Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179H838

Protein Details
Accession A0A179H838    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
443-469SKPATATPKRRPPKAAKSPSPAPKPRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
449-471TPKRRPPKAAKSPSPAPKPRDAR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
KEGG plj:VFPFJ_07958  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
CDD cd06141  WRN_exo  
Amino Acid Sequences MTRDKSSSRLWDPASGIRFSPSPVSTPPLYPRLDVARFSHAVSAGRSVDVLEEