Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HNM9

Protein Details
Accession A0A179HNM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-99FDGPNKPVFKRNKRSGRGDGVAHydrophilic
524-569RSPPPAKISPSKRRSRGETPSPAEEQGPPPSPSRKKKSLERSATLYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-480KAPRKSPAKKTASAPKPKKSTGMPR
507-560PGAKASQKPRLKVPPLLRSPPPAKISPSKRRSRGETPSPAEEQGPPPSPSRKKK
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 11.833, cyto 10, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
IPR037316  Yen1_H3TH  
Gene Ontology GO:0008821  F:crossover junction DNA endonuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG plj:VFPFJ_03775  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
CDD cd09906  H3TH_YEN1  
cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGIKGIYRELGPGTRVSLSKLAADTFEHQNRPFRIAIDIAIWQFQTQAARGGTNPAIRTLFYRLVRLLGTPVQPIFVFDGPNKPVFKRNKRSGRGDGVATAQAKQLIRLFGFAVHDAPGEAEAECALLQKHGIVDAVLSEDVDTIMFGCTKTLRNWSSEGKTSKTPTHVSLYDVHDPKIAEVGLDREGMVLIALMSGGDYLPDGIPGCGVKVAYEAAKAGFGKSICRLKASDASGIKAWRESLTHQLRTNEQGHFRTKHRALIIPEDFPNIEVLRYYTHPVVSPQSTLDAVRQKLERKQTIQLEALREFTRETFDWDYKIGAVKFIRVLGQSLLVHNLSEGATSPHGWVKRISGRRQHFTTDATPELRLAYVPEEVVPIDLSKEVDEVVASGRDGLALNSDDDFGADNDPSGAVDSVRAPKVFDVTKPDLTWVLESVARRFIPDTVRSWEEAATAKAPRKSPAKKTASAPKPKKSTGMPRGALDGFVRVTKPKPVHDETGRPAELEPGAKASQKPRLKVPPLLRSPPPAKISPSKRRSRGETPSPAEEQGPPPSPSRKKKSLERSATLYWSNESEVDETERAARIRSGSKLPEARGVKAGVVRWSDVSLIDLTGDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.26
4 0.27
5 0.25
6 0.27
7 0.27
8 0.25
9 0.22
10 0.25
11 0.25
12 0.3
13 0.36
14 0.37
15 0.38
16 0.46
17 0.46
18 0.48
19 0.45
20 0.37
21 0.34
22 0.3
23 0.29
24 0.23
25 0.25
26 0.21
27 0.22
28 0.2
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.13
34 0.18
35 0.17
36 0.19
37 0.19
38 0.24
39 0.26
40 0.29
41 0.29
42 0.26
43 0.26
44 0.25
45 0.28
46 0.29
47 0.32
48 0.29
49 0.32
50 0.29
51 0.31
52 0.31
53 0.29
54 0.27
55 0.24
56 0.24
57 0.24
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.18
64 0.19
65 0.17
66 0.24
67 0.25
68 0.31
69 0.31
70 0.29
71 0.37
72 0.45
73 0.55
74 0.58
75 0.66
76 0.72
77 0.78
78 0.85
79 0.85
80 0.83
81 0.76
82 0.67
83 0.59
84 0.51
85 0.47
86 0.39
87 0.31
88 0.23
89 0.23
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.2
97 0.18
98 0.2
99 0.18
100 0.16
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.05
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.08
137 0.11
138 0.14
139 0.22
140 0.23
141 0.25
142 0.3
143 0.35
144 0.38
145 0.43
146 0.45
147 0.4
148 0.43
149 0.44
150 0.44
151 0.43
152 0.41
153 0.36
154 0.39
155 0.36
156 0.33
157 0.35
158 0.36
159 0.39
160 0.38
161 0.35
162 0.32
163 0.31
164 0.28
165 0.25
166 0.19
167 0.11
168 0.1
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.05
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.02
182 0.02
183 0.03
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.17
211 0.22
212 0.2
213 0.22
214 0.23
215 0.23
216 0.3
217 0.3
218 0.31
219 0.26
220 0.28
221 0.28
