FuNGI

A0A178ZPB1

Protein Details

Accession

A0A178ZPB1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-41	EASSTKQSSSKPPRRPKRPNYNQIHRHLLP	Hydrophilic
130-154	EENTASRREQRRQAKQERARKEQEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-28	PPRRPK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR006677 tRNA_intron_Endonuc_cat-like IPR006678 tRNA_intron_Endonuc_N IPR006676 tRNA_splic IPR016589 tRNA_splic_SEN2
Gene Ontology	GO:0000214 C:tRNA-intron endonuclease complex GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000213 F:tRNA-intron endonuclease activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF01974 tRNA_int_endo PF02778 tRNA_int_endo_N
CDD	cd22363 tRNA-intron_lyase_C

Amino Acid Sequences

MASASTPPVNVEASSTKQSSSKPPRRPKRPNYNQIHRHLLPIEVHPLPVLIPHNPLSLVAIALSYLVQVLSPPTRPTYNGYFSSATSSIHVTDPQTIRKLWEMGFFGRGSLSRSEPNWLENRQKKGRTAEENTASRREQRRQAKQERARKEQEEIDQKLSEELQQNGNVTGPLNGVLDQDSAPKSNQHGDVNVNGIHASDRPKLDQLPRNGSLNGHINGVLTENVLKTNAQNISDIGSVLESTSWSATPDVEEDKENNSLQGFEEWKKALEANGIPTPPPTSTCSDTSQAEGRPVKKLQRTKTVRFSPTIEAREFDLSSPVISPIKSPGTSPLEDAKAEGDEKPVPQENQEHLNLSLEEAFFLSYALGVLDIYCDDSNTILPPSSLLSLFRRHSYHPPRSLSVPAEPDDPFMISYAVYHHYRSLGWVVRSGVKFSTDYLLYNRGPAFSHAEFAIVIIPSYTHAYWTQSTTPEPCKANERRTSKKSWWWLHGINRVQAQVHKQLVLCYVDVPPPLKDAEKRKDVDIGWLFSRYKIRDVNVRRWTPNRSRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.28
3	0.27
4	0.29
5	0.33
6	0.4
7	0.47
8	0.52
9	0.58
10	0.68
11	0.78
12	0.86
13	0.94
14	0.94
15	0.94
16	0.95
17	0.95
18	0.95
19	0.95
20	0.93
21	0.89
22	0.88
23	0.77
24	0.71
25	0.61
26	0.55
27	0.46
28	0.4
29	0.39
30	0.3
31	0.29
32	0.24
33	0.22
34	0.18
35	0.19
36	0.18
37	0.14
38	0.17
39	0.19
40	0.2
41	0.2
42	0.2
43	0.19
44	0.16
45	0.14
46	0.1
47	0.09
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.05
52	0.04
53	0.04
54	0.04
55	0.04
56	0.08
57	0.11
58	0.13
59	0.15
60	0.19
61	0.21
62	0.23
63	0.28
64	0.32
65	0.36
66	0.36
67	0.39
68	0.36
69	0.35
70	0.39
71	0.34
72	0.27
73	0.22
74	0.21
75	0.18
76	0.18
77	0.19
78	0.15
79	0.22
80	0.25
81	0.28
82	0.3
83	0.29
84	0.3
85	0.32
86	0.34
87	0.28
88	0.3
89	0.28
90	0.27
91	0.3
92	0.27
93	0.24
94	0.22
95	0.21
96	0.18
97	0.17
98	0.18
99	0.19
100	0.2
101	0.25
102	0.25
103	0.29
104	0.32
105	0.34
106	0.42
107	0.45
108	0.53
109	0.57
110	0.6
111	0.61
112	0.63
113	0.67
114	0.66
115	0.66
116	0.65
117	0.65
118	0.66
119	0.64
120	0.6
121	0.53
122	0.52
123	0.53
124	0.51
125	0.52
126	0.57
127	0.64
128	0.7
129	0.79
130	0.82
131	0.84
132	0.87
133	0.87
134	0.85
135	0.81
136	0.73
137	0.68
138	0.63
139	0.62
140	0.61
141	0.56
142	0.51
143	0.44
144	0.42
145	0.38
146	0.32
147	0.28
148	0.22
149	0.21
150	0.2
151	0.2
152	0.21
153	0.2
154	0.2
155	0.16
156	0.13
157	0.12
158	0.09
159	0.08
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.09
165	0.08
166	0.11
167	0.11
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.14
172	0.18
173	0.22
174	0.21
175	0.22
176	0.23
177	0.23
178	0.24
179	0.23
180	0.18
181	0.14
182	0.13
183	0.11
184	0.11
185	0.14
186	0.15
187	0.16
188	0.17
189	0.19
190	0.22
191	0.3
192	0.35
193	0.37
194	0.41
