FuNGI

A0A178Z693

Protein Details

Accession

A0A178Z693

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
143-162	SEFPKPVRLHRRDPRAPPPG	Basic
207-227	PSQNTGKKMNFKKKTQQVFRP	Hydrophilic
536-559	GTDVSSRKKKLKSKHLPSSQPTPG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-39	GAPPMIRRKKPMSDPFFKGPRSK
424-442	KREAEARKKNFRDLRKALE
500-505	RKEKKG
542-549	RKKKLKSK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNPGSAPSGGPATRPPGAPPMIRRKKPMSDPFFKGPRSKPAATKPQLNGHLTPPVNVNLNINGHPPPKSQPMNALAPRASSPTIATIPDRERVSGFSDPRVTAEGISYTDYKLVTTKRDLLNGLRYHILQLAGDKPIDIRNESEFPKPVRLHRRDPRAPPPGQQQEKKEEEQVEPKDGLNAAEREELNRRKEVRQKEREANLAQIAPSQNTGKKMNFKKKTQQVFRPDFSAEEKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDNKHCFIGHHQIGSVSSNAAFVYEPAVDASTGKFRLIPIEKVYQFKPKRENLQKMTIEEVEAAMKKGGSDPEWLIRHREARIQEALKERAVRESRALFSGAARTTVDAGRTGEEADLDYEDDFADDEEGDLFVDKDEDEKLAEKRIKEDQLQANFLDFKDLKEYDEAEAREKREAEARKKNFRDLRKALERRERNYNHGSDSENESSTDSEEERERIERERLANVKKEEEAEAKKSALSSGANTPSGRKEKKGSDREDEGGMKKSTSTRSLKRPGSPNLSDASGTDVSSRKKKLKSKHLPSSQPTPGHSRPMSPVNVPPSSSAPQTLDPLAALKARKRAGAASPIGAGSDTDTDAAAMSDSSRAQRRLKLKMSASPPPTGAAGTASPPAQPSSRAASPTPVSAGGSVPRPVAFPSAQDIKNAIPPQGITVKDLMKVVAHPKDKQKEFVALVKEVASYDKERGVLLPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.28
3	0.3
4	0.35
5	0.39
6	0.45
7	0.5
8	0.58
9	0.62
10	0.67
11	0.67
12	0.72
13	0.77
14	0.79
15	0.77
16	0.75
17	0.78
18	0.79
19	0.79
20	0.74
21	0.72
22	0.66
23	0.67
24	0.66
25	0.64
26	0.63
27	0.66
28	0.73
29	0.7
30	0.74
31	0.69
32	0.7
33	0.73
34	0.69
35	0.61
36	0.53
37	0.57
38	0.48
39	0.43
40	0.37
41	0.32
42	0.32
43	0.3
44	0.29
45	0.25
46	0.28
47	0.27
48	0.27
49	0.29
50	0.27
51	0.29
52	0.29
53	0.3
54	0.36
55	0.4
56	0.39
57	0.42
58	0.46
59	0.53
60	0.53
61	0.53
62	0.44
63	0.41
64	0.41
65	0.36
66	0.31
67	0.22
68	0.2
69	0.2
70	0.21
71	0.21
72	0.21
73	0.24
74	0.26
75	0.31
76	0.31
77	0.28
78	0.27
79	0.27
80	0.31
81	0.32
82	0.31
83	0.31
84	0.34
85	0.33
86	0.34
87	0.35
88	0.3
89	0.23
90	0.22
91	0.18
92	0.15
93	0.17
94	0.17
95	0.14
96	0.15
97	0.15
98	0.14
99	0.17
100	0.18
101	0.21
102	0.25
103	0.32
104	0.33
105	0.37
106	0.39
107	0.39
108	0.45
109	0.42
110	0.4
111	0.34
112	0.32
113	0.3
114	0.29
115	0.25
116	0.16
117	0.17
118	0.17
119	0.17
120	0.16
121	0.15
122	0.14
123	0.18
124	0.19
125	0.18
126	0.17
127	0.2
128	0.25
129	0.28
130	0.31
131	0.32
132	0.32
133	0.39
134	0.4
135	0.44
136	0.51
137	0.55
138	0.61
139	0.65
140	0.74
141	0.73
142	0.79
143	0.8
144	0.78
145	0.74
146	0.69
147	0.71
