Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z813

Protein Details
Accession A0A178Z813    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-153GNTKLTSKVKRIKGNKRDSSSHydrophilic
366-393LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-200KAKIKTSRKKSPVTSKGAESAPTLKRK
372-385KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 11, mito 1, pero 1, E.R. 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MKVTSLESSHDDPKPSSQVLSLVSSFLAEHGFHSTAKALTKELKRMNRSVEVLALGDSQGGANLQEIVENWNKKEKLQSAQSSSDDDLSDLSESATSGSSSASSGDESDASTSSEDTSAQDSESESGDDEEKGNTKLTSKVKRIKGNKRDSSSSSSSSASSDSDADDERETGAKAKIKTSRKKSPVTSKGAESAPTLKRKARSSSPESSSSDSDSDSSDEDRPAKRAKIDANNETDEASSSEVSSSSDEESDDANDSASAAEQVKDEEMVTDTSQEQATPDDAADGVSESSSGTVTGVVIEPNGSSVREIEAIMNRGNKQVVAGKKAHEGARPTPLARLSAQATADSHISNAYQSYDYAERAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISGGKGFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.38
3 0.35
4 0.29
5 0.29
6 0.29
7 0.32
8 0.26
9 0.21
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.14
14 0.13
15 0.09
16 0.09
17 0.13
18 0.15
19 0.14
20 0.16
21 0.17
22 0.18
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.27
27 0.33
28 0.41
29 0.47
30 0.54
31 0.57
32 0.61
33 0.65
34 0.63
35 0.6
36 0.53
37 0.47
38 0.38
39 0.33
40 0.28
41 0.22
42 0.15
43 0.12
44 0.1
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.12
55 0.18
56 0.2
57 0.22
58 0.3
59 0.3
60 0.31
61 0.39
62 0.4
63 0.41
64 0.48
65 0.54
66 0.52
67 0.57
68 0.57
69 0.52
70 0.47
71 0.41
72 0.32
73 0.24
74 0.18
75 0.14
76 0.13
77 0.1
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.19
124 0.27
125 0.34
126 0.41
127 0.49
128 0.55
129 0.64
130 0.73
131 0.76
132 0.79
133 0.81
134 0.81
135 0.77
136 0.75
137 0.7
138 0.67
139 0.6
140 0.53
141 0.44
142 0.36
143 0.31
144 0.27
145 0.24
146 0.17
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.12
160 0.15
161 0.16
162 0.21
163 0.28
164 0.37
165 0.46
166 0.52
167 0.59
168 0.62
169 0.67
170 0.7
171 0.73
172 0.73
173 0.71
174 0.65
175 0.56
176 0.53
177 0.47
178 0.41
179 0.31
180 0.29
181 0.26
182 0.28
183 0.29
184 0.27
185 0.31
186 0.34
187 0.38
188 0.39
189 0.41
190 0.44
191 0.5
192 0.51
193 0.51
194 0.49
195 0.47
196 0.41
197 0.35
198 0.28
199 0.21
200 0.17
201 0.13
202 0.12
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.15
208 0.15
209 0.17
210 0.2
211 0.21
212 0.2
213 0.23
214 0.28
215 0.34
216 0.4
217 0.42
218 0.43
219 0.43
220 0.42
221 0.38
222 0.32
223 0.23
224 0.17
225 0.13
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.05
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.15
299 0.18
300 0.2
301 0.24
302 0.23
303 0.24
304 0.24
305 0.21
306 0.2
307 0.24
308 0.26
309 0.28
310 0.29
311 0.3
312 0.34
313 0.39
314 0.4
315 0.37
316 0.38
317 0.36
318 0.42
319 0.42
320 0.38
321 0.37
322 0.36
323 0.34
324 0.3
325 0.29
326 0.23
327 0.25
328 0.24
329 0.22
330 0.21
331 0.2
332 0.21
333 0.17
334 0.15
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.15
343 0.17
344 0.17
345 0.19
346 0.22
347 0.21
348 0.22
349 0.23
350 0.2
351 0.2
352 0.23
353 0.26
354 0.31
355 0.32
356 0.34
357 0.38
358 0.38
359 0.43
360 0.47
361 0.51
362 0.55
363 0.64
364 0.71
365 0.76
366 0.85
367 0.87
368 0.9
369 0.91
370 0.9
371 0.9
372 0.87
373 0.86
374 0.84
375 0.78
376 0.67
377 0.56
378 0.49
379 0.4
380 0.33
381 0.25
382 0.17
383 0.14