Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HIU3

Protein Details
Accession A0A179HIU3    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-86SEPTESWLERRDRKKQDKKEAIKELATHydrophilic
139-161KDTHAHEKPGKKKKPHRGYAFVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-155HEKPGKKKKPHR
229-245GGRGRGGGRGGRGGFRG
337-337R
339-343RDRDR
345-345R
348-365GRDRDRDRDRDRGGRDRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG plj:VFPFJ_05752  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAGIMTEKLPHELRALFAPRPPLRWVEAVDKRPEQRRTRHIDGVGAFLSDLKEYNANEISEPTESWLERRDRKKQDKKEAIKELATLGPKQFKPEEDPNVRGNALSTMVVARLSYEADERDLERHFGRFGPIERIRIVKDTHAHEKPGKKKKPHRGYAFVVFEREKDMQGRQVKLDVERGRTVVGWTPRRLGGGLGGRNYTKALPFQPMGPRGGFRDGFRGGFRGGFDGGRGRGGGRGGRGGFRGGFDGPRGGDRNGFGPPSGAPLGPGFDRRNGDRGFSGPGYDRGPRFDDRPERSGGFGGGRFGDRDPGRRTGSNTEPIGRREGGYRDRDRDRDRDRDRDRDRDYGRDRDRDRDRDRGGRDRRDFDRPPRDDDSRKRAYEGGGYDDSRKMPRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.29
4 0.31
5 0.4
6 0.39
7 0.41
8 0.42
9 0.38
10 0.38
11 0.39
12 0.4
13 0.41
14 0.47
15 0.5
16 0.54
17 0.57
18 0.6
19 0.65
20 0.7
21 0.68
22 0.69
23 0.73
24 0.75
25 0.76
26 0.77
27 0.7
28 0.68
29 0.6
30 0.55
31 0.45
32 0.36
33 0.28
34 0.21
35 0.2
36 0.13
37 0.12
38 0.09
39 0.12
40 0.12
41 0.17
42 0.2
43 0.2
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.24
54 0.29
55 0.37
56 0.45
57 0.52
58 0.6
59 0.71
60 0.81
61 0.84
62 0.88
63 0.9
64 0.92
65 0.92
66 0.9
67 0.84
68 0.74
69 0.64
70 0.56
71 0.49
72 0.42
73 0.33
74 0.27
75 0.3
76 0.29
77 0.32
78 0.32
79 0.29
80 0.35
81 0.41
82 0.48
83 0.46
84 0.5
85 0.48
86 0.48
87 0.46
88 0.38
89 0.31
90 0.22
91 0.17
92 0.13
93 0.11
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.25
118 0.27
119 0.29
120 0.29
121 0.3
122 0.29
123 0.29
124 0.28
125 0.23
126 0.26
127 0.28
128 0.35
129 0.35
130 0.37
131 0.4
132 0.47
133 0.53
134 0.58
135 0.62
136 0.63
137 0.72
138 0.79
139 0.84
140 0.86
141 0.84
142 0.81
143 0.78
144 0.77
145 0.73
146 0.62
147 0.54
148 0.45
149 0.37
150 0.33
151 0.28
152 0.2
153 0.16
154 0.16
155 0.21
156 0.25
157 0.27
158 0.24
159 0.26
160 0.26
161 0.26
162 0.33
163 0.28
164 0.27
165 0.26
166 0.26
167 0.23
168 0.22
169 0.22
170 0.18
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.25
175 0.25
176 0.25
177 0.24
178 0.2
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.19
187 0.15
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.13
192 0.13
193 0.16
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.22
198 0.21
199 0.2
200 0.24
201 0.21
202 0.17
203 0.2
204 0.19
205 0.2
206 0.2
207 0.19
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.1
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.15
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.14
238 0.16
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.14
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.18
256 0.15
257 0.19
258 0.22
259 0.23
260 0.29
261 0.28
262 0.29
263 0.26
264 0.26
265 0.26
266 0.23
267 0.24
268 0.19
269 0.21
270 0.22
271 0.25
272 0.24
273 0.22
274 0.26
275 0.26
276 0.27
277 0.33
278 0.4
279 0.41
280 0.44
281 0.45
282 0.42
283 0.42
284 0.4
285 0.33
286 0.26
287 0.21
288 0.19
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.21
294 0.2
295 0.26
296 0.29
297 0.34
298 0.37
299 0.39
300 0.43
301 0.42
302 0.47
303 0.48
304 0.46
305 0.47
306 0.46
307 0.46
308 0.46
309 0.4
310 0.34
311 0.31
312 0.35
313 0.37
314 0.42
315 0.47
316 0.49
317 0.55
318 0.62
319 0.64
320 0.67
321 0.66
322 0.68
323 0.69
324 0.72
325 0.72
326 0.75
327 0.77
328 0.77
329 0.75
330 0.74
331 0.71
332 0.7
333 0.69
334 0.69
335 0.69
336 0.69
337 0.67
338 0.67
339 0.73
340 0.73
341 0.72
342 0.71
343 0.71
344 0.7
345 0.74
346 0.75
347 0.75
348 0.76
349 0.77
350 0.75
351 0.73
352 0.73
353 0.74
354 0.74
355 0.75
356 0.68
357 0.68
358 0.68
359 0.71
360 0.71
361 0.73
362 0.72
363 0.71
364 0.69
365 0.64
366 0.6
367 0.55
368 0.52
369 0.45
370 0.43
371 0.39
372 0.39
373 0.39
374 0.39
375 0.4