FuNGI

A0A179HJS4

Protein Details

Accession

A0A179HJS4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-40	DPSAKRARKHTGAQRLHQHQNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
KEGG	plj:VFPFJ_06133 -
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MATKRDYDDVDDGEVTDDDPSAKRARKHTGAQRLHQHQNAAIDPTWGQKYVFSNISEMSTIPYGEESDFEDDADAMAYLRSVREQALGIPHMLVAPKKQIGPQLPPELRQASEEARNDDGDGDGEDEDEPAQADYGEYQSGAEARGWYEDGAYIAQAESESYGQPGDEGDSERELHQAYYASILARYRRLRSTLHAEPPTSAARRLPSGRPTTAAPLDGKSTTHKTWSAAMRNTDPHPLQLALMSKDSVIRVLRVLLGGRFLRLGYTLSERTSQWVWALLARLPEPWELDHTEIGWVRDLGRRAILLGRSLAEMAALRDDLEEGQLGVHEMVDQSSSVELGTDAYVGYGVDSADSDAADGPRQKDKEMQETKQVEENDDDTKEVESEEEGQISDDDNGDAASVAMDLSSGSEDGEVAPSVQAPDDGHAALEAAKQAFLARLEGDATVDAPEDESEEAQEAARLRLRINMRATLDMILTVAGEFYGQRDLLDFRQPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.17
3	0.13
4	0.11
5	0.1
6	0.11
7	0.14
8	0.2
9	0.25
10	0.31
11	0.38
12	0.47
13	0.53
14	0.62
15	0.69
16	0.73
17	0.76
18	0.79
19	0.82
20	0.81
21	0.81
22	0.74
23	0.67
24	0.58
25	0.55
26	0.49
27	0.43
28	0.35
29	0.29
30	0.26
31	0.28
32	0.28
33	0.23
34	0.21
35	0.2
36	0.24
37	0.27
38	0.31
39	0.27
40	0.27
41	0.27
42	0.28
43	0.25
44	0.21
45	0.18
46	0.15
47	0.14
48	0.12
49	0.12
50	0.12
51	0.11
52	0.12
53	0.12
54	0.15
55	0.15
56	0.15
57	0.14
58	0.13
59	0.13
60	0.12
61	0.09
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.06
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.1
71	0.11
72	0.13
73	0.18
74	0.19
75	0.18
76	0.17
77	0.17
78	0.16
79	0.17
80	0.15
81	0.12
82	0.17
83	0.19
84	0.2
85	0.22
86	0.28
87	0.31
88	0.37
89	0.43
90	0.48
91	0.47
92	0.47
93	0.5
94	0.46
95	0.41
96	0.36
97	0.31
98	0.25
99	0.31
100	0.31
101	0.29
102	0.29
103	0.28
104	0.27
105	0.24
106	0.2
107	0.14
108	0.11
109	0.1
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.07
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.07
140	0.06
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.07
155	0.08
156	0.09
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.1
164	0.1
165	0.09
166	0.1
167	0.1
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.12
172	0.18
173	0.21
174	0.23
175	0.25
176	0.28
177	0.28
178	0.32
179	0.38
180	0.39
181	0.44
182	0.43
183	0.41
184	0.39
185	0.4
186	0.38
187	0.31
188	0.25
189	0.19
190	0.17
191	0.21
192	0.24
193	0.25
194	0.28
195	0.32
196	0.31
197	0.31
198	0.31
199	0.32
200	0.29
201	0.27
202	0.21
203	0.17
204	0.18
205	0.17
206	0.16
207	0.15
208	0.19
209	0.17
210	0.19
211	0.2
212	0.19
213	0.24
214	0.29
215	0.32
216	0.31
217	0.33
218	0.33
219	0.35
220	0.35
221	0.34
222	0.28
223	0.22
224	0.2
225	0.18
226	0.16
227	0.15
228	0.16
229	0.12
230	0.12
231	0.12
232	0.1
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.09
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.09
241	0.08
242	0.09
243	0.07
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.07
253	0.11
254	0.12
255	0.13
256	0.15
257	0.14
258	0.17
259	0.16
260	0.15
261	0.12
262	0.12
263	0.12
264	0.11
265	0.13
266	0.11
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.11
271	0.12
272	0.11
273	0.11
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.12
279	0.13
280	0.14
281	0.13
282	0.12
283	0.1
284	0.1
285	0.13
286	0.14
287	0.13
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.15
292	0.14
293	0.12
294	0.12
295	0.12
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.09
346	0.12
347	0.14
348	0.21
349	0.22
350	0.22
351	0.28
352	0.32
353	0.4
354	0.45
355	0.45
356	0.48
357	0.5
358	0.51
359	0.5
360	0.47
361	0.38
362	0.32
363	0.32
364	0.25
365	0.23
366	0.21
367	0.16
368	0.16
369	0.14
370	0.12
371	0.1
372	0.08
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.08
410	0.09
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.1
418	0.11
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.12
424	0.12
425	0.12
426	0.1
427	0.11
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.07
438	0.08
439	0.09
440	0.08
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.12
446	0.12
447	0.14
448	0.18
449	0.19
450	0.18
451	0.25
452	0.29
453	0.34
454	0.38
455	0.41
456	0.4
457	0.42
458	0.43
459	0.37
460	0.33
461	0.25
462	0.21
463	0.14
464	0.11
465	0.08
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.12
475	0.15
476	0.18
477	0.28
478	0.27
479	0.25

A0A179HJS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer