FuNGI

A0A179HKA3

Protein Details

Accession

A0A179HKA3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
357-377	KEAEYKRSLKQKKNKNKAGAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
362-388	KRSLKQKKNKNKAGAAGDGGGRGGGHR
439-466	GFHRGGRRGEHRGRGGRGRGGFGRGGRG

Subcellular Location(s)

cyto 16, cyto_nucl 12.5, nucl 7, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	plj:VFPFJ_06395 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSGFQIPGLGQAKPNESLPPVPADTAIAAVASAGPEEHMPDAESSTAQPTALATEAAPSSSHGDGKPTELQDATETHTATEDSMVVDRAESPSLTSALEAAIGGLGETATETTEATEVIATTTAEPQPPLQEPAGTVELQNDHGDNPEWEIDSSPYESSTDSSSSDSSDQDSDNEGYELLGVEETARLLMDAEAGGSDDEGERGGRSGNGSQLRTKNELAEEAIPRPDVTITVDMKIEELGSVEHIVENVMLIKAFTPGEYQVLDTGSVLCNADRVVIGAVAETIGKVLQPMYTVRFNSEDEIKELGVELGTKIFYPVDHASFVFTEPLKNMKGSDASNIHDEEVGDDEMEFSDDEKEAEYKRSLKQKKNKNKAGAAGDGGGRGGGHRGAHPLRQEVSASSDTLNYDDDDGPYKPLTRPPGFGAGGPSSEPVELPPRSGFHRGGRRGEHRGRGGRGRGGFGRGGRGGDNNPPRDGYSQAPHGYGQYPQHAQQPQQQPQQQPAWAGPSHPAPQSQAPAPSMPAFGFQFPGWPQPQGQQGVPSSGPLPPPPPPPGWPGQGKQQQQQQPGGGAFVNPALLAALMSQMQAQSGGQQWGGQQQHPPPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.26
3	0.27
4	0.28
5	0.27
6	0.29
7	0.27
8	0.25
9	0.24
10	0.22
11	0.2
12	0.18
13	0.15
14	0.09
15	0.08
16	0.07
17	0.07
18	0.06
19	0.05
20	0.04
21	0.05
22	0.05
23	0.07
24	0.08
25	0.09
26	0.1
27	0.1
28	0.12
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.14
33	0.14
34	0.13
35	0.12
36	0.11
37	0.12
38	0.12
39	0.11
40	0.08
41	0.11
42	0.11
43	0.12
44	0.12
45	0.11
46	0.14
47	0.15
48	0.18
49	0.15
50	0.19
51	0.2
52	0.24
53	0.29
54	0.27
55	0.28
56	0.25
57	0.26
58	0.24
59	0.25
60	0.25
61	0.22
62	0.21
63	0.18
64	0.19
65	0.18
66	0.16
67	0.15
68	0.11
69	0.09
70	0.1
71	0.11
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.11
78	0.11
79	0.12
80	0.13
81	0.12
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.09
86	0.07
87	0.05
88	0.05
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.03
93	0.03
94	0.03
95	0.03
96	0.04
97	0.04
98	0.04
99	0.05
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.07
107	0.06
108	0.07
109	0.11
110	0.12
111	0.12
112	0.13
113	0.13
114	0.17
115	0.19
116	0.21
117	0.18
118	0.17
119	0.17
120	0.21
121	0.23
122	0.19
123	0.17
124	0.16
125	0.17
126	0.18
127	0.18
128	0.14
129	0.11
130	0.13
131	0.14
132	0.12
133	0.13
134	0.13
135	0.13
136	0.13
137	0.14
138	0.13
139	0.14
140	0.15
141	0.13
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.12
146	0.13
147	0.12
148	0.11
149	0.13
150	0.13
151	0.14
152	0.15
153	0.14
154	0.14
155	0.14
156	0.14
157	0.13
158	0.16
159	0.15
160	0.14
161	0.14
162	0.12
163	0.1
164	0.1
165	0.09
166	0.06
167	0.05
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.03
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.04
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.08
194	0.09
195	0.15
196	0.19
197	0.21
198	0.26
199	0.3
200	0.34
201	0.36
202	0.35
203	0.31
204	0.27
205	0.27
206	0.23
207	0.23
208	0.21
209	0.18
210	0.18
211	0.16
212	0.15
213	0.15
214	0.13
215	0.09
216	0.1
