Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HKK7

Protein Details
Accession A0A179HKK7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
488-515EEERMGRGERSKKKRRFRSLSPLGRGGTBasic
572-591YLYERDRRLPRQTKNLHLADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
493-510GRGERSKKKRRFRSLSPL
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG plj:VFPFJ_04966  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MERSKPQAFQSTYAPRLRAYHNSLLTPVLPSAPSGPISRTTKRGTTIINYAEDGFDDLDDDSDDPRRRPTGLRSLRKEDSASRESMIDRAGKETREPVDVQGIWRDWMGKHRFVKSDQQNAAQASLPLTLIPIRIDLDVPQFIPAAPFPPPNPNAVDMSMPQYRQGELTVPYKLRDIFCWNLHETLITTDQFAQTLAQDLDLPNRASAVAEISRQIRTQLEEYAGVALHPLFHTEQQVPAPPPPTQAQTGAAATPAAAPTNGITVSTPRASAVLKSREDSPMSLARGLSRPDTPAQTGGPATPTPAPNVTAEATPILPDSDDYNPDDTYRCVVNLNLNLASMLYTDKFEWSLLHPPGTAEAFAKVTCADLGLTGEWIPAMTHAIYEAVLRLKKEACEAGGLVGGWGGAQQDLPNDAANGAESGWRYDPDHLADDWEPKVEILSKEEMEKREGDRERQVRRLRRETARFSSTAGMLGGTPFGAPAIDFEEERMGRGERSKKKRRFRSLSPLGRGGTPGGRGTPDVGGYGGGGALTDAERTTWRCSHCRVWGTSVWAVRDGPAGSKTLCANCGYLYERDRRLPRQTKNLHLADARAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.46
3 0.47
4 0.5
5 0.49
6 0.48
7 0.5
8 0.49
9 0.49
10 0.48
11 0.45
12 0.41
13 0.34
14 0.26
15 0.19
16 0.16
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.26
24 0.32
25 0.36
26 0.4
27 0.43
28 0.45
29 0.48
30 0.5
31 0.46
32 0.45
33 0.48
34 0.46
35 0.43
36 0.39
37 0.36
38 0.32
39 0.27
40 0.23
41 0.16
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.25
53 0.27
54 0.29
55 0.33
56 0.4
57 0.44
58 0.52
59 0.61
60 0.64
61 0.7
62 0.71
63 0.69
64 0.64
65 0.59
66 0.57
67 0.51
68 0.45
69 0.38
70 0.36
71 0.34
72 0.32
73 0.28
74 0.24
75 0.2
76 0.24
77 0.26
78 0.25
79 0.26
80 0.3
81 0.29
82 0.29
83 0.3
84 0.26
85 0.3
86 0.3
87 0.3
88 0.3
89 0.28
90 0.25
91 0.24
92 0.24
93 0.18
94 0.26
95 0.3
96 0.33
97 0.38
98 0.43
99 0.47
100 0.49
101 0.58
102 0.58
103 0.62
104 0.58
105 0.56
106 0.55
107 0.51
108 0.49
109 0.39
110 0.31
111 0.22
112 0.19
113 0.15
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.22
137 0.23
138 0.24
139 0.26
140 0.26
141 0.26
142 0.25
143 0.25
144 0.18
145 0.22
146 0.23
147 0.21
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.17
152 0.17
153 0.15
154 0.16
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.22
159 0.23
160 0.25
161 0.23
162 0.23
163 0.26
164 0.26
165 0.29
166 0.33
167 0.32
168 0.3
169 0.29
170 0.26
171 0.2
172 0.18
173 0.18
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.07
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.12
188 0.15
189 0.15
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.09
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.13
204 0.15
205 0.15
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.07
218 0.06
219 0.08
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.13
224 0.17
225 0.17
226 0.18
227 0.2
228 0.18
229 0.2
230 0.2
231 0.21
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.18
236 0.18
237 0.15
238 0.13
239 0.11
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.17
260 0.21
261 0.22
262 0.23
263 0.25
264 0.26
265 0.27
266 0.25
267 0.21
268 0.19
269 0.2
270 0.19
271 0.18
272 0.17
273 0.18
274 0.19
275 0.17
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.16
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.14
296 0.13
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.13
321 0.14
322 0.16
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.08
329 0.07
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.1
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.18
344 0.17
345 0.15
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.09
375 0.11
376 0.11
377 0.13
378 0.14
379 0.15
380 0.17
381 0.17
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.09
389 0.07
390 0.06
391 0.04
392 0.05
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.14
414 0.16
415 0.17
416 0.2
417 0.18
418 0.2
419 0.21
420 0.23
421 0.21
422 0.19
423 0.17
424 0.14
425 0.15
426 0.15
427 0.15
428 0.15
429 0.18
430 0.18
431 0.23
432 0.28
433 0.28
434 0.27
435 0.29
436 0.28
437 0.33
438 0.36
439 0.36
440 0.42
441 0.48
442 0.52
443 0.59
444 0.65
445 0.65
446 0.72
447 0.76
448 0.75
449 0.76
450 0.79
451 0.78
452 0.76
453 0.72
454 0.63
455 0.56
456 0.5
457 0.41
458 0.33
459 0.24
460 0.17
461 0.12
462 0.12
463 0.1
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.1
475 0.16
476 0.16
477 0.18
478 0.19
479 0.17
480 0.17
481 0.25
482 0.34
483 0.38
484 0.49
485 0.59
486 0.67
487 0.77
488 0.86
489 0.9
490 0.89
491 0.89
492 0.89
493 0.9
494 0.9
495 0.85
496 0.8
497 0.7
498 0.62
499 0.53
500 0.44
501 0.36
502 0.28
503 0.23
504 0.19
505 0.19
506 0.19
507 0.2
508 0.19
509 0.16
510 0.14
511 0.13
512 0.12
513 0.1
514 0.1
515 0.07
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.09
525 0.12
526 0.18
527 0.23
528 0.28
529 0.32
530 0.38
531 0.45
532 0.51
533 0.56
534 0.55
535 0.56
536 0.55
537 0.56
538 0.56
539 0.52
540 0.44
541 0.39
542 0.35
543 0.3
544 0.29
545 0.24
546 0.22
547 0.19
548 0.2
549 0.18
550 0.21
551 0.24
552 0.23
553 0.25
554 0.23
555 0.23
556 0.21
557 0.25
558 0.25
559 0.28
560 0.3
561 0.36
562 0.39
563 0.47
564 0.54
565 0.57
566 0.64
567 0.68
568 0.72
569 0.75
570 0.78
571 0.79
572 0.82
573 0.78
574 0.73
575 0.65