FuNGI

A0A179H320

Protein Details

Accession

A0A179H320

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
185-205	ADLKDTKRVKHPTKKNLKLVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
152-160	ARARKPARP

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	plj:VFPFJ_05585 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MASTGARTGERVVHQDYIARIRFSNALPPPPTPPKLLDIPNTGLASGQYTTPGFASRLAREQPLNIEADAELGMPLNLVGMPGVFDGDERSIQAPAVAPPVHPHDRALLRPIAALGKPKVAEANVSFLRRTEYISSSTPKRPEGNNARALLARARKPARPAPDAAADSPAAIKRKIDRSFEVAEADLKDTKRVKHPTKKNLKLVDAVPLLPDLDAFPDSGAYVTIKFLTNPITNATQYDTRLLSGLFRPIDRTPAEEAMFEAALAAYEQDPVNNPKPQNLMNYDFYLAPTKDVAKNFRRKFDLDDPEHDSDDLYTHGTGSGRGHFAFNRVRAYETAQETELDHPTKYEDEIILASNDDDTYPKQKAVYYYPIMQRSFIRPQRTKRLARTAGMSQDDDEEQVIDQIEVTVQDPSERMLEAMRKYKERPLGWDQGAEDEEEEQTQTQTQDADADADADADENQDSDAEQRRRRHRESSEVDRADDRSPQDRDGEGEEDEDEDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.33
3	0.34
4	0.37
5	0.37
6	0.34
7	0.31
8	0.31
9	0.35
10	0.32
11	0.37
12	0.34
13	0.38
14	0.39
15	0.41
16	0.46
17	0.51
18	0.52
19	0.46
20	0.44
21	0.41
22	0.46
23	0.49
24	0.47
25	0.44
26	0.45
27	0.47
28	0.44
29	0.39
30	0.32
31	0.27
32	0.23
33	0.18
34	0.14
35	0.12
36	0.11
37	0.12
38	0.13
39	0.14
40	0.12
41	0.17
42	0.21
43	0.22
44	0.29
45	0.3
46	0.34
47	0.33
48	0.34
49	0.34
50	0.32
51	0.31
52	0.24
53	0.22
54	0.18
55	0.18
56	0.16
57	0.11
58	0.08
59	0.07
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.03
68	0.04
69	0.04
70	0.05
71	0.04
72	0.05
73	0.07
74	0.08
75	0.09
76	0.1
77	0.11
78	0.11
79	0.11
80	0.12
81	0.11
82	0.11
83	0.16
84	0.15
85	0.14
86	0.16
87	0.24
88	0.27
89	0.27
90	0.26
91	0.28
92	0.32
93	0.34
94	0.36
95	0.31
96	0.27
97	0.27
98	0.27
99	0.23
100	0.21
101	0.24
102	0.21
103	0.22
104	0.22
105	0.22
106	0.23
107	0.2
108	0.22
109	0.18
110	0.24
111	0.23
112	0.25
113	0.24
114	0.23
115	0.26
116	0.22
117	0.24
118	0.21
119	0.19
120	0.22
121	0.26
122	0.3
123	0.33
124	0.38
125	0.38
126	0.38
127	0.4
128	0.38
129	0.45
130	0.5
131	0.53
132	0.54
133	0.52
134	0.5
135	0.46
136	0.45
137	0.41
138	0.37
139	0.33
140	0.33
141	0.35
142	0.37
143	0.42
144	0.47
145	0.48
146	0.45
147	0.44
148	0.4
149	0.44
150	0.43
151	0.37
152	0.33
153	0.26
154	0.22
155	0.21
156	0.2
157	0.15
158	0.14
159	0.15
160	0.18
161	0.27
162	0.32
163	0.35
164	0.35
165	0.39
166	0.41
167	0.41
168	0.36
169	0.28
170	0.24
171	0.21
172	0.2
173	0.18
174	0.15
175	0.19
176	0.2
177	0.22
178	0.29
179	0.38
180	0.46
181	0.53
182	0.63
183	0.69
184	0.77
185	0.84
186	0.83
187	0.8
188	0.72
189	0.66
190	0.57
191	0.53
192	0.43
193	0.34
194	0.25
195	0.2
196	0.17
197	0.13
198	0.12
199	0.05
200	0.05
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.14
219	0.15
220	0.15
221	0.15
222	0.17
223	0.14
224	0.14
225	0.16
226	0.14
227	0.12
228	0.12
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.13
233	0.11
234	0.11
235	0.14
236	0.14
237	0.18
238	0.16
239	0.18
240	0.17
241	0.19
242	0.19
243	0.16
244	0.16
245	0.14
246	0.13
247	0.1
248	0.08
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.03
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.07
258	0.11
259	0.15
260	0.19
261	0.19
262	0.21
263	0.24
264	0.26
265	0.29
266	0.29
267	0.3
268	0.28
269	0.29
270	0.27
271	0.25
272	0.23
273	0.23
274	0.18
275	0.14
276	0.13
277	0.14
278	0.17
279	0.19
280	0.26
281	0.3
282	0.41
283	0.43
284	0.48
285	0.49
286	0.47
287	0.52
288	0.55
289	0.56
290	0.49
291	0.51
292	0.51
293	0.5
294	0.49
295	0.41
296	0.31
297	0.22
298	0.18
299	0.14
300	0.09
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.09
306	0.09
307	0.11
308	0.12
309	0.12
310	0.14
311	0.13
312	0.18
313	0.22
314	0.23
315	0.25
316	0.24
317	0.25
318	0.24
319	0.28
320	0.3
321	0.27
322	0.26
323	0.23
324	0.23
325	0.22
326	0.24
327	0.24
328	0.19
329	0.16
330	0.14
331	0.15
332	0.16
333	0.15
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.12
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.12
348	0.14
349	0.15
350	0.15
351	0.17
352	0.21
353	0.25
354	0.31
355	0.31
356	0.36
357	0.42
358	0.47
359	0.45
360	0.43
361	0.4
362	0.39
363	0.45
364	0.44
365	0.48
366	0.49
367	0.57
368	0.66
369	0.73
370	0.75
371	0.73
372	0.78
373	0.74
374	0.69
375	0.66
376	0.6
377	0.57
378	0.52
379	0.44
380	0.34
381	0.3
382	0.28
383	0.24
384	0.19
385	0.12
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.12
404	0.17
405	0.22
406	0.3
407	0.33
408	0.36
409	0.39
410	0.46
411	0.51
412	0.48
413	0.51
414	0.51
415	0.56
416	0.53
417	0.54
418	0.47
419	0.43
420	0.41
421	0.33
422	0.26
423	0.17
424	0.16
425	0.13
426	0.13
427	0.09
428	0.09
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.13
437	0.11
438	0.11
439	0.1
440	0.1
441	0.1
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.1
451	0.2
452	0.27
453	0.34
454	0.44
455	0.54
456	0.64
457	0.69
458	0.75
459	0.73
460	0.76
461	0.78
462	0.79
463	0.8
464	0.73
465	0.7
466	0.63
467	0.57
468	0.48
469	0.45
470	0.39
471	0.36
472	0.36
473	0.36
474	0.37
475	0.35
476	0.36
477	0.35
478	0.34
479	0.26
480	0.24
481	0.22
482	0.2

A0A179H320

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer