Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179H5Q7

Protein Details
Accession A0A179H5Q7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-395LGNYTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-299RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG plj:VFPFJ_07905  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPLIHDESAPAMVLNPTQVPGGSKAKRLDDLASELGSDAANIRANEGEAASYGVYFDDTEYDYMQHLRDLNTGGGDVVFVEAETGNKNKGKQKQSLEDALRQMDLEQKSGDVLDDEILPSKNLTRITYEAQQDVPDAIRGFQPDMDPRLREVLEALEDDAFVDEAGDDDLFQQLAKDGRELDDYEFEGEQYDEDDDEGWESDDTAKPIKEFKDEVPELVKAPTEQPEEGPSQDWLEDFKKFKKEQKSGRAPIAPSQSELQSTWTTTTNGGRRKKRKGALTEASSFSMTSSSLVRTEQMTLLDARFDKIEEAYNEDEEDDMASVSAVSAVSSVTGATRGDFDNILDDFLGNYTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLDEIRQGLGPARIRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.53
8 0.51
9 0.57
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.42
14 0.38
15 0.35
16 0.31
17 0.24
18 0.23
19 0.2
20 0.14
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.12
30 0.17
31 0.26
32 0.27
33 0.33
34 0.37
35 0.4
36 0.43
37 0.43
38 0.4
39 0.34
40 0.37
41 0.33
42 0.28
43 0.25
44 0.21
45 0.2
46 0.16
47 0.13
48 0.08
49 0.08
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.13
57 0.11
58 0.07
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.09
86 0.07
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.07
94 0.08
95 0.12
96 0.14
97 0.19
98 0.26
99 0.35
100 0.41
101 0.47
102 0.54
103 0.59
104 0.62
105 0.67
106 0.64
107 0.6
108 0.56
109 0.49
110 0.41
111 0.33
112 0.27
113 0.25
114 0.22
115 0.18
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.21
137 0.27
138 0.27
139 0.26
140 0.25
141 0.24
142 0.21
143 0.19
144 0.16
145 0.12
146 0.1
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.17
155 0.19
156 0.18
157 0.18
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.16
162 0.13
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.27
223 0.27
224 0.27
225 0.26
226 0.26
227 0.23
228 0.21
229 0.2
230 0.11
231 0.12
232 0.16
233 0.16
234 0.15
235 0.15
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.18
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.16
247 0.18
248 0.22
249 0.3
250 0.33
251 0.4
252 0.47
253 0.55
254 0.6
255 0.69
256 0.74
257 0.71
258 0.75
259 0.72
260 0.63
261 0.6
262 0.58
263 0.47
264 0.38
265 0.35
266 0.28
267 0.25
268 0.24
269 0.22
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.23
277 0.26
278 0.33
279 0.41
280 0.5
281 0.57
282 0.66
283 0.73
284 0.74
285 0.76
286 0.76
287 0.78
288 0.77
289 0.74
290 0.69
291 0.61
292 0.56
293 0.47
294 0.39
295 0.29
296 0.2
297 0.14
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.14
311 0.17
312 0.16
313 0.15
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.18
319 0.15
320 0.2
321 0.21
322 0.22
323 0.21
324 0.2
325 0.19
326 0.14
327 0.14
328 0.09
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.15
352 0.15
353 0.16
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.08
360 0.1
361 0.17
362 0.2
363 0.23
364 0.31
365 0.41
366 0.48
367 0.6
368 0.69
369 0.73
370 0.79
371 0.87
372 0.89
373 0.88
374 0.86
375 0.84
376 0.83
377 0.77
378 0.68
379 0.59
380 0.49
381 0.43
382 0.37
383 0.28
384 0.19
385 0.14
386 0.14
387 0.16
388 0.22
389 0.23