Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9D9N0

Protein Details
Accession J9D9N0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-86MVVKNFSKRSRVPRRPFDRDRLIDHydrophilic
229-255SAKAGAKLGRKGKKNKGKKAGDEDEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-248KAGAKLGRKGKKNKGKKA
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 7, cyto_nucl 6.5, cyto 4, E.R. 2, plas 1, extr 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR005710  Ribosomal_S4/S9_euk/arc  
IPR001912  Ribosomal_S4/S9_N  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
Amino Acid Sequences MFMRKKKTREIFSLCKILKFSVLQQKKSQIILYKNLFFPSFFPSQCLLLFTVYAFIIFSPYKMVVKNFSKRSRVPRRPFDRDRLIDEMKLLGTYGLKNKRELWIVQRECDYIKNRARDLLINPDEKVQIINGRYLLNKLVKLGILEQVDLTNYHAIIENLNSVLNLTASDFLERRLQYRVFQMGLAKDVHSARCLIAQKQISVRGNVVNKPAFMVKAEDEAYIEVYVHSAKAGAKLGRKGKKNKGKKAGDEDEDDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.64
3 0.57
4 0.48
5 0.43
6 0.36
7 0.38
8 0.38
9 0.45
10 0.47
11 0.51
12 0.57
13 0.56
14 0.56
15 0.52
16 0.49
17 0.46
18 0.51
19 0.51
20 0.48
21 0.46
22 0.46
23 0.42
24 0.35
25 0.31
26 0.28
27 0.27
28 0.22
29 0.24
30 0.24
31 0.25
32 0.25
33 0.25
34 0.2
35 0.16
36 0.16
37 0.12
38 0.12
39 0.1
40 0.1
41 0.08
42 0.06
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.14
50 0.16
51 0.21
52 0.29
53 0.37
54 0.44
55 0.5
56 0.55
57 0.59
58 0.69
59 0.72
60 0.75
61 0.76
62 0.78
63 0.8
64 0.84
65 0.85
66 0.83
67 0.81
68 0.74
69 0.69
70 0.65
71 0.58
72 0.48
73 0.42
74 0.34
75 0.24
76 0.2
77 0.15
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.15
82 0.22
83 0.23
84 0.25
85 0.27
86 0.3
87 0.32
88 0.32
89 0.31
90 0.34
91 0.35
92 0.35
93 0.34
94 0.32
95 0.3
96 0.33
97 0.3
98 0.27
99 0.31
100 0.33
101 0.32
102 0.34
103 0.34
104 0.32
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.28
109 0.28
110 0.27
111 0.26
112 0.23
113 0.21
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.15
160 0.16
161 0.17
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.26
166 0.28
167 0.23
168 0.24
169 0.25
170 0.21
171 0.23
172 0.21
173 0.17
174 0.17
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.15
179 0.13
180 0.19
181 0.21
182 0.19
183 0.25
184 0.26
185 0.28
186 0.31
187 0.39
188 0.35
189 0.34
190 0.35
191 0.34
192 0.36
193 0.36
194 0.38
195 0.32
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.24
200 0.21
201 0.22
202 0.17
203 0.19
204 0.2
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.18
209 0.14
210 0.13
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.11
219 0.17
220 0.2
221 0.26
222 0.34
223 0.44
224 0.51
225 0.59
226 0.65
227 0.71
228 0.77
229 0.83
230 0.85
231 0.87
232 0.88
233 0.89
234 0.9
235 0.88
236 0.82