Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HFC6

Protein Details
Accession A0A179HFC6    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-102AESGYPNTARPRRQRKKPGEDDTDFEHydrophilic
247-287EEREKELKQLRKEEKRREKEKRREERVKRGHRRRSEMKTVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-93PRRQRKK
239-281KQQRQKIAEEREKELKQLRKEEKRREKEKRREERVKRGHRRRS
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG plj:VFPFJ_06793  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNADNIARVRRDEAAAKAAEEAEEQRMQEIDAQRRLAILRGEEPPPLPEREEPNAIVPSSTREAESGYPNTARPRRQRKKPGEDDTDFELRLAREQTEASSANALEQTRNPTSSAPIVDRAGHIDLLGDEKARAHTERNEDAERDARAKRREIEDQYRMRLANAAGKGAVSEPWYSQSDHAAVAAPSKDVWGNEDPRRKERQAQRLIANDPLAIMKQASAKMKELKQQRQKIAEEREKELKQLRKEEKRREKEKRREERVKRGHRRRSEMKTVSDTDHTETGTTVETGMGGTMNGSGTETKTMRAEDLMEIGAIAGMAIAGTLNRSGTESKSTCAAMVLAPPSADRDITETTNDEIPQGVKYAPLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.41
4 0.41
5 0.39
6 0.41
7 0.39
8 0.38
9 0.32
10 0.3
11 0.31
12 0.31
13 0.33
14 0.33
15 0.31
16 0.3
17 0.29
18 0.26
19 0.23
20 0.2
21 0.18
22 0.17
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.21
29 0.27
30 0.3
31 0.33
32 0.34
33 0.33
34 0.34
35 0.34
36 0.32
37 0.27
38 0.22
39 0.22
40 0.24
41 0.26
42 0.26
43 0.27
44 0.26
45 0.27
46 0.26
47 0.25
48 0.25
49 0.3
50 0.33
51 0.37
52 0.35
53 0.36
54 0.36
55 0.33
56 0.29
57 0.23
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.17
62 0.15
63 0.17
64 0.19
65 0.25
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.24
70 0.33
71 0.37
72 0.42
73 0.47
74 0.56
75 0.63
76 0.73
77 0.82
78 0.84
79 0.9
80 0.92
81 0.92
82 0.89
83 0.82
84 0.74
85 0.69
86 0.61
87 0.5
88 0.39
89 0.32
90 0.22
91 0.23
92 0.2
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.16
98 0.17
99 0.14
100 0.15
101 0.14
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.12
106 0.13
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.18
112 0.2
113 0.22
114 0.22
115 0.18
116 0.18
117 0.19
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.14
123 0.12
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.17
136 0.23
137 0.27
138 0.31
139 0.31
140 0.3
141 0.31
142 0.31
143 0.27
144 0.25
145 0.24
146 0.26
147 0.28
148 0.31
149 0.33
150 0.34
151 0.41
152 0.44
153 0.49
154 0.52
155 0.52
156 0.51
157 0.5
158 0.45
159 0.38
160 0.33
161 0.25
162 0.21
163 0.18
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.11
169 0.11
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.1
191 0.13
192 0.18
193 0.25
194 0.32
195 0.34
196 0.39
197 0.46
198 0.44
199 0.49
200 0.52
201 0.57
202 0.59
203 0.61
204 0.61
205 0.59
206 0.59
207 0.52
208 0.44
209 0.33
210 0.24
211 0.19
212 0.14
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.08
217 0.12
218 0.15
219 0.16
220 0.2
221 0.25
222 0.28
223 0.34
224 0.4
225 0.47
226 0.54
227 0.6
228 0.63
229 0.64
230 0.66
231 0.68
232 0.69
233 0.66
234 0.6
235 0.56
236 0.58
237 0.52
238 0.52
239 0.51
240 0.47
241 0.46
242 0.52
243 0.57
244 0.6
245 0.69
246 0.76
247 0.8
248 0.84
249 0.88
250 0.9
251 0.91
252 0.91
253 0.93
254 0.93
255 0.92
256 0.93
257 0.91
258 0.91
259 0.91
260 0.92
261 0.92
262 0.91
263 0.91
264 0.89
265 0.89
266 0.87
267 0.85
268 0.85
269 0.8
270 0.75
271 0.71
272 0.65
273 0.59
274 0.53
275 0.45
276 0.37
277 0.33
278 0.27
279 0.21
280 0.18
281 0.16
282 0.14
283 0.12
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.19
306 0.14
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.06
314 0.05
315 0.03
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.08
326 0.1
327 0.12
328 0.21
329 0.22
330 0.23
331 0.26
332 0.26
333 0.24
334 0.23
335 0.21
336 0.14
337 0.17
338 0.17
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.13
346 0.16
347 0.19
348 0.21
349 0.23
350 0.22
351 0.23
352 0.27
353 0.26
354 0.22
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.18
359 0.15