Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179H272

Protein Details
Accession A0A179H272    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
486-505LVAIPKRRRNDSRPVRPPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
479-503RPPRKLALVAIPKRRRNDSRPVRPP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
KEGG plj:VFPFJ_05294  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MSDHDAVAGPEDLTNASEAQEPSSSFADNSYLSYLIPSKTDLDLGSAVEEAKEQGKPILESIEARDSLYFDETATVLLILKCPWLGDEELAEQIRRLVVSLEVQIINRSAPGRESPPAAETIFTGHVADVSDAFIATEEHGVSDEGASQKHAYAMWKIPVFLARPRMRPHQPSVVFSASASIKPEVAGELSARGTGYLQSGLPMSFNLLESFADDPALNGVKPRLSALRVSRVAPVTRQQDLMTHLRALPQLKLNISPVIHTRIRFSRPNTVPLSSAVIALLEVDFTPNFECEALLDEIKLQTPDGTVESLNDGTAMKLPLSCVAHDHITFLYHIRPHQNDSAPKPVTGTLDISISASVLVEPGFCVPRLSMAWSTTLDFTIPVNPSFGTAAETGIQRSHRPAQLSIGSGTVMTPLKSPSVTQPDALPALEASTNRTEASLPDLGITMSFTAPNEPVRAGDIFSWTVYVVNRTAEKTSRPPRKLALVAIPKRRRNDSRPVRPPSTASRRQGEKEVADAVLDENVLHAMQKSSVVDTTDVVCLSSDTRVGPLAPGACHVVELQFLALREGVVAVDAIRVVDLGSQEHVDIRDLPTMVVEPAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.1
4 0.14
5 0.14
6 0.16
7 0.18
8 0.18
9 0.2
10 0.22
11 0.21
12 0.16
13 0.17
14 0.17
15 0.15
16 0.17
17 0.16
18 0.14
19 0.14
20 0.16
21 0.18
22 0.16
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.18
27 0.2
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.14
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.2
46 0.18
47 0.19
48 0.23
49 0.26
50 0.24
51 0.23
52 0.23
53 0.21
54 0.21
55 0.22
56 0.17
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.11
72 0.12
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.11
84 0.08
85 0.09
86 0.12
87 0.13
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.11
97 0.12
98 0.16
99 0.19
100 0.2
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.25
105 0.23
106 0.2
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.15
111 0.13
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.16
141 0.2
142 0.24
143 0.24
144 0.24
145 0.24
146 0.26
147 0.26
148 0.26
149 0.32
150 0.32
151 0.36
152 0.41
153 0.48
154 0.53
155 0.56
156 0.58
157 0.58
158 0.56
159 0.53
160 0.54
161 0.48
162 0.4
163 0.34
164 0.32
165 0.22
166 0.21
167 0.2
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.17
214 0.2
215 0.28
216 0.29
217 0.3
218 0.32
219 0.32
220 0.32
221 0.29
222 0.31
223 0.27
224 0.26
225 0.26
226 0.23
227 0.22
228 0.26
229 0.28
230 0.22
231 0.19
232 0.18
233 0.19
234 0.21
235 0.2
236 0.18
237 0.18
238 0.19
239 0.19
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.19
247 0.21
248 0.2
249 0.22
250 0.24
251 0.29
252 0.33
253 0.34
254 0.39
255 0.39
256 0.45
257 0.44
258 0.4
259 0.36
260 0.32
261 0.33
262 0.22
263 0.2
264 0.14
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.13
322 0.16
323 0.18
324 0.21
325 0.26
326 0.3
327 0.33
328 0.35
329 0.42
330 0.38
331 0.37
332 0.34
333 0.31
334 0.27
335 0.23
336 0.21
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.09
342 0.08
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.09
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.15
361 0.15
362 0.16
363 0.15
364 0.14
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.13
384 0.12
385 0.16
386 0.21
387 0.22
388 0.25
389 0.25
390 0.28
391 0.3
392 0.31
393 0.27
394 0.21
395 0.18
396 0.16
397 0.15
398 0.13
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.16
407 0.24
408 0.24
409 0.24
410 0.24
411 0.26
412 0.26
413 0.25
414 0.19
415 0.1
416 0.11
417 0.12
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.14
422 0.13
423 0.14
424 0.13
425 0.12
426 0.17
427 0.15
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.08
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.12
444 0.14
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.14
449 0.14
450 0.13
451 0.13
452 0.11
453 0.12
454 0.11
455 0.13
456 0.11
457 0.13
458 0.15
459 0.16
460 0.19
461 0.2
462 0.25
463 0.32
464 0.41
465 0.49
466 0.5
467 0.53
468 0.54
469 0.59
470 0.58
471 0.53
472 0.52
473 0.53
474 0.58
475 0.64
476 0.69
477 0.67
478 0.69
479 0.73
480 0.71
481 0.67
482 0.71
483 0.71
484 0.73
485 0.78
486 0.82
487 0.78
488 0.72
489 0.7
490 0.69
491 0.68
492 0.66
493 0.62
494 0.61
495 0.63
496 0.64
497 0.66
498 0.61
499 0.52
500 0.46
501 0.42
502 0.34
503 0.28
504 0.25
505 0.19
506 0.13
507 0.12
508 0.08
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.1
517 0.11
518 0.13
519 0.14
520 0.16
521 0.16
522 0.16
523 0.17
524 0.17
525 0.16
526 0.14
527 0.12
528 0.11
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.15
538 0.16
539 0.15
540 0.16
541 0.18
542 0.17
543 0.17
544 0.17
545 0.14
546 0.12
547 0.12
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.1
554 0.1
555 0.1
556 0.08
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.07
567 0.08
568 0.09
569 0.1
570 0.11
571 0.12
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.16
576 0.18
577 0.21
578 0.21
579 0.2
580 0.19
581 0.19
582 0.18