
140 0.34
141 0.35
142 0.42
143 0.46
144 0.5
145 0.53
146 0.54
147 0.52
148 0.54
149 0.61
150 0.63
151 0.63
152 0.6
153 0.59
154 0.55
155 0.52
156 0.49
157 0.41
158 0.35
159 0.38
160 0.43
161 0.43
162 0.47
163 0.47
164 0.44
165 0.49
166 0.49
167 0.48
168 0.44
169 0.42
170 0.36
171 0.35
172 0.37
173 0.33
174 0.28
175 0.22
176 0.21
177 0.23
178 0.22
179 0.21
180 0.21
181 0.21
182 0.26
183 0.26
184 0.23
185 0.25
186 0.3
187 0.33
188 0.38
189 0.39
190 0.36
191 0.37
192 0.39
193 0.4
194 0.41
195 0.38
196 0.31
197 0.29
198 0.28
199 0.29
200 0.27
201 0.22
202 0.22
203 0.24
204 0.24
205 0.3
206 0.37
207 0.43
208 0.52
209 0.59
210 0.58
211 0.64
212 0.72
213 0.75
214 0.74
215 0.77
216 0.77
217 0.79
218 0.82
219 0.81
220 0.8
221 0.79
222 0.78
223 0.76
224 0.75
225 0.75
226 0.75
227 0.76
228 0.79
229 0.8
230 0.81
231 0.82
232 0.78
233 0.71
234 0.66
235 0.58
236 0.51
237 0.43
238 0.35
239 0.26
240 0.24
241 0.22
242 0.17
243 0.16
244 0.14
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.22
253 0.27
254 0.33
255 0.43
256 0.53
257 0.55
258 0.57
259 0.6
260 0.63
261 0.67
262 0.7
263 0.69
264 0.66
265 0.7
266 0.74
267 0.71
268 0.65
269 0.6
270 0.55
271 0.5
272 0.46
273 0.4
274 0.33
275 0.3
276 0.36
277 0.39
278 0.43
279 0.46
280 0.48
281 0.49
282 0.52
283 0.59
284 0.54
285 0.53
286 0.5
287 0.5
288 0.47
289 0.46
290 0.44
291 0.39