Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HF96

Protein Details
Accession A0A179HF96    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-36IVSAQRRSAGRRRSLRPRAGRPATTHydrophilic
190-211GKAGANKKRRGKSARPAKKTTEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-56RRSAGRRRSLRPRAGRPATTAPVGGIQKTTKPARGAAAKA
182-208NAGKAGAVGKAGANKKRRGKSARPAKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG plj:VFPFJ_06763  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGKLDKPLDEIVSAQRRSAGRRRSLRPRAGRPATTAPVGGIQKTTKPARGAAAKAAPAKAAAISGESKVIVSNLPKDVSEQQIKEYFVQAVGPIKRVDLVYGPNSQSRGIANVAFHKPDGASKAFQKLNGLLVDNRPIKIEIVVGASQADKVIPPVKSLAERTSQPKAQPKSAATGKQNANAGKAGAVGKAGANKKRRGKSARPAKKTTEELDSEMADYFQPGSNENANASASAPAAAATTDAAMEDEIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.33
4 0.34
5 0.4
6 0.47
7 0.47
8 0.49
9 0.58
10 0.66
11 0.72
12 0.8
13 0.84
14 0.85
15 0.85
16 0.86
17 0.85
18 0.78
19 0.74
20 0.71
21 0.64
22 0.55
23 0.46
24 0.35
25 0.33
26 0.32
27 0.26
28 0.21
29 0.19
30 0.2
31 0.27
32 0.29
33 0.28
34 0.29
35 0.3
36 0.34
37 0.38
38 0.38
39 0.37
40 0.38
41 0.37
42 0.38
43 0.36
44 0.3
45 0.24
46 0.22
47 0.16
48 0.12
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.09
60 0.12
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.18
65 0.2
66 0.25
67 0.28
68 0.25
69 0.26
70 0.3
71 0.31
72 0.29
73 0.27
74 0.21
75 0.16
76 0.15
77 0.13
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.1
87 0.13
88 0.13
89 0.17
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.2
112 0.2
113 0.21
114 0.21
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.18
119 0.12
120 0.13
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.04
139 0.06
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.16
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.21
150 0.25
151 0.3
152 0.31
153 0.34
154 0.4
155 0.42
156 0.43
157 0.45
158 0.42
159 0.44
160 0.46
161 0.48
162 0.42
163 0.47
164 0.44
165 0.43
166 0.46
167 0.4
168 0.36
169 0.3
170 0.27
171 0.19
172 0.19
173 0.15
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.15
179 0.2
180 0.25
181 0.31
182 0.39
183 0.48
184 0.55
185 0.63
186 0.65
187 0.7
188 0.74
189 0.79
190 0.82
191 0.81
192 0.8
193 0.78
194 0.77
195 0.73
196 0.65
197 0.61
198 0.53
199 0.48
200 0.44
201 0.37
202 0.3
203 0.25
204 0.22
205 0.15
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.15
212 0.18
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.14
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06