FuNGI

A0A178ZEL1

Protein Details

Accession

A0A178ZEL1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
97-137	GSRYDRDERRDRDRERNRDRGERRRSRSPHHRSSRREFEAD	Basic
209-228	QARGRKNSPPPKKREPTPDL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-132	GSRYDRDERRDRDRERNRDRGERRRSRSPHHRSSRR
150-200	REDRHGSRREDRDWDRDRGPRRRDDDRPPRRDRDLFDDRRGGNRDRDRTGR
208-222	AQARGRKNSPPPKKR

Subcellular Location(s)

extr 9, plas 4, E.R. 4, golg 3, vacu 3, nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk IPR006529 U2AF_lg
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12231 RRM2_U2AF65 cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MVNNSVVVPVAVLASLCVAMFLFIWWWFPRHYKKGVEQDMNIMDSERAEREGIHSDMGQVQLGEDGLPRKKTLEEHIAIAREQIRRGDTGRSREHHGSRYDRDERRDRDRERNRDRGERRRSRSPHHRSSRREFEADSYSSSRDYRAREREDRHGSRREDRDWDRDRGPRRRDDDRPPRRDRDLFDDRRGGNRDRDRTGREDRDEFAAQARGRKNSPPPKKREPTPDLTDVVPILERKRRMTQWDIKPPGYENVTAEQAKMSGMFPLPGAPRQQQMDPSRLQAFMNQPAGSANATALRPSNARQSRRLFVHNLPASVTEESLVAFFNLQLNGLNVIKGNDPCTQANISEDRSFALVEFKNPSDATVALALDGITMEEHHSELNGNGTAAPKGLEIRRPKDYIVPSADADAYTDGEISTEVPDTANKLAITNLPPFLTDDQVVELLKAFGELRAFVLVRDADAQESRGIAFCEYSDPSVAAVAIEGLNGMDLAGNAIKVTRASIGYTQAAGLEMGVNAMSMFAGTTAENLEDGRVLQLLNMVTPEELIDNDDYEEICEDVMEECQKYGKILAMKIPRPSMGSRQSAGVGKIFIKYEEPESAKKALQALAGRKFADRTVVTTYFDEASFDVNAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.06
3	0.05
4	0.05
5	0.05
6	0.05
7	0.05
8	0.06
9	0.07
10	0.07
11	0.11
12	0.12
13	0.14
14	0.17
15	0.25
16	0.35
17	0.4
18	0.47
19	0.51
20	0.59
21	0.68
22	0.75
23	0.73
24	0.65
25	0.66
26	0.62
27	0.55
28	0.46
29	0.36
30	0.26
31	0.21
32	0.22
33	0.16
34	0.14
35	0.13
36	0.13
37	0.16
38	0.21
39	0.21
40	0.2
41	0.19
42	0.19
43	0.22
44	0.22
45	0.19
46	0.13
47	0.12
48	0.11
49	0.11
50	0.1
51	0.09
52	0.14
53	0.18
54	0.2
55	0.2
56	0.21
57	0.24
58	0.28
59	0.33
60	0.38
61	0.35
62	0.38
63	0.42
64	0.42
65	0.39
66	0.4
67	0.37
68	0.3
69	0.3
70	0.29
71	0.26
72	0.27
73	0.29
74	0.35
75	0.36
76	0.42
77	0.49
78	0.48
79	0.53
80	0.59
81	0.62
82	0.59
83	0.6
84	0.59
85	0.57
86	0.64
87	0.66
88	0.64
89	0.67
90	0.7
91	0.68
92	0.71
93	0.74
94	0.71
95	0.73
96	0.78
97	0.81
98	0.8
99	0.84
100	0.81
101	0.82
102	0.85
103	0.84
104	0.85
105	0.84
106	0.83
107	0.83
108	0.82
109	0.82
110	0.84
111	0.83
112	0.83
113	0.84
114	0.86
115	0.84
116	0.87
117	0.88
118	0.82
119	0.75
120	0.65
121	0.59
122	0.56
123	0.48
124	0.43
125	0.34
126	0.29
127	0.28
128	0.27
129	0.25
130	0.23
131	0.27
132	0.32
133	0.39
134	0.47
135	0.54
136	0.58
137	0.65
138	0.72
139	0.74
140	0.72
141	0.71
142	0.68
143	0.69
144	0.7
145	0.64
146	0.63
147	0.6
148	0.63
149	0.6
150	0.61
151	0.58
152	0.58
153	0.63
154	0.64
155	0.65
156	0.64
157	0.64
158	0.67
159	0.69
160	0.73
161	0.75
162	0.76
163	0.79
164	0.78
165	0.79
166	0.77
167	0.74
168	0.67
169	0.65
170	0.65
171	0.61
172	0.59
173	0.6
174	0.54
175	0.56
176	0.57
177	0.51
178	0.49
179	0.51
180	0.51
181	0.49
182	0.53
183	0.5
184	0.52
185	0.58
186	0.56
187	0.53
188	0.5
189	0.46
190	0.46
191	0.43
192	0.37
193	0.3
194	0.28
195	0.24
196	0.28
197	0.3
198	0.27
199	0.28
200	0.33
201	0.41
202	0.46
203	0.56
204	0.59
205	0.64
206	0.72
207	0.78
208	0.8
209	0.8
210	0.77
211	0.74
212	0.71
213	0.67
214	0.57
215	0.5
216	0.44
217	0.33
218	0.26
219	0.19
220	0.14