217	0.13
218	0.13
219	0.14
220	0.15
221	0.14
222	0.14
223	0.14
224	0.11
225	0.06
226	0.05
227	0.04
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.05
278	0.06
279	0.09
280	0.12
281	0.12
282	0.14
283	0.15
284	0.15
285	0.16
286	0.19
287	0.16
288	0.15
289	0.16
290	0.14
291	0.12
292	0.12
293	0.1
294	0.07
295	0.06
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.09
304	0.1
305	0.11
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.13
310	0.13
311	0.11
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.11
320	0.13
321	0.13
322	0.17
323	0.17
324	0.17
325	0.19
326	0.19
327	0.18
328	0.16
329	0.15
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.06
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.08
345	0.08
346	0.11
347	0.13
348	0.16
349	0.21
350	0.31
351	0.39
352	0.47
353	0.55
354	0.63
355	0.72
356	0.8
357	0.83
358	0.81
359	0.77
360	0.75
361	0.7
362	0.61
363	0.51
364	0.42
365	0.33
366	0.25
367	0.2
368	0.13
369	0.08
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.13
376	0.14
377	0.18
378	0.2
379	0.22
380	0.22
381	0.23
382	0.23
383	0.18
384	0.21
385	0.19
386	0.18
387	0.15
388	0.15
389	0.14
390	0.14
391	0.14
392	0.09
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.13
397	0.13
398	0.14
399	0.14
400	0.16
401	0.15
402	0.19
403	0.27
404	0.26
405	0.28
406	0.29
407	0.36
408	0.34
409	0.33
410	0.33
411	0.26
412	0.24
413	0.22
414	0.2
415	0.13
416	0.13
417	0.12
418	0.09
419	0.15
420	0.14
421	0.16
422	0.17
423	0.18
424	0.22
425	0.26
426	0.28
427	0.3
428	0.4
429	0.44
430	0.49
431	0.54
432	0.57
433	0.62
434	0.66
435	0.65
436	0.63
437	0.64
438	0.63
439	0.63
440	0.61
441	0.57
442	0.52
443	0.48
444	0.42
445	0.38
446	0.36
447	0.3
448	0.31
449	0.26
450	0.25
451	0.22
452	0.23
453	0.22
454	0.28
455	0.35
456	0.33
457	0.33
458	0.33
459	0.33
460	0.33
461	0.33
462	0.29
463	0.26
464	0.3
465	0.3
466	0.3
467	0.29
468	0.29
469	0.27
470	0.27
471	0.25
472	0.24
473	0.26
474	0.26
475	0.34
476	0.35
477	0.36
478	0.41
479	0.48
480	0.51
481	0.57
482	0.61
483	0.56
484	0.6
485	0.62
486	0.55
487	0.47
488	0.4
489	0.37
490	0.31
491	0.29
492	0.26
493	0.26
494	0.27
495	0.27
496	0.27
497	0.25
498	0.29
499	0.32
500	0.32
501	0.31
502	0.29
503	0.29
504	0.3
505	0.28
506	0.25
507	0.2
508	0.21
509	0.18
510	0.17
511	0.18
512	0.16
513	0.18
514	0.19
515	0.25
516	0.23
517	0.24
518	0.25
519	0.27
520	0.34
521	0.33
522	0.33
523	0.32
524	0.31
525	0.34
526	0.32
527	0.29
528	0.24
529	0.23
530	0.24
531	0.2
532	0.23
533	0.23
534	0.29
535	0.33
536	0.35
537	0.35
538	0.39
539	0.43
540	0.46
541	0.48
542	0.45
543	0.51
544	0.56
545	0.59
546	0.6
547	0.64
548	0.64
549	0.63
550	0.66
551	0.58
552	0.54
553	0.48
554	0.43
555	0.34
556	0.27
557	0.21
558	0.16
559	0.14
560	0.09
561	0.09
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.06
567	0.06
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.1
575	0.14
576	0.16
577	0.15
578	0.16
579	0.17
580	0.25
581	0.28
582	0.27
583	0.3

A0A179HKA3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer