Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z6A6

Protein Details
Accession A0A178Z6A6    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29CGDVLTKKKLDPHRNQCRGAMHydrophilic
378-406NSLSRIRDGEKRERKKHKVHRHNGTSSANBasic
498-520KGYSIHKMLKRWHKHNDVRSSTMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-242MKSKLDKKERPRAHSRTNSGSEKKRKR
384-415RDGEKRERKKHKVHRHNGTSSANIRHEHRSRR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 12, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFQCEGCGDVLTKKKLDPHRNQCRGAMFTCIDCMTTFQGTSYRAHTSCITEDQKYQGALYREKPSKAAKRKSVSIVEPEYEKALVPRQAYVEDDLETDAPPHVPTPPPAVPDSNRDSVFDYMVDEGSQTGTPQISFTKDKEEMSMKQTAPSIFSSSRPSSQNGYHNADEEEQHSKEYEENGFTWGAAPVKPRGGLDMNNSTLSLEFMTPAAKEMKSKLDKKERPRAHSRTNSGSEKKRKRPTDDQVHELEGDTLMADTVKMDTPVIIHSGLTGGLSRMMSQDESYPFRRSPDPNDKRVIVHKERSARRSVKAEDPTSPLKRTRHTKEDSNGLGISIKGRAVKALSLVGGALLPGQVESHMANTKTRRRASSSDQGNSLSRIRDGEKRERKKHKVHRHNGTSSANIRHEHRSRRRYSDESPSRSPGEGTTRKLKAIEYHKHDDSASDTDSDPMQQHSNGASKRKSTNGAMVVFGAEEKTKRACRSFLANAPGLDSDKGYSIHKMLKRWHKHNDVRSSTMKMEEEQDLWRALRIRRNEKGEYVVFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.42
4 0.5
5 0.59
6 0.63
7 0.67
8 0.73
9 0.81
10 0.82
11 0.78
12 0.75
13 0.69
14 0.59
15 0.54
16 0.45
17 0.36
18 0.36
19 0.31
20 0.25
21 0.2
22 0.21
23 0.18
24 0.18
25 0.17
26 0.15
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.24
31 0.27
32 0.25
33 0.28
34 0.29
35 0.29
36 0.31
37 0.38
38 0.38
39 0.34
40 0.36
41 0.38
42 0.39
43 0.35
44 0.32
45 0.29
46 0.3
47 0.33
48 0.36
49 0.41
50 0.43
51 0.44
52 0.48
53 0.52
54 0.58
55 0.63
56 0.68
57 0.68
58 0.7
59 0.75
60 0.78
61 0.76
62 0.7
63 0.67
64 0.62
65 0.54
66 0.48
67 0.43
68 0.36
69 0.29
70 0.25
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.21
75 0.22
76 0.23
77 0.24
78 0.25
79 0.26
80 0.22
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.21
95 0.23
96 0.26
97 0.28
98 0.32
99 0.31
100 0.36
101 0.4
102 0.38
103 0.36
104 0.34
105 0.35
106 0.31
107 0.3
108 0.23
109 0.18
110 0.14
111 0.14
112 0.12
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.13
124 0.16
125 0.17
126 0.24
127 0.26
128 0.26
129 0.29
130 0.33
131 0.31
132 0.32
133 0.38
134 0.31
135 0.31
136 0.33
137 0.3
138 0.27
139 0.26
140 0.27
141 0.2
142 0.22
143 0.27
144 0.27
145 0.31
146 0.3
147 0.31
148 0.3
149 0.35
150 0.4
151 0.39
152 0.42
153 0.39
154 0.38
155 0.37
156 0.34
157 0.29
158 0.25
159 0.23
160 0.18
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.18
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.19
184 0.22
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.25
189 0.21
190 0.19
191 0.17
192 0.13
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.12