221	0.13
222	0.16
223	0.18
224	0.21
225	0.27
226	0.3
227	0.35
228	0.43
229	0.49
230	0.55
231	0.63
232	0.64
233	0.59
234	0.57
235	0.53
236	0.47
237	0.39
238	0.3
239	0.21
240	0.18
241	0.21
242	0.2
243	0.18
244	0.15
245	0.13
246	0.12
247	0.11
248	0.09
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.07
253	0.1
254	0.11
255	0.12
256	0.15
257	0.15
258	0.17
259	0.19
260	0.2
261	0.24
262	0.26
263	0.29
264	0.27
265	0.29
266	0.28
267	0.27
268	0.26
269	0.22
270	0.22
271	0.22
272	0.24
273	0.21
274	0.19
275	0.19
276	0.19
277	0.16
278	0.12
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.11
287	0.2
288	0.24
289	0.27
290	0.34
291	0.38
292	0.42
293	0.44
294	0.46
295	0.41
296	0.36
297	0.43
298	0.38
299	0.34
300	0.29
301	0.27
302	0.25
303	0.21
304	0.19
305	0.09
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.07
323	0.09
324	0.09
325	0.12
326	0.14
327	0.16
328	0.16
329	0.18
330	0.18
331	0.16
332	0.18
333	0.17
334	0.17
335	0.15
336	0.15
337	0.13
338	0.13
339	0.13
340	0.11
341	0.14
342	0.11
343	0.12
344	0.15
345	0.15
346	0.16
347	0.16
348	0.17
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.08
355	0.08
356	0.07
357	0.06
358	0.05
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.06
378	0.09
379	0.11
380	0.17
381	0.22
382	0.27
383	0.32
384	0.33
385	0.33
386	0.37
387	0.38
388	0.38
389	0.36
390	0.34
391	0.29
392	0.29
393	0.28
394	0.21
395	0.19
396	0.13
397	0.1
398	0.07
399	0.07
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.08
410	0.09
411	0.11
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.13
416	0.16
417	0.17
418	0.17
419	0.15
420	0.15
421	0.17
422	0.17
423	0.16
424	0.14
425	0.12
426	0.12
427	0.13
428	0.13
429	0.11
430	0.1
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.09
440	0.1
441	0.09
442	0.12
443	0.11
444	0.11
445	0.13
446	0.12
447	0.11
448	0.12
449	0.13
450	0.11
451	0.11
452	0.11
453	0.1
454	0.1
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.11
459	0.11
460	0.12
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.11
465	0.1
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.03
477	0.03
478	0.04
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.11
489	0.13
490	0.17
491	0.17
492	0.17
493	0.17
494	0.15
495	0.14
496	0.12
497	0.1
498	0.07
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.04
510	0.04
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.07
532	0.07
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.1
537	0.11
538	0.1
539	0.1
540	0.11
541	0.09
542	0.08
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.1
547	0.12
548	0.11
549	0.12
550	0.14
551	0.15
552	0.15
553	0.16
554	0.18
555	0.2
556	0.22
557	0.3
558	0.37
559	0.42
560	0.46
561	0.48
562	0.44
563	0.43
564	0.45
565	0.46
566	0.45
567	0.46
568	0.41
569	0.41
570	0.43
571	0.43
572	0.4
573	0.33
574	0.27
575	0.23
576	0.25
577	0.24
578	0.21
579	0.2
580	0.21
581	0.23
582	0.28
583	0.31
584	0.32
585	0.35
586	0.38
587	0.37
588	0.37
589	0.36
590	0.31
591	0.32
592	0.35
593	0.39
594	0.43
595	0.46
596	0.45
597	0.43
598	0.42
599	0.37
600	0.38
601	0.31
602	0.27
603	0.31
604	0.32
605	0.34
606	0.33
607	0.35
608	0.29
609	0.28
610	0.25
611	0.17
612	0.17

A0A178ZEL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer