Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HMS0

Protein Details
Accession A0A179HMS0    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-51EREPETVRFRSKKRKIGYRQRADDDDDBasic
257-281AAAGPSSKPRRGRNRRGSDDIKRDQHydrophilic
325-351QYLDEMAQRRQRKRPAQPASRQQQPQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-39RSKKRK
252-273RAEKAAAAGPSSKPRRGRNRRG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010756  Tls1-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004386  F:helicase activity  
KEGG plj:VFPFJ_05127  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07052  Hep_59  
Amino Acid Sequences MAEEASPAGAARRPEDAAPTKPESEREPETVRFRSKKRKIGYRQRADDDDDDAAPVAPRSTTFTATSDAPPKADSASPRPDAHDAAPASSSSSSQEESAVAAALRLRNARRARPRVGVGLASSSHPADEGPGSSSSRGLVPRGANAEADEDARPSLRGIGDRFTHQTGLVASLNDRHMTEYIESRLSSRTAPSQGSASHPLDGEEPHHVPSRTGPSSSIKAVTEQPAKHGKLLEVQVPDRVWDRRDEAQRLRAEKAAAAGPSSKPRRGRNRRGSDDIKRDQLVEQFLHENRLDVYDVPTPAPPRPSAPGDDTSADDRMAEQFRQQYLDEMAQRRQRKRPAQPASRQQQPQGDVLKGPKLGGSRNQRAAVRDALLKQEKEKAGKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.28
3 0.32
4 0.35
5 0.4
6 0.43
7 0.44
8 0.44
9 0.46
10 0.42
11 0.43
12 0.43
13 0.42
14 0.43
15 0.45
16 0.5
17 0.54
18 0.59
19 0.6
20 0.64
21 0.69
22 0.73
23 0.76
24 0.79
25 0.82
26 0.84
27 0.88
28 0.9
29 0.9
30 0.89
31 0.86
32 0.81
33 0.75
34 0.66
35 0.58
36 0.49
37 0.38
38 0.3
39 0.24
40 0.2
41 0.15
42 0.13
43 0.1
44 0.07
45 0.08
46 0.14
47 0.16
48 0.18
49 0.2
50 0.21
51 0.23
52 0.26
53 0.29
54 0.29
55 0.27
56 0.25
57 0.24
58 0.23
59 0.23
60 0.23
61 0.24
62 0.25
63 0.32
64 0.35
65 0.36
66 0.39
67 0.39
68 0.38
69 0.35
70 0.35
71 0.27
72 0.24
73 0.24
74 0.2
75 0.2
76 0.17
77 0.17
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.14
93 0.15
94 0.23
95 0.28
96 0.37
97 0.45
98 0.52
99 0.56
100 0.58
101 0.6
102 0.56
103 0.53
104 0.45
105 0.35
106 0.3
107 0.25
108 0.2
109 0.18
110 0.13
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.2
130 0.2
131 0.17
132 0.16
133 0.17
134 0.13
135 0.14
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.07
142 0.09
143 0.08
144 0.11
145 0.12
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.16
153 0.16
154 0.13
155 0.15
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.12
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.11
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.18
183 0.22
184 0.19
185 0.18
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.18
198 0.24
199 0.22
200 0.22
201 0.22
202 0.22
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.23
210 0.26
211 0.23
212 0.27
213 0.33
214 0.33
215 0.33
216 0.32
217 0.27
218 0.26
219 0.28
220 0.28
221 0.23
222 0.23
223 0.24
224 0.23
225 0.23
226 0.21
227 0.2
228 0.17
229 0.17
230 0.2
231 0.25
232 0.32
233 0.38
234 0.39
235 0.45
236 0.49
237 0.5
238 0.47
239 0.42
240 0.36
241 0.3
242 0.28
243 0.23
244 0.18
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.24
249 0.27
250 0.3
251 0.34
252 0.43
253 0.54
254 0.63
255 0.72
256 0.74
257 0.81
258 0.84
259 0.86
260 0.85
261 0.83
262 0.82
263 0.76
264 0.7
265 0.6
266 0.53
267 0.46
268 0.42
269 0.36
270 0.27
271 0.24
272 0.24
273 0.24
274 0.27
275 0.25
276 0.21
277 0.18
278 0.19
279 0.18
280 0.13
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.18
285 0.2
286 0.2
287 0.22
288 0.25
289 0.22
290 0.21
291 0.26
292 0.28
293 0.3
294 0.32
295 0.33
296 0.33
297 0.33
298 0.32
299 0.3
300 0.28
301 0.23
302 0.18
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.17
307 0.18
308 0.23
309 0.24
310 0.27
311 0.26
312 0.25
313 0.25
314 0.3
315 0.33
316 0.32
317 0.38
318 0.43
319 0.52
320 0.55
321 0.61
322 0.65
323 0.69
324 0.76
325 0.8
326 0.83
327 0.85
328 0.88
329 0.9
330 0.88
331 0.87
332 0.8
333 0.75
334 0.71
335 0.63
336 0.6
337 0.54
338 0.48
339 0.42
340 0.42
341 0.41
342 0.35
343 0.32
344 0.28
345 0.26
346 0.29
347 0.34
348 0.41
349 0.45
350 0.52
351 0.57
352 0.57
353 0.58
354 0.58
355 0.53
356 0.46
357 0.43
358 0.38
359 0.42
360 0.46
361 0.45
362 0.44
363 0.47
364 0.5
365 0.53