203 0.21
204 0.28
205 0.33
206 0.41
207 0.49
208 0.56
209 0.64
210 0.73
211 0.71
212 0.71
213 0.76
214 0.75
215 0.74
216 0.75
217 0.71
218 0.68
219 0.67
220 0.67
221 0.63
222 0.64
223 0.65
224 0.66
225 0.71
226 0.73
227 0.72
228 0.74
229 0.77
230 0.79
231 0.8
232 0.74
233 0.69
234 0.62
235 0.57
236 0.48
237 0.38
238 0.28
239 0.17
240 0.12
241 0.07
242 0.05
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.09
271 0.11
272 0.15
273 0.17
274 0.19
275 0.19
276 0.21
277 0.26
278 0.25
279 0.32
280 0.4
281 0.44
282 0.46
283 0.5
284 0.48
285 0.46
286 0.5
287 0.5
288 0.44
289 0.43
290 0.43
291 0.48
292 0.52
293 0.53
294 0.55
295 0.5
296 0.48
297 0.49
298 0.48
299 0.47
300 0.48
301 0.47
302 0.41
303 0.42
304 0.45
305 0.42
306 0.41
307 0.39
308 0.35
309 0.4
310 0.46
311 0.49
312 0.51
313 0.53
314 0.57
315 0.56
316 0.61
317 0.55
318 0.49
319 0.42
320 0.32
321 0.28
322 0.21
323 0.17
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.07
348 0.1
349 0.11
350 0.15
351 0.22
352 0.3
353 0.37
354 0.41
355 0.42
356 0.45
357 0.5
358 0.54
359 0.57
360 0.58
361 0.53
362 0.51
363 0.5
364 0.44
365 0.41
366 0.36
367 0.27
368 0.19
369 0.19
370 0.2
371 0.24
372 0.3
373 0.38
374 0.47
375 0.56
376 0.66
377 0.74
378 0.8
379 0.85
380 0.89
381 0.89
382 0.9
383 0.9
384 0.91
385 0.9
386 0.85
387 0.82
388 0.74
389 0.68
390 0.62
391 0.58
392 0.5
393 0.42
394 0.41
395 0.42
396 0.46
397 0.51
398 0.57
399 0.61
400 0.64
401 0.71
402 0.75
403 0.72
404 0.71
405 0.72
406 0.71
407 0.69
408 0.67
409 0.62
410 0.57
411 0.51
412 0.46
413 0.38
414 0.38
415 0.37
416 0.37
417 0.42
418 0.41
419 0.42
420 0.43
421 0.41
422 0.39
423 0.43
424 0.48
425 0.47
426 0.52
427 0.52
428 0.53
429 0.51
430 0.44
431 0.38
432 0.33
433 0.26
434 0.2
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.2
439 0.16
440 0.15
441 0.16
442 0.14
443 0.16
444 0.18
445 0.25
446 0.28
447 0.34
448 0.35
449 0.38
450 0.43
451 0.46
452 0.48
453 0.44
454 0.48
455 0.47
456 0.45
457 0.4
458 0.36
459 0.31
460 0.26
461 0.22
462 0.15
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.18
467 0.23
468 0.28
469 0.32
470 0.34
471 0.37
472 0.45
473 0.5
474 0.51
475 0.52
476 0.5
477 0.47
478 0.46
479 0.43
480 0.36
481 0.29
482 0.22
483 0.16
484 0.15
485 0.17
486 0.16
487 0.17
488 0.19
489 0.27
490 0.3
491 0.36
492 0.43
493 0.53
494 0.61
495 0.67
496 0.74
497 0.76
498 0.82
499 0.86
500 0.87
501 0.83
502 0.79
503 0.75
504 0.71
505 0.63
506 0.58
507 0.5
508 0.41
509 0.38
510 0.34
511 0.32
512 0.29
513 0.29
514 0.26
515 0.24
516 0.26
517 0.28
518 0.3
519 0.36
520 0.44
521 0.51
522 0.57
523 0.64
524 0.65
525 0.63
526 0.66