Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HU12

Protein Details
Accession A0A179HU12    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-88QSLEALKSKRCKRLKIRHLNSAHAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-206KRKAKPGKAAKD
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 9.5, pero 5, nucl 4.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG plj:VFPFJ_02149  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MAGVAEKARFYLERSVPQLREWEDKGVFSKEEIRNIVQKRNDYEHRVLSPGNMPTEWSSYAKWEQSLEALKSKRCKRLKIRHLNSAHAGQGRVLAIYERAVNRHPQSGELWREYLAYTANVKATKRWRKTMTNALRMNPTDPELWVMAGRRAARNGDMASSRGFFMRGCRFCNKECGLWVEYARSEMEWLAKVDKRKAKPGKAAKDPLRPDRVDADDELRIEDSDEGEDEDNELPVPSRAQAKAIDEQESEQLKSNPAMDGAIPIAIFDISRKQAFFKPEVAEVFYVMLGGFRDVSVQPKVAQHVLNVMEEQFPDDPATCSCYIRQPILGLSPHTADFPSNLRTVLGRLTEKLESTTDRTRLAQKTAAWIDEYLALEDLDDGIRAVLELTKNKVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.5
3 0.48
4 0.5
5 0.53
6 0.47
7 0.49
8 0.44
9 0.45
10 0.39
11 0.4
12 0.42
13 0.38
14 0.35
15 0.3
16 0.37
17 0.33
18 0.38
19 0.4
20 0.4
21 0.44
22 0.48
23 0.54
24 0.5
25 0.52
26 0.52
27 0.57
28 0.6
29 0.6
30 0.61
31 0.6
32 0.57
33 0.53
34 0.47
35 0.42
36 0.4
37 0.36
38 0.33
39 0.26
40 0.25
41 0.25
42 0.28
43 0.27
44 0.24
45 0.21
46 0.23
47 0.28
48 0.28
49 0.27
50 0.25
51 0.23
52 0.26
53 0.32
54 0.29
55 0.32
56 0.34
57 0.37
58 0.45
59 0.52
60 0.57
61 0.58
62 0.66
63 0.69
64 0.77
65 0.83
66 0.85
67 0.85
68 0.85
69 0.82
70 0.78
71 0.71
72 0.62
73 0.55
74 0.46
75 0.39
76 0.29
77 0.28
78 0.22
79 0.18
80 0.15
81 0.11
82 0.09
83 0.1
84 0.13
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.22
89 0.23
90 0.29
91 0.28
92 0.26
93 0.29
94 0.35
95 0.39
96 0.35
97 0.33
98 0.27
99 0.28
100 0.26
101 0.23
102 0.16
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.15
107 0.17
108 0.17
109 0.22
110 0.32
111 0.4
112 0.44
113 0.51
114 0.55
115 0.6
116 0.66
117 0.72
118 0.71
119 0.71
120 0.69
121 0.63
122 0.61
123 0.55
124 0.49
125 0.39
126 0.31
127 0.22
128 0.18
129 0.18
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.14
148 0.14
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.14
153 0.22
154 0.24
155 0.27
156 0.31
157 0.34
158 0.35
159 0.43
160 0.39
161 0.32
162 0.31
163 0.31
164 0.28
165 0.26
166 0.26
167 0.19
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.11
178 0.13
179 0.16
180 0.22
181 0.29
182 0.3
183 0.39
184 0.45
185 0.48
186 0.55
187 0.63
188 0.64
189 0.65
190 0.72
191 0.68
192 0.69
193 0.68
194 0.65
195 0.62
196 0.54
197 0.47
198 0.43
199 0.39
200 0.32
201 0.28
202 0.24
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.14
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.15
229 0.17
230 0.23
231 0.24
232 0.25
233 0.22
234 0.23
235 0.26
236 0.26
237 0.23
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.14
244 0.12
245 0.12
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.15
261 0.2
262 0.24
263 0.26
264 0.28
265 0.28
266 0.3
267 0.31
268 0.3
269 0.26
270 0.22
271 0.2
272 0.14
273 0.12
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.07
281 0.07
282 0.11
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.17
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.19
291 0.23
292 0.24
293 0.22
294 0.2
295 0.19
296 0.16
297 0.15
298 0.17
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.17
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.24
310 0.26
311 0.27
312 0.28
313 0.24
314 0.25
315 0.29
316 0.3
317 0.25
318 0.24
319 0.23
320 0.22
321 0.22
322 0.2
323 0.15
324 0.15
325 0.17
326 0.18
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.18
332 0.21
333 0.22
334 0.21
335 0.21
336 0.25
337 0.26
338 0.26
339 0.27
340 0.26
341 0.24
342 0.28
343 0.34
344 0.33
345 0.34
346 0.36
347 0.42
348 0.44
349 0.45
350 0.44
351 0.38
352 0.45
353 0.46
354 0.44
355 0.38
356 0.33
357 0.3
358 0.29
359 0.28
360 0.2
361 0.17
362 0.15
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.09
374 0.14
375 0.17