222 0.28
223 0.25
224 0.2
225 0.18
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.21
230 0.27
231 0.31
232 0.33
233 0.34
234 0.35
235 0.39
236 0.41
237 0.34
238 0.32
239 0.31
240 0.34
241 0.36
242 0.36
243 0.4
244 0.39
245 0.4
246 0.38
247 0.39
248 0.35
249 0.41
250 0.4
251 0.34
252 0.33
253 0.29
254 0.27
255 0.22
256 0.21
257 0.12
258 0.1
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.16
269 0.15
270 0.14
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.15
276 0.17
277 0.16
278 0.18
279 0.2
280 0.22
281 0.27
282 0.34
283 0.35
284 0.33
285 0.39
286 0.4
287 0.41
288 0.42
289 0.4
290 0.35
291 0.32
292 0.31
293 0.25
294 0.21
295 0.18
296 0.14
297 0.15
298 0.12
299 0.15
300 0.17
301 0.17
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.15
306 0.18
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.1
315 0.11
316 0.09
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.12
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.16
337 0.24
338 0.31
339 0.36
340 0.43
341 0.48
342 0.54
343 0.55
344 0.54
345 0.47
346 0.44
347 0.41
348 0.35
349 0.31
350 0.26
351 0.24
352 0.21
353 0.19
354 0.16
355 0.12
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.08
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.14
407 0.15
408 0.19
409 0.19
410 0.19
411 0.23
412 0.26
413 0.29
414 0.29
415 0.3
416 0.27
417 0.26
418 0.25
419 0.18
420 0.14
421 0.13
422 0.14
423 0.15
424 0.18
425 0.17
426 0.17
427 0.17
428 0.19
429 0.22
430 0.24
431 0.26
432 0.27
433 0.29
434 0.29
435 0.29
436 0.26
437 0.23
438 0.21
439 0.19
440 0.17
441 0.18
442 0.22
443 0.26
444 0.27
445 0.31
446 0.39
447 0.45
448 0.51
449 0.59
450 0.61
451 0.62
452 0.67
453 0.72
454 0.73
455 0.76
456 0.75
457 0.73
458 0.73
459 0.7
460 0.68
461 0.65
462 0.66
463 0.65
464 0.67
465 0.6
466 0.54
467 0.57
468 0.52
469 0.45
470 0.35
471 0.27
472 0.18
473 0.16
474 0.17
475 0.14
476 0.16
477 0.22
478 0.25
479 0.29
480 0.36
481 0.4
482 0.47
483 0.52
484 0.58
485 0.55
486 0.6
487 0.55
488 0.47
489 0.42
490 0.37
491 0.33
492 0.26
493 0.22
494 0.17
495 0.18
496 0.2
497 0.23
498 0.26
499 0.33
500 0.37
501 0.4
502 0.45
503 0.53
504 0.57
505 0.62
506 0.66
507 0.67
508 0.69
509 0.73
510 0.67
511 0.65
512 0.63
513 0.62
514 0.58
515 0.5
516 0.49
517 0.52
518 0.6
519 0.62
520 0.68
521 0.71
522 0.75
523 0.79
524 0.81
525 0.81
526 0.8
527 0.8
528 0.8
529 0.76
530 0.73
531 0.69
532 0.62
533 0.54
534 0.47
535 0.41
536 0.37
537 0.37
538 0.33
539 0.34
540 0.43
541 0.5
542 0.57
543 0.63
544 0.65
545 0.69
546 0.77
547 0.84
548 0.85
549 0.85
550 0.81
551 0.78
552 0.73
553 0.71
554 0.63
555 0.54
556 0.44
557 0.36
558 0.32
559 0.26
560 0.23
561 0.19
562 0.18
563 0.21
564 0.2
565 0.19
566 0.2
567 0.22
568 0.21
569 0.21
570 0.21
571 0.21
572 0.26
573 0.3
574 0.34
575 0.35
576 0.44
577 0.49
578 0.49
579 0.53
580 0.51
581 0.5
582 0.47
583 0.44
584 0.38
585 0.36
586 0.37
587 0.34
588 0.33
589 0.32
590 0.28
591 0.28
592 0.26
593 0.22
594 0.21
595 0.16
596 0.13