148	0.71
149	0.71
150	0.69
151	0.64
152	0.64
153	0.67
154	0.64
155	0.59
156	0.52
157	0.47
158	0.5
159	0.47
160	0.42
161	0.38
162	0.35
163	0.31
164	0.28
165	0.25
166	0.21
167	0.19
168	0.17
169	0.2
170	0.2
171	0.21
172	0.29
173	0.34
174	0.33
175	0.39
176	0.4
177	0.43
178	0.51
179	0.59
180	0.62
181	0.66
182	0.71
183	0.73
184	0.74
185	0.74
186	0.68
187	0.6
188	0.52
189	0.43
190	0.34
191	0.29
192	0.25
193	0.19
194	0.19
195	0.18
196	0.18
197	0.21
198	0.25
199	0.25
200	0.34
201	0.43
202	0.52
203	0.57
204	0.62
205	0.68
206	0.74
207	0.8
208	0.8
209	0.79
210	0.79
211	0.78
212	0.73
213	0.66
214	0.57
215	0.48
216	0.45
217	0.46
218	0.38
219	0.38
220	0.39
221	0.38
222	0.42
223	0.42
224	0.4
225	0.39
226	0.46
227	0.43
228	0.44
229	0.43
230	0.39
231	0.44
232	0.42
233	0.33
234	0.25
235	0.23
236	0.2
237	0.27
238	0.3
239	0.31
240	0.32
241	0.31
242	0.3
243	0.28
244	0.27
245	0.24
246	0.29
247	0.24
248	0.22
249	0.22
250	0.23
251	0.23
252	0.23
253	0.19
254	0.1
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.05
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.09
270	0.1
271	0.09
272	0.1
273	0.1
274	0.17
275	0.19
276	0.21
277	0.21
278	0.28
279	0.3
280	0.33
281	0.34
282	0.38
283	0.38
284	0.41
285	0.45
286	0.43
287	0.52
288	0.59
289	0.66
290	0.61
291	0.68
292	0.65
293	0.58
294	0.56
295	0.45
296	0.36
297	0.27
298	0.22
299	0.14
300	0.11
301	0.11
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.09
307	0.08
308	0.1
309	0.11
310	0.18
311	0.2
312	0.21
313	0.22
314	0.24
315	0.26
316	0.24
317	0.28
318	0.23
319	0.24
320	0.29
321	0.27
322	0.29
323	0.32
324	0.32
325	0.29
326	0.3
327	0.26
328	0.28
329	0.29
330	0.25
331	0.23
332	0.24
333	0.23
334	0.22
335	0.23
336	0.15
337	0.14
338	0.17
339	0.14
340	0.12
341	0.11
342	0.1
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.03
372	0.04
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.08
379	0.09
380	0.15
381	0.18
382	0.17
383	0.2
384	0.26
385	0.28
386	0.28
387	0.35
388	0.36
389	0.36
390	0.38
391	0.35
392	0.3
393	0.28
394	0.26
395	0.23
396	0.16
397	0.13
398	0.16
399	0.17
400	0.16
401	0.16
402	0.18
403	0.14
404	0.19
405	0.19
406	0.19
407	0.22
408	0.22
409	0.23
410	0.22
411	0.22
412	0.24
413	0.31
414	0.36
415	0.43
416	0.5
417	0.57
418	0.59
419	0.67
420	0.67
421	0.67
422	0.68
423	0.62
424	0.64
425	0.65
426	0.68
427	0.67
428	0.71
429	0.7
430	0.63
431	0.69
432	0.63
433	0.58
434	0.59
435	0.54
436	0.47
437	0.42
438	0.4
439	0.32
440	0.35
