Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HQM9

Protein Details
Accession A0A179HQM9    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-43DGKAKKPRMDDSKPSKRPAKEBasic
108-137ADEVHRTKKIWERLRRKSHVPKDERQKLVEBasic
621-643GESGELKKTLKKNKKALEKAATEHydrophilic
657-681EKTDKADKGGKKGNKKKTEAPVGNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-41GDKRKSSSGTKAKADGKAKKPRMDDSKPSKRPA
112-126HRTKKIWERLRRKSH
629-637TLKKNKKAL
651-674AKEAKAEKTDKADKGGKKGNKKKT
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_03509  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MASKDAKVGDKRKSSSGTKAKADGKAKKPRMDDSKPSKRPAKEESDDFESFSDEDEDGGVKLDGKSGNAPKAGGDKANAFDRSGMTSRESHAKQKQLAQERKAAKPLADEVHRTKKIWERLRRKSHVPKDERQKLVEELFTIITGRCKDFVLKHDAVRAVQTAIKYSTPEQRKQIAHELEGSYAQLAESRYAKFLIGKLLVQNDDEIRDLVIPNFYGKVRKLINHAEASWILDDIYRTVATKEQKASLLREWYGPEFSLRELTKDTTPTADLKEILTKEPSKRGPIMKSLVDMINTLIQKKMTGFTMLHDAMFQYYSNTTPGTEEFTEFIELIKGDEGGDLLKNMAFTKSGARLSCLLLAHGTSKDRKQLLKTYKDTLVLMAGDSYAHLVILTAFDVIDDTKLVAKSVFPELLGDKEDEVVQNVVGAVNNPNARLTLLYLFEGLSKSLFPASHSFDWEILQEVHEIRKTTSKKDDDVRRKELITAFAPQLLSVIAAGSSELTSTAFGCQFVADVLLSEVEGKEAALEAIAQSAKGDPKEEPAEDELAAPPHISRTPFGGRMLKSLIQGGRFDKAAGKVVQVEPPLEFANYLYPVIKDYVVDWATGPSSFVVVAMVEAADFGESGELKKTLKKNKKALEKAATEMTPEQAAAKEAKAEKTDKADKGGKKGNKKKTEAPVGNAGSKILLEKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.65
3 0.68
4 0.66
5 0.63
6 0.67
7 0.67
8 0.69
9 0.73
10 0.72
11 0.72
12 0.75
13 0.77
14 0.77
15 0.75
16 0.76
17 0.77
18 0.76
19 0.77
20 0.77
21 0.8
22 0.8
23 0.83
24 0.82
25 0.78
26 0.76
27 0.74
28 0.73
29 0.69
30 0.68
31 0.66
32 0.65
33 0.6
34 0.54
35 0.45
36 0.37
37 0.3
38 0.24
39 0.2
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.22
53 0.26
54 0.31
55 0.31
56 0.31
57 0.28
58 0.33
59 0.34
60 0.28
61 0.25
62 0.24
63 0.26
64 0.33
65 0.32
66 0.27
67 0.26
68 0.25
69 0.29
70 0.28
71 0.26
72 0.22
73 0.23
74 0.26
75 0.33
76 0.35
77 0.38
78 0.43
79 0.49
80 0.5
81 0.56
82 0.62
83 0.64
84 0.7
85 0.65
86 0.67
87 0.65
88 0.66
89 0.64
90 0.57
91 0.47
92 0.43
93 0.44
94 0.42
95 0.39
96 0.4
97 0.41
98 0.5
99 0.51
100 0.48
101 0.48
102 0.5
103 0.56
104 0.61
105 0.64
106 0.64
107 0.73
108 0.83
109 0.84
110 0.85
111 0.86
112 0.86
113 0.86
114 0.84
115 0.82
116 0.83
117 0.86
118 0.8
119 0.71
120 0.65
121 0.58
122 0.53
123 0.45
124 0.35
125 0.27
126 0.23
127 0.21
128 0.18
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.19
136 0.22
137 0.27
138 0.32
139 0.33
140 0.33
141 0.38
142 0.39
143 0.35
144 0.33
145 0.29
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.17
153 0.19
154 0.26
155 0.31
156 0.36
157 0.39
158 0.45
159 0.46
160 0.49
161 0.56
162 0.5
163 0.45
164 0.44
165 0.4
166 0.33
167 0.31
168 0.26
169 0.16
170 0.13
171 0.11
172 0.09
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.15
180 0.14
181 0.15
182 0.18
183 0.17
184 0.17
185 0.19
186 0.21
187 0.21
188 0.2
189 0.2
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.13
204 0.14
205 0.19
206 0.21
207 0.23
208 0.28
209 0.33
210 0.38
211 0.37
212 0.37
213 0.33
214 0.31
215 0.3
216 0.25
217 0.18
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.07
222 0.09
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.13
227 0.15
228 0.2
229 0.21
230 0.22
231 0.26
232 0.28
233 0.31
234 0.3
235 0.32
236 0.28
237 0.28
238 0.28
239 0.25
240 0.24
241 0.21
242 0.18
243 0.14
244 0.13
245 0.17
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.2
253 0.15
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.19
264 0.21
265 0.22
266 0.29
267 0.3
268 0.29
269 0.33
270 0.37
271 0.36
272 0.38
273 0.4
274 0.33
275 0.32
276 0.31
277 0.27
278 0.22
279 0.19
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.19
343 0.17
344 0.13
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.13
352 0.18
353 0.21
354 0.23
355 0.25
356 0.33
357 0.4
358 0.46
359 0.48
360 0.47
361 0.47
362 0.46
363 0.42
364 0.34
365 0.26
366 0.17
367 0.14
368 0.09
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.12
400 0.13
401 0.11
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.09
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.1
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.09
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.12
438 0.18
439 0.19
440 0.22
441 0.22
442 0.21
443 0.21
444 0.2
445 0.18
446 0.13
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.13
451 0.14
452 0.15
453 0.14
454 0.22
455 0.24
456 0.28
457 0.36
458 0.38
459 0.41
460 0.49
461 0.58
462 0.61
463 0.67
464 0.67
465 0.61
466 0.58
467 0.57
468 0.51
469 0.45
470 0.36
471 0.31
472 0.25
473 0.24
474 0.24
475 0.19
476 0.17
477 0.12
478 0.1
479 0.06
480 0.06
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.09
520 0.12
521 0.12
522 0.14
523 0.12
524 0.18
525 0.23
526 0.23
527 0.24
528 0.23
529 0.25
530 0.23
531 0.24
532 0.19
533 0.16
534 0.16
535 0.13
536 0.11
537 0.11
538 0.14
539 0.14
540 0.13
541 0.18
542 0.23
543 0.26
544 0.31
545 0.35
546 0.33
547 0.36
548 0.39
549 0.36
550 0.31
551 0.34
552 0.32
553 0.27
554 0.3
555 0.28
556 0.26
557 0.24
558 0.23
559 0.22
560 0.22
561 0.25
562 0.23
563 0.23
564 0.25
565 0.27
566 0.3
567 0.27
568 0.26
569 0.2
570 0.22
571 0.21
572 0.17
573 0.15
574 0.11
575 0.14
576 0.15
577 0.15
578 0.14
579 0.13
580 0.15
581 0.16
582 0.16
583 0.12
584 0.11
585 0.18
586 0.18
587 0.18
588 0.17
589 0.17
590 0.17
591 0.17
592 0.17
593 0.09
594 0.09
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.06
610 0.07
611 0.1
612 0.11
613 0.12
614 0.2
615 0.28
616 0.37
617 0.48
618 0.57
619 0.64
620 0.73
621 0.83
622 0.85
623 0.87
624 0.85
625 0.79
626 0.73
627 0.69
628 0.6
629 0.52
630 0.44
631 0.36
632 0.27
633 0.23
634 0.2
635 0.14
636 0.16
637 0.15
638 0.14
639 0.19
640 0.22
641 0.27
642 0.3
643 0.32
644 0.34
645 0.41
646 0.5
647 0.45
648 0.5
649 0.54
650 0.54
651 0.61
652 0.66
653 0.66
654 0.68
655 0.76
656 0.79
657 0.8
658 0.82
659 0.82
660 0.83
661 0.86
662 0.81
663 0.76
664 0.76
665 0.7
666 0.67
667 0.57
668 0.47
669 0.36
670 0.3