Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9DM11

Protein Details
Accession J9DM11    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-264AFSSQNIKRKSQKRNDVKRPNFQKPTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-259NIKRKSQKRNDVKRPNF
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Amino Acid Sequences MKPSILQGMKSSFNIIYSGQDTDRRCIITMPSDIKTLQNPVAITREKSEEIDDTSKNLSKKKSEAIEIEDEEYLRLKDKEKNPLTITDADQKAFTGVLQDTNVAGLNLNENYFVLINMGDSFRMWPIKYWYRFNQKTSCDLTLEEIEMRMSKKGDKFKDYRKIKKEDKEIDYEEEFADDSENDVTLVEEQETELSNLGKELKKIMKNYEDESSEETSEDKEKEKEKETKGDGSDKKGAFSSQNIKRKSQKRNDVKRPNFQKPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.2
3 0.2
4 0.18
5 0.2
6 0.19
7 0.25
8 0.26
9 0.29
10 0.31
11 0.29
12 0.28
13 0.27
14 0.28
15 0.28
16 0.32
17 0.33
18 0.31
19 0.32
20 0.32
21 0.32
22 0.32
23 0.3
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.23
28 0.29
29 0.3
30 0.29
31 0.27
32 0.29
33 0.27
34 0.28
35 0.28
36 0.23
37 0.26
38 0.28
39 0.26
40 0.24
41 0.26
42 0.29
43 0.29
44 0.32
45 0.31
46 0.32
47 0.36
48 0.41
49 0.41
50 0.43
51 0.44
52 0.44
53 0.45
54 0.42
55 0.39
56 0.32
57 0.28
58 0.23
59 0.21
60 0.15
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.21
65 0.27
66 0.37
67 0.39
68 0.46
69 0.45
70 0.47
71 0.48
72 0.43
73 0.4
74 0.37
75 0.35
76 0.29
77 0.27
78 0.24
79 0.2
80 0.17
81 0.14
82 0.08
83 0.07
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.15
114 0.23
115 0.26
116 0.31
117 0.36
118 0.45
119 0.49
120 0.52
121 0.52
122 0.46
123 0.49
124 0.48
125 0.42
126 0.32
127 0.29
128 0.27
129 0.21
130 0.19
131 0.14
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.12
139 0.17
140 0.25
141 0.29
142 0.35
143 0.4
144 0.48
145 0.58
146 0.64
147 0.69
148 0.69
149 0.73
150 0.75
151 0.77
152 0.78
153 0.76
154 0.71
155 0.68
156 0.63
157 0.58
158 0.5
159 0.43
160 0.33
161 0.24
162 0.2
163 0.13
164 0.11
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.18
188 0.25
189 0.3
190 0.34
191 0.4
192 0.43
193 0.45
194 0.48
195 0.47
196 0.41
197 0.38
198 0.39
199 0.35
200 0.28
201 0.24
202 0.22
203 0.18
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.21
208 0.26
209 0.31
210 0.39
211 0.46
212 0.47
213 0.55
214 0.56
215 0.59
216 0.58
217 0.62
218 0.58
219 0.57
220 0.6
221 0.51
222 0.48
223 0.42
224 0.4
225 0.33
226 0.36
227 0.39
228 0.4
229 0.48
230 0.5
231 0.56
232 0.64
233 0.7
234 0.74
235 0.75
236 0.76
237 0.79
238 0.87
239 0.92
240 0.93
241 0.93
242 0.93
243 0.92
244 0.92