441	0.31
442	0.25
443	0.23
444	0.21
445	0.19
446	0.18
447	0.17
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.11
452	0.12
453	0.14
454	0.15
455	0.17
456	0.2
457	0.22
458	0.23
459	0.29
460	0.34
461	0.36
462	0.42
463	0.4
464	0.4
465	0.37
466	0.36
467	0.32
468	0.32
469	0.32
470	0.29
471	0.28
472	0.26
473	0.25
474	0.24
475	0.21
476	0.17
477	0.14
478	0.13
479	0.17
480	0.19
481	0.21
482	0.21
483	0.23
484	0.28
485	0.36
486	0.35
487	0.33
488	0.36
489	0.43
490	0.54
491	0.61
492	0.6
493	0.59
494	0.61
495	0.6
496	0.58
497	0.52
498	0.44
499	0.4
500	0.35
501	0.28
502	0.24
503	0.26
504	0.25
505	0.3
506	0.35
507	0.36
508	0.45
509	0.55
510	0.59
511	0.63
512	0.67
513	0.67
514	0.68
515	0.63
516	0.56
517	0.48
518	0.44
519	0.37
520	0.29
521	0.27
522	0.19
523	0.17
524	0.17
525	0.19
526	0.22
527	0.29
528	0.34
529	0.36
530	0.44
531	0.51
532	0.59
533	0.66
534	0.73
535	0.77
536	0.83
537	0.85
538	0.86
539	0.83
540	0.82
541	0.78
542	0.7
543	0.62
544	0.6
545	0.53
546	0.52
547	0.48
548	0.42
549	0.39
550	0.42
551	0.42
552	0.36
553	0.38
554	0.36
555	0.37
556	0.35
557	0.33
558	0.31
559	0.31
560	0.29
561	0.26
562	0.22
563	0.23
564	0.24
565	0.23
566	0.18
567	0.16
568	0.16
569	0.15
570	0.16
571	0.17
572	0.18
573	0.25
574	0.26
575	0.28
576	0.28
577	0.3
578	0.32
579	0.38
580	0.37
581	0.31
582	0.3
583	0.29
584	0.27
585	0.23
586	0.18
587	0.11
588	0.1
589	0.09
590	0.08
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.06
596	0.05
597	0.05
598	0.07
599	0.08
600	0.13
601	0.19
602	0.24
603	0.27
604	0.35
605	0.42
606	0.5
607	0.56
608	0.6
609	0.58
610	0.62
611	0.64
612	0.66
613	0.62
614	0.56
615	0.49
616	0.42
617	0.38
618	0.3
619	0.24
620	0.17
621	0.15
622	0.13
623	0.15
624	0.14
625	0.13
626	0.14
627	0.16
628	0.15
629	0.16
630	0.18
631	0.23
632	0.26
633	0.29
634	0.29
635	0.33
636	0.33
637	0.33
638	0.32
639	0.26
640	0.23
641	0.21
642	0.22
643	0.18
644	0.2
645	0.19
646	0.18
647	0.18
648	0.18
649	0.19
650	0.22
651	0.19
652	0.17
653	0.22
654	0.29
655	0.3
656	0.3
657	0.31
658	0.28
659	0.36
660	0.35
661	0.3
662	0.24
663	0.23
664	0.27
665	0.31
666	0.29
667	0.24
668	0.27
669	0.27
670	0.28
671	0.28
672	0.24
673	0.19
674	0.22
675	0.28
676	0.32
677	0.36
678	0.4
679	0.5
680	0.59
681	0.62
682	0.64
683	0.6
684	0.59
685	0.58
686	0.59
687	0.54
688	0.46
689	0.43
690	0.38
691	0.34
692	0.27
693	0.25
694	0.22
695	0.19
696	0.21
697	0.23
698	0.22
699	0.22

A0A178Z693

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer