FuNGI

A0A178ZE39

Protein Details

Accession

A0A178ZE39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-43	GAARPRPRAGIQRKTKAEREQFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-75	PRGGAARPRPRAGIQRKTKAEREQFAKEEAERQKARAAEQGGSNRGTRGGRGISRGGR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPDETPATPATTNARSTPRGGAARPRPRAGIQRKTKAEREQFAKEEAERQKARAAEQGGSNRGTRGGRGISRGGRGGTAAGQRDEPVAGGGVFGAGSGTRLPTKSRTSYEGYGELLEGGVRGAEDGLQDASASGRGAATGHNGSGAAGTSAGGKGGSSRTAGDLVMTMDDEVDHGHKRDIERIMISSDEDDEDIVTSTSRKGKQKITGDTKQVPGRGLALRPVRAPRTVKVEEGQEGDPARLRSKKSRTAAGLKVDAETQELDSKSEQDEDTEEVDSESLQFIKEQPSSPEMRKRTLKKQLAAGKVGREVKGPVTETGEERAERLRAMEDVQKLRHSFVPAPATDTKMKVDEEDESAPTREAMDRLHDGQFFLFQLPPLTPFLVDSATTHTGEPRVKIEPTTAVSLDALEEHTAGAANTTIGPEIKADPDAPAKATKPDLQMDGLLTALEPTRLPAGIVGKLRVHRSGKVTLDWGGTDMEVRYGAEVDFLQDVVLVEPGQKPEEVTQGGNGEGEDQNGDVIGGGSGGGDGDDETAQKEKKDIKGTAYALGPVRRKMVLIPDWVKLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.35
3	0.38
4	0.41
5	0.43
6	0.43
7	0.44
8	0.49
9	0.54
10	0.62
11	0.65
12	0.63
13	0.59
14	0.6
15	0.67
16	0.67
17	0.67
18	0.67
19	0.71
20	0.77
21	0.8
22	0.83
23	0.82
24	0.81
25	0.79
26	0.76
27	0.74
28	0.67
29	0.64
30	0.6
31	0.51
32	0.51
33	0.48
34	0.51
35	0.44
36	0.43
37	0.44
38	0.43
39	0.43
40	0.41
41	0.38
42	0.32
43	0.37
44	0.42
45	0.41
46	0.41
47	0.4
48	0.33
49	0.35
50	0.31
51	0.26
52	0.24
53	0.27
54	0.28
55	0.31
56	0.37
57	0.37
58	0.39
59	0.41
60	0.36
61	0.3
62	0.27
63	0.24
64	0.22
65	0.23
66	0.23
67	0.22
68	0.22
69	0.22
70	0.22
71	0.21
72	0.16
73	0.12
74	0.1
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.06
79	0.05
80	0.05
81	0.04
82	0.03
83	0.04
84	0.05
85	0.07
86	0.09
87	0.1
88	0.13
89	0.19
90	0.26
91	0.31
92	0.34
93	0.37
94	0.42
95	0.44
96	0.46
97	0.42
98	0.37
99	0.31
100	0.27
101	0.22
102	0.16
103	0.12
104	0.08
105	0.05
106	0.04
107	0.04
108	0.03
109	0.03
110	0.04
111	0.04
112	0.05
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.06
124	0.06
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.06
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.05
140	0.05
141	0.06
142	0.07
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.1
147	0.12
148	0.12
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.07
160	0.08
161	0.09
162	0.1
163	0.13
164	0.14
165	0.2
166	0.22
167	0.22
168	0.22
169	0.23
170	0.22
171	0.21
172	0.2
173	0.14
174	0.12
175	0.1
176	0.09
177	0.08
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.08
185	0.14
186	0.2
187	0.25
188	0.29
189	0.36
190	0.44
191	0.52
192	0.59
193	0.62
194	0.63
195	0.64
196	0.63
197	0.62
198	0.57
199	0.5
200	0.41
201	0.32
202	0.29
203	0.25
204	0.21
205	0.23
206	0.23
207	0.23
208	0.25
209	0.28
210	0.27
211	0.3
212	0.32
213	0.28
214	0.33
215	0.34
216	0.33
217	0.31
218	0.31
219	0.27
220	0.28
221	0.26
