Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HLV3

Protein Details
Accession A0A179HLV3    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-231GQAKAEEKAKKKKKQRGPKGPNPLSMKKBasic
259-285EDEARTDAPAKRKRRRKNKASGAGDGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-192EKSKFRAEIKATLGKRKREEK
204-278GQAKAEEKAKKKKKQRGPKGPNPLSMKKAKKPQATTAGTAGAPPRPSKQPENARPEDEARTDAPAKRKRRRKNKA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_05143  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRGKRSKQYRKLMEQFSMAFGFREPYQVLVDAEMVQDSCKFKMELEPALQRTVHGKVKPMITQCEIRKLYAKKNEPGVSEAIEVAKTCERRRCGHHPDEYPEPLSTLECMQSVVDPKDQGENKHRYVVASQSQEVRRMLRIVRGVPLIYIKRSVMILEPMSDESAATRAREEKSKFRAEIKATLGKRKREEKDDNDKEDEKDLGQAKAEEKAKKKKKQRGPKGPNPLSMKKAKKPQATTAGTAGAPPRPSKQPENARPEDEARTDAPAKRKRRRKNKASGAGDGADGATGADAADDGSAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.64
3 0.57
4 0.49
5 0.38
6 0.29
7 0.23
8 0.21
9 0.16
10 0.19
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.19
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.14
19 0.14
20 0.12
21 0.1
22 0.09
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.22
30 0.26
31 0.28
32 0.32
33 0.39
34 0.39
35 0.41
36 0.4
37 0.33
38 0.32
39 0.33
40 0.33
41 0.27
42 0.31
43 0.32
44 0.37
45 0.41
46 0.42
47 0.41
48 0.38
49 0.45
50 0.42
51 0.48
52 0.44
53 0.41
54 0.45
55 0.44
56 0.5
57 0.52
58 0.56
59 0.51
60 0.59
61 0.61
62 0.55
63 0.53
64 0.46
65 0.38
66 0.31
67 0.27
68 0.18
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.16
74 0.19
75 0.25
76 0.28
77 0.32
78 0.4
79 0.48
80 0.53
81 0.59
82 0.63
83 0.62
84 0.63
85 0.65
86 0.6
87 0.52
88 0.43
89 0.35
90 0.27
91 0.22
92 0.17
93 0.12
94 0.1
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.2
105 0.22
106 0.24
107 0.29
108 0.34
109 0.34
110 0.38
111 0.37
112 0.31
113 0.31
114 0.32
115 0.3
116 0.26
117 0.26
118 0.27
119 0.28
120 0.31
121 0.3
122 0.26
123 0.21
124 0.21
125 0.21
126 0.19
127 0.2
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.16
133 0.19
134 0.16
135 0.13
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.08
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.11
156 0.12
157 0.19
158 0.22
159 0.28
160 0.34
161 0.4
162 0.41
163 0.42
164 0.47
165 0.43
166 0.46
167 0.42
168 0.44
169 0.4
170 0.47
171 0.49
172 0.49
173 0.52
174 0.56
175 0.56
176 0.57
177 0.65
178 0.65
179 0.7
180 0.73
181 0.71
182 0.68
183 0.65
184 0.57
185 0.49
186 0.41
187 0.3
188 0.26
189 0.23
190 0.19
191 0.17
192 0.18
193 0.17
194 0.23
195 0.28
196 0.28
197 0.34
198 0.44
199 0.53
200 0.61
201 0.7
202 0.74
203 0.8
204 0.85
205 0.89
206 0.9
207 0.9
208 0.91
209 0.93
210 0.88
211 0.86
212 0.82
213 0.76
214 0.71
215 0.69
216 0.67
217 0.63
218 0.67
219 0.67
220 0.68
221 0.68
222 0.71
223 0.72
224 0.69
225 0.64
226 0.56
227 0.5
228 0.41
229 0.37
230 0.3
231 0.23
232 0.21
233 0.2
234 0.22
235 0.26
236 0.32
237 0.37
238 0.45
239 0.53
240 0.6
241 0.68
242 0.69
243 0.66
244 0.64
245 0.62
246 0.56
247 0.47
248 0.4
249 0.32
250 0.32
251 0.33
252 0.34
253 0.41
254 0.45
255 0.53
256 0.6
257 0.7
258 0.75
259 0.82
260 0.89
261 0.9
262 0.93
263 0.93
264 0.94
265 0.9
266 0.85
267 0.79
268 0.69
269 0.58
270 0.47
271 0.35
272 0.24
273 0.17
274 0.11
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.03