Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZD11

Protein Details
Accession A0A178ZD11    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-296RKSEASTSKKKPEQKKPPGPGMDPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-291ARRKSEASTSKKKPEQKKPPG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
IPR021935  SGSM1/2_RBD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF12068  PH_RBD  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MTSGPSSRREAPSPSASFYDLSDDEEGGYNTITHASATKGVKLLFSKSKVYVHPTPSAKDNIPGFIALVQQKCPALADEGQRPTSADSSSKKKTNASSYLLAWVPEASLAQDDLSTYVKVDMKDGESPPRQSYLVPPLPLATTFDESPVGPYAFSLPLSSIYSIHVRPPSLGWWYGSIVINTRAGSSLPALFFHDSECESTILQKKKRARESFDPFGESGDLFWGGDEVLKWLKRYVTVERSTAEPSIYLIDPSEEDRVGFGQGRKSLEQARRKSEASTSKKKPEQKKPPGPGMDPFTKALKETRWKILEQLSKVTTFTRRTAEDLANNKSLPPQVRRLIQNPEIQTLQDEFDSAKLYLARWAMSIAEQSERERRQRIWTARDVLDSEETSVGDFEILDMEAARMTLTDSKRRPVNMQEWKSFFDSKGKLHVMVEEVKERVFHGGLDPEDGVRKEAWPFLLGVYEWDSTEEERHALMNQKRDEYIQLKGAWWDRMMDGDATPEQEEWWKEQKVRIEKDVHRTDRHIPLFAGEDIPHPDPTSPFFNPHGPGTNVHMEQLKDMLLTYLEYDTPPSTTAANPPRPSSSAQPRRYQTQNPHPQNLGYVQGMSDLLSPLYAVFQDDAIAFWAFVQFMRRMSRNFVRSQLGMRAQLNTLDQLVQLLDPKLYLHLQSADSTNFFFFFRMLLVWFKREFEWSDTLRLWESLWTDYYSSQFHLFIAMAILEKHRDVIMDHLKHFDEVLKYINELSGTIELPDTLWRAEGLFKRFEKTVETIDRKDAFPPPNAGQTDAELRHRKPGEAASAGEETHPVASASGAASSAASSRDQNPPTSPGRRGPQQAAKGKEAEKATERVITPELRLLLSHKIVTLDGEDGSGDVERTRPSGLKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.47
3 0.43
4 0.39
5 0.34
6 0.33
7 0.24
8 0.24
9 0.22
10 0.2
11 0.19
12 0.21
13 0.2
14 0.15
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.11
23 0.18
24 0.2
25 0.22
26 0.24
27 0.25
28 0.29
29 0.3
30 0.35
31 0.36
32 0.38
33 0.4
34 0.41
35 0.46
36 0.46
37 0.51
38 0.52
39 0.49
40 0.54
41 0.53
42 0.52
43 0.52
44 0.53
45 0.47
46 0.46
47 0.42
48 0.36
49 0.33
50 0.3
51 0.25
52 0.21
53 0.25
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.24
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.19
62 0.18
63 0.21
64 0.26
65 0.31
66 0.36
67 0.37
68 0.36
69 0.36
70 0.34
71 0.31
72 0.27
73 0.25
74 0.26
75 0.33
76 0.41
77 0.46
78 0.47
79 0.5
80 0.55
81 0.58
82 0.6
83 0.58
84 0.54
85 0.49
86 0.52
87 0.47
88 0.39
89 0.3
90 0.23
91 0.17
92 0.13
93 0.12
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.13
105 0.16
106 0.16
107 0.18
108 0.19
109 0.21
110 0.26
111 0.28
112 0.33
113 0.35
114 0.39
115 0.39
116 0.39
117 0.36
118 0.31
119 0.35
120 0.37
121 0.38
122 0.35
123 0.33
124 0.31
125 0.32
126 0.31
127 0.28
128 0.22
129 0.19
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.19
135 0.19
136 0.16
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.1
144 0.12
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.14
149 0.18
150 0.18
151 0.22
152 0.23
153 0.21
154 0.22
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.24
159 0.21
160 0.2
161 0.21
162 0.23
163 0.23
164 0.2
165 0.19
166 0.19
167 0.2
168 0.18
169 0.17
170 0.14
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.12
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.18
188 0.25
189 0.31
190 0.35
191 0.41
192 0.47
193 0.56
194 0.67
195 0.69
196 0.69
197 0.71
198 0.76
199 0.78
200 0.73
201 0.66
202 0.56
203 0.49
204 0.42
205 0.31
206 0.22
207 0.14
208 0.11
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.19
222 0.23
223 0.29
224 0.34
225 0.36
226 0.37
227 0.36
228 0.38
229 0.37
230 0.33
231 0.25
232 0.16
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.11
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.12
241 0.13
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.14
248 0.14
249 0.17
250 0.2
251 0.24
252 0.24
253 0.26
254 0.32
255 0.38
256 0.45
257 0.47
258 0.5
259 0.51
260 0.51
261 0.5
262 0.5
263 0.52
264 0.52
265 0.56
266 0.56
267 0.61
268 0.67
269 0.74
270 0.76
271 0.77
272 0.8
273 0.81
274 0.84
275 0.82
276 0.85
277 0.81
278 0.73
279 0.67
280 0.62
281 0.55
282 0.46
283 0.41
284 0.33
285 0.28
286 0.27
287 0.25
288 0.25
289 0.29
290 0.31
291 0.38
292 0.39
293 0.39
294 0.41
295 0.46
296 0.46
297 0.4
298 0.4
299 0.33
300 0.31
301 0.32
302 0.3
303 0.28
304 0.25
305 0.26
306 0.25
307 0.24
308 0.26
309 0.3
310 0.31
311 0.33
312 0.35
313 0.36
314 0.35
315 0.34
316 0.31
317 0.28
318 0.29
319 0.27
320 0.25
321 0.28
322 0.3
323 0.35
324 0.39
325 0.41
326 0.45
327 0.46
328 0.48
329 0.42
330 0.4
331 0.36
332 0.32
333 0.29
334 0.23
335 0.17
336 0.12
337 0.1
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.12
357 0.19
358 0.22
359 0.25
360 0.27
361 0.28
362 0.33
363 0.42
364 0.47
365 0.46
366 0.49
367 0.51
368 0.48
369 0.48
370 0.41
371 0.34
372 0.29
373 0.22
374 0.17
375 0.12
376 0.11
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.09
394 0.11
395 0.19
396 0.2
397 0.24
398 0.27
399 0.28
400 0.3
401 0.31
402 0.39
403 0.42
404 0.47
405 0.48
406 0.47
407 0.48
408 0.48
409 0.43
410 0.34
411 0.31
412 0.28
413 0.23
414 0.28
415 0.26
416 0.24
417 0.23
418 0.24
419 0.19
420 0.2
421 0.2
422 0.15
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.12
428 0.09
429 0.07
430 0.07
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.08
440 0.09
441 0.08
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.15
463 0.18
464 0.24
465 0.26
466 0.26
467 0.27
468 0.27
469 0.3
470 0.25
471 0.24
472 0.21
473 0.2
474 0.19
475 0.21
476 0.23
477 0.19
478 0.18
479 0.16
480 0.12
481 0.12
482 0.13
483 0.11
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.1
492 0.11
493 0.13
494 0.19
495 0.2
496 0.21
497 0.24
498 0.3
499 0.37
500 0.39
501 0.41
502 0.44
503 0.46
504 0.55
505 0.61
506 0.59
507 0.52
508 0.52
509 0.52
510 0.52
511 0.49
512 0.41
513 0.32
514 0.28
515 0.29
516 0.26
517 0.21
518 0.13
519 0.13
520 0.14
521 0.16
522 0.15
523 0.13
524 0.13
525 0.12
526 0.15
527 0.19
528 0.17
529 0.18
530 0.21
531 0.23
532 0.24
533 0.26
534 0.27
535 0.23
536 0.23
537 0.24
538 0.27
539 0.24
540 0.23
541 0.24
542 0.2
543 0.19
544 0.19
545 0.14
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.17
563 0.24
564 0.31
565 0.32
566 0.33
567 0.35
568 0.36
569 0.38
570 0.38
571 0.41
572 0.44
573 0.48
574 0.54
575 0.55
576 0.59
577 0.62
578 0.61
579 0.6
580 0.6
581 0.66
582 0.64
583 0.66
584 0.6
585 0.55
586 0.5
587 0.42
588 0.33
589 0.23
590 0.17
591 0.12
592 0.12
593 0.12
594 0.1
595 0.09
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.06
615 0.07
616 0.1
617 0.09
618 0.12
619 0.17
620 0.2
621 0.21
622 0.28
623 0.36
624 0.37
625 0.39
626 0.41
627 0.4
628 0.39
629 0.4
630 0.4
631 0.35
632 0.35
633 0.32
634 0.3
635 0.26
636 0.27
637 0.25
638 0.19
639 0.16
640 0.12
641 0.11
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.09
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.1
651 0.11
652 0.11
653 0.11
654 0.13
655 0.14
656 0.16
657 0.18
658 0.17
659 0.17
660 0.17
661 0.15
662 0.13
663 0.12
664 0.11
665 0.09
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.14
671 0.15
672 0.19
673 0.2
674 0.21
675 0.21
676 0.23
677 0.25
678 0.24
679 0.29
680 0.27
681 0.31
682 0.3
683 0.31
684 0.29
685 0.26
686 0.22
687 0.18
688 0.18
689 0.15
690 0.16
691 0.16
692 0.16
693 0.16
694 0.18
695 0.17
696 0.17
697 0.17
698 0.15
699 0.14
700 0.14
701 0.13
702 0.11
703 0.1
704 0.09
705 0.08
706 0.08
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.09
712 0.09
713 0.1
714 0.18
715 0.27
716 0.3
717 0.31
718 0.33
719 0.34
720 0.33
721 0.33
722 0.29
723 0.21
724 0.18
725 0.21
726 0.18
727 0.18
728 0.19
729 0.19
730 0.15
731 0.13
732 0.14
733 0.12
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.1
738 0.1
739 0.12
740 0.11
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.1
745 0.16
746 0.22
747 0.24
748 0.3
749 0.31
750 0.34
751 0.35
752 0.35
753 0.33
754 0.31
755 0.36
756 0.39
757 0.44
758 0.43
759 0.5
760 0.52
761 0.47
762 0.47
763 0.46
764 0.4
765 0.38
766 0.42
767 0.37
768 0.42
769 0.42
770 0.42
771 0.35
772 0.34
773 0.37
774 0.34
775 0.4
776 0.38
777 0.38
778 0.45
779 0.45
780 0.43
781 0.4
782 0.43
783 0.41
784 0.38
785 0.38
786 0.33
787 0.33
788 0.32
789 0.28
790 0.23
791 0.16
792 0.13
793 0.13
794 0.08
795 0.07
796 0.07
797 0.08
798 0.08
799 0.07
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.08
805 0.08
806 0.1
807 0.12
808 0.16
809 0.25
810 0.27
811 0.3
812 0.32
813 0.37
814 0.43
815 0.47
816 0.48
817 0.47
818 0.53
819 0.57
820 0.61
821 0.64
822 0.66
823 0.69
824 0.73
825 0.71
826 0.67
827 0.65
828 0.61
829 0.58
830 0.5
831 0.46
832 0.42
833 0.4
834 0.38
835 0.38
836 0.37
837 0.34
838 0.36
839 0.32
840 0.29
841 0.31
842 0.3
843 0.24
844 0.24
845 0.24
846 0.26
847 0.28
848 0.27
849 0.23
850 0.23
851 0.23
852 0.23
853 0.22
854 0.17
855 0.14
856 0.13
857 0.12
858 0.1
859 0.11
860 0.1
861 0.08
862 0.07
863 0.1
864 0.11
865 0.13
866 0.16