195	0.41
196	0.42
197	0.41
198	0.38
199	0.33
200	0.32
201	0.27
202	0.2
203	0.18
204	0.15
205	0.15
206	0.15
207	0.12
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.11
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.13
220	0.15
221	0.15
222	0.14
223	0.09
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.1
241	0.12
242	0.14
243	0.14
244	0.13
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.14
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.12
257	0.13
258	0.12
259	0.13
260	0.15
261	0.15
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.12
266	0.13
267	0.13
268	0.14
269	0.17
270	0.2
271	0.22
272	0.23
273	0.24
274	0.24
275	0.24
276	0.21
277	0.24
278	0.24
279	0.23
280	0.25
281	0.27
282	0.31
283	0.35
284	0.42
285	0.42
286	0.49
287	0.56
288	0.58
289	0.65
290	0.67
291	0.63
292	0.58
293	0.56
294	0.51
295	0.5
296	0.47
297	0.38
298	0.31
299	0.29
300	0.29
301	0.26
302	0.2
303	0.15
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.11
312	0.14
313	0.14
314	0.14
315	0.19
316	0.23
317	0.23
318	0.25
319	0.25
320	0.24
321	0.24
322	0.23
323	0.18
324	0.14
325	0.14
326	0.13
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.15
331	0.17
332	0.16
333	0.18
334	0.22
335	0.22
336	0.26
337	0.27
338	0.25
339	0.22
340	0.23
341	0.21
342	0.17
343	0.16
344	0.11
345	0.1
346	0.08
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.04
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.06
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.08
366	0.09
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.11
374	0.13
375	0.19
376	0.21
377	0.24
378	0.25
379	0.28
380	0.38
381	0.46
382	0.52
383	0.54
384	0.57
385	0.56
386	0.57
387	0.58
388	0.5
389	0.45
390	0.39
391	0.32
392	0.3
393	0.28
394	0.26
395	0.22
396	0.2
397	0.15
398	0.12
399	0.11
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.12
404	0.13
405	0.14
406	0.14
407	0.15
408	0.15
409	0.17
410	0.21
411	0.22
412	0.22
413	0.24
414	0.25
415	0.31
416	0.32
417	0.31
418	0.26
419	0.23
420	0.23
421	0.21
422	0.23
423	0.17
424	0.18
425	0.19
426	0.24
427	0.22
428	0.25
429	0.24
430	0.21
431	0.21
432	0.22
433	0.26
434	0.2
435	0.22
436	0.18
437	0.19
438	0.17
439	0.17
440	0.17
441	0.1
442	0.09
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.16
451	0.18
452	0.22
453	0.24
454	0.23
455	0.26
456	0.3
457	0.34
458	0.37
459	0.37
460	0.36
461	0.42
462	0.48
463	0.54
464	0.58
465	0.62
466	0.65
467	0.7
468	0.76
469	0.74
470	0.76
471	0.77
472	0.76
473	0.73
474	0.71
475	0.72
476	0.72
477	0.74
478	0.7
479	0.64
480	0.59
481	0.55
482	0.49
483	0.45
484	0.42
485	0.41
486	0.38
487	0.36
488	0.33
489	0.34
490	0.36
491	0.34
492	0.29
493	0.22
494	0.22
495	0.22
496	0.24
497	0.24
498	0.2
499	0.2
500	0.22
501	0.25
502	0.3
503	0.37
504	0.43
505	0.5
506	0.52
507	0.52
508	0.57
509	0.53
510	0.56
511	0.52
512	0.47
513	0.4
514	0.43
515	0.41
516	0.39
517	0.46
518	0.38
519	0.39
520	0.4
521	0.42
522	0.47
523	0.54
524	0.61
525	0.63
526	0.68
527	0.69
528	0.7
529	0.75

A0A178ZPB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer