Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZFN6

Protein Details
Accession A0A178ZFN6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-147PEPEVDGKKKRKRTPHDPNAPKRALBasic
261-315APAPEPTPPKSKRRKTKEAEPTPSKATPKVEAKSPEKDRKSKKSRREAAAPASTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-139GKKKRKRTPHD
268-324PPKSKRRKTKEAEPTPSKATPKVEAKSPEKDRKSKKSRREAAAPASTKVEKSKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSSSLSHVNPSAAHIEFGHVLNRAAIKCIDVLTEDLATLGELVREVQNDRVAFTHTYHQVIVALATLQSSVQDLSRAYIQHANTVLTPGKHGLNPIDANLTSILTESGLLSARPADAAPAAAPEPEVDGKKKRKRTPHDPNAPKRALTPYFLYMQSARATIAKELGDSAKPKEVADEGTRRWTEMSPAEKSIWDDKYQKNLAAYRVKMAAYKAGQPVPDDETAARLVEMGKAPEHVAGLDAEAETEEEPVEEEEDEEEIPAPAPEPTPPKSKRRKTKEAEPTPSKATPKVEAKSPEKDRKSKKSRREAAAPASTKVEKSKKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.22
10 0.19
11 0.2
12 0.19
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.16
17 0.13
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.07
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.08
31 0.09
32 0.11
33 0.14
34 0.19
35 0.19
36 0.2
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.22
41 0.26
42 0.24
43 0.26
44 0.25
45 0.24
46 0.22
47 0.2
48 0.18
49 0.11
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.08
61 0.09
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.19
66 0.19
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.19
71 0.22
72 0.22
73 0.17
74 0.18
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.2
84 0.17
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.07
112 0.09
113 0.11
114 0.12
115 0.2
116 0.3
117 0.38
118 0.47
119 0.52
120 0.6
121 0.68
122 0.77
123 0.8
124 0.82
125 0.85
126 0.86
127 0.88
128 0.87
129 0.78
130 0.67
131 0.58
132 0.53
133 0.43
134 0.35
135 0.29
136 0.22
137 0.24
138 0.23
139 0.23
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.13
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.18
163 0.2
164 0.18
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.24
169 0.21
170 0.2
171 0.22
172 0.25
173 0.21
174 0.23
175 0.23
176 0.23
177 0.25
178 0.27
179 0.24
180 0.23
181 0.27
182 0.27
183 0.35
184 0.36
185 0.35
186 0.33
187 0.34
188 0.36
189 0.37
190 0.35
191 0.29
192 0.3
193 0.29
194 0.27
195 0.25
196 0.24
197 0.18
198 0.22
199 0.24
200 0.23
201 0.24
202 0.23
203 0.24
204 0.22
205 0.21
206 0.18
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.12
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.1
252 0.15
253 0.19
254 0.28
255 0.34
256 0.44
257 0.54
258 0.64
259 0.72
260 0.77
261 0.84
262 0.83
263 0.88
264 0.89
265 0.89
266 0.89
267 0.85
268 0.8
269 0.75
270 0.72
271 0.64
272 0.57
273 0.5
274 0.48
275 0.5
276 0.48
277 0.49
278 0.53
279 0.55
280 0.61
281 0.67
282 0.69
283 0.7
284 0.76
285 0.79
286 0.82
287 0.87
288 0.87
289 0.88
290 0.89
291 0.9
292 0.89
293 0.88
294 0.85
295 0.84
296 0.84
297 0.76
298 0.66
299 0.62
300 0.55
301 0.48
302 0.48
303 0.48
304 0.46