Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZTC5

Protein Details
Accession A0A178ZTC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-292EQRDGEKRKRLERLEKAVSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-286QRDGEKRKRLERL
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040351  RAB3IL/RAB3IP/Sec2  
IPR009449  Sec2_N  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF06428  Sec2p  
Amino Acid Sequences MATSVLLNTIPMDPTFATAAASYHSSPDHTCPQCGYHLFSSSESPAEATEANRRIRDLEAQVRLLNSKAAAAVDKLADYEDEIQYLRDAYSKSQQQQQQARSNPRLSISPGDGTGSITTPGQTPPQQQQSRLASISAFLPGRKREANSSLGGQNPLTPATGTFPQNNAALISNTTLSPPKTPFFGVATVPSNSTPTLSSSSTIDNNQSTVSLLSLQSSLEEERTLRIRAESSLSQTQTELEELTAQLFGQANEMVANERKARAKLEERVKVLEQRDGEKRKRLERLEKAVSRIERVRGMVGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.11
8 0.14
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.15
13 0.16
14 0.21
15 0.29
16 0.29
17 0.3
18 0.31
19 0.33
20 0.37
21 0.37
22 0.37
23 0.31
24 0.33
25 0.33
26 0.33
27 0.34
28 0.29
29 0.27
30 0.22
31 0.19
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.19
37 0.25
38 0.28
39 0.29
40 0.29
41 0.29
42 0.3
43 0.34
44 0.33
45 0.35
46 0.36
47 0.37
48 0.38
49 0.37
50 0.35
51 0.3
52 0.24
53 0.16
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.12
77 0.19
78 0.25
79 0.27
80 0.34
81 0.38
82 0.44
83 0.51
84 0.57
85 0.58
86 0.6
87 0.65
88 0.64
89 0.62
90 0.55
91 0.48
92 0.42
93 0.36
94 0.32
95 0.26
96 0.21
97 0.19
98 0.18
99 0.17
100 0.16
101 0.14
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.11
109 0.12
110 0.15
111 0.21
112 0.31
113 0.32
114 0.33
115 0.39
116 0.4
117 0.41
118 0.38
119 0.32
120 0.22
121 0.2
122 0.2
123 0.15
124 0.11
125 0.09
126 0.12
127 0.12
128 0.16
129 0.17
130 0.18
131 0.19
132 0.22
133 0.25
134 0.23
135 0.24
136 0.23
137 0.22
138 0.22
139 0.18
140 0.15
141 0.12
142 0.11
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.08
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.15
173 0.16
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.16
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.11
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.21
217 0.2
218 0.24
219 0.29
220 0.29
221 0.28
222 0.27
223 0.27
224 0.23
225 0.21
226 0.15
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.15
244 0.16
245 0.2
246 0.24
247 0.25
248 0.28
249 0.33
250 0.39
251 0.45
252 0.54
253 0.58
254 0.57
255 0.6
256 0.6
257 0.59
258 0.53
259 0.5
260 0.42
261 0.41
262 0.47
263 0.51
264 0.54
265 0.56
266 0.61
267 0.64
268 0.71
269 0.74
270 0.75
271 0.76
272 0.8
273 0.81
274 0.79
275 0.75
276 0.73
277 0.66
278 0.62
279 0.57
280 0.52
281 0.46
282 0.43