Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HG80

Protein Details
Accession A0A179HG80    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-244RRAAQSRPAKRKTRASNNAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-236PAKRK
304-326PDKKAQEAPPATRRLPFANRKAK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG plj:VFPFJ_06935  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MAPNTRVVKFPRSDDESTSVLVQVTSSGRKALDLKLVATEGEAPYVCTLKHDRVSSLRFKNCPVSEKEWEQILESIFEQELVADIQATATVSTDSSISVTVRKQVQGITQRLGAITLNCDQKEGIELFQWCEVSLDALAQAKREAASSIAKARELEAAVTELQSQLDELVESKQEDETSLLQKFRDLLNEKKVKIREQQKVIASSSFNGGQPSSQSPQEDEQPARRAAQSRPAKRKTRASNNAEDADGDEDVDMVKEEAEDTDPGETSEGTASTASVNDEDKAEPEAARNAAGRQDSKRQRTSPDKKAQEAPPATRRLPFANRKAKAPAPAAAGDTDSDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.45
4 0.42
5 0.37
6 0.29
7 0.22
8 0.19
9 0.14
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.16
16 0.19
17 0.22
18 0.23
19 0.28
20 0.26
21 0.26
22 0.27
23 0.27
24 0.24
25 0.22
26 0.22
27 0.14
28 0.15
29 0.14
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.13
34 0.14
35 0.18
36 0.22
37 0.28
38 0.29
39 0.32
40 0.38
41 0.45
42 0.5
43 0.56
44 0.56
45 0.52
46 0.54
47 0.59
48 0.56
49 0.55
50 0.53
51 0.51
52 0.51
53 0.53
54 0.52
55 0.46
56 0.42
57 0.38
58 0.34
59 0.27
60 0.21
61 0.17
62 0.16
63 0.13
64 0.12
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.1
87 0.14
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.19
92 0.25
93 0.31
94 0.34
95 0.31
96 0.3
97 0.29
98 0.28
99 0.27
100 0.21
101 0.13
102 0.12
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.18
110 0.17
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.15
116 0.15
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.1
134 0.11
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.14
172 0.19
173 0.2
174 0.23
175 0.32
176 0.38
177 0.38
178 0.43
179 0.45
180 0.42
181 0.46
182 0.51
183 0.49
184 0.49
185 0.54
186 0.52
187 0.53
188 0.5
189 0.44
190 0.35
191 0.27
192 0.23
193 0.19
194 0.15
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.12
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.17
204 0.19
205 0.23
206 0.26
207 0.24
208 0.27
209 0.3
210 0.3
211 0.3
212 0.3
213 0.29
214 0.26
215 0.34
216 0.39
217 0.44
218 0.54
219 0.61
220 0.67
221 0.7
222 0.78
223 0.78
224 0.8
225 0.81
226 0.77
227 0.77
228 0.74
229 0.7
230 0.6
231 0.5
232 0.39
233 0.31
234 0.24
235 0.15
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.14
273 0.17
274 0.16
275 0.18
276 0.18
277 0.16
278 0.2
279 0.23
280 0.25
281 0.26
282 0.36
283 0.44
284 0.52
285 0.59
286 0.58
287 0.64
288 0.71
289 0.76
290 0.77
291 0.78
292 0.76
293 0.74
294 0.78
295 0.75
296 0.74
297 0.71
298 0.68
299 0.66
300 0.65
301 0.61
302 0.56
303 0.53
304 0.51
305 0.54
306 0.56
307 0.58
308 0.62
309 0.63
310 0.64
311 0.69
312 0.66
313 0.64
314 0.58
315 0.52
316 0.46
317 0.45
318 0.42
319 0.36
320 0.32
321 0.25
322 0.23