222	0.19
223	0.18
224	0.17
225	0.17
226	0.16
227	0.17
228	0.18
229	0.21
230	0.27
231	0.34
232	0.42
233	0.43
234	0.48
235	0.5
236	0.53
237	0.55
238	0.51
239	0.47
240	0.38
241	0.36
242	0.3
243	0.25
244	0.18
245	0.14
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.11
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.11
255	0.08
256	0.1
257	0.1
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.07
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.09
271	0.11
272	0.11
273	0.13
274	0.16
275	0.19
276	0.22
277	0.29
278	0.28
279	0.33
280	0.39
281	0.43
282	0.49
283	0.57
284	0.6
285	0.55
286	0.61
287	0.62
288	0.59
289	0.58
290	0.5
291	0.41
292	0.4
293	0.4
294	0.32
295	0.25
296	0.22
297	0.19
298	0.2
299	0.2
300	0.15
301	0.16
302	0.17
303	0.17
304	0.18
305	0.18
306	0.15
307	0.14
308	0.15
309	0.13
310	0.12
311	0.11
312	0.1
313	0.09
314	0.11
315	0.15
316	0.18
317	0.21
318	0.23
319	0.25
320	0.25
321	0.26
322	0.27
323	0.25
324	0.22
325	0.24
326	0.28
327	0.24
328	0.29
329	0.28
330	0.29
331	0.28
332	0.27
333	0.23
334	0.2
335	0.2
336	0.16
337	0.16
338	0.14
339	0.16
340	0.16
341	0.16
342	0.16
343	0.16
344	0.15
345	0.14
346	0.13
347	0.11
348	0.1
349	0.1
350	0.12
351	0.14
352	0.17
353	0.2
354	0.19
355	0.18
356	0.18
357	0.18
358	0.15
359	0.13
360	0.11
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.13
374	0.16
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.19
379	0.21
380	0.22
381	0.19
382	0.19
383	0.19
384	0.2
385	0.21
386	0.21
387	0.21
388	0.23
389	0.2
390	0.18
391	0.17
392	0.16
393	0.15
394	0.11
395	0.09
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.08
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.12
416	0.16
417	0.16
418	0.17
419	0.18
420	0.19
421	0.21
422	0.24
423	0.26
424	0.26
425	0.28
426	0.29
427	0.27
428	0.27
429	0.24
430	0.21
431	0.16
432	0.12
433	0.09
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.1
443	0.13
444	0.17
445	0.19
446	0.21
447	0.24
448	0.28
449	0.3
450	0.35
451	0.35
452	0.34
453	0.37
454	0.42
455	0.41
456	0.4
457	0.4
458	0.35
459	0.34
460	0.29
461	0.25
462	0.19
463	0.15
464	0.14
465	0.12
466	0.1
467	0.09
468	0.09
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.08
484	0.11
485	0.13
486	0.13
487	0.13
488	0.14
489	0.16
490	0.22
491	0.22
492	0.21
493	0.22
494	0.22
495	0.22
496	0.21
497	0.19
498	0.16
499	0.14
500	0.14
501	0.11
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.05
518	0.06
519	0.06
520	0.08
521	0.14
522	0.15
523	0.16
524	0.21
525	0.27
526	0.35
527	0.43
528	0.45
529	0.45
530	0.53
531	0.54
532	0.53
533	0.47
534	0.44
535	0.4
536	0.44
537	0.42
538	0.36
539	0.38
540	0.33
541	0.33
542	0.31
543	0.36
544	0.35
545	0.41
546	0.42
547	0.42

A0A178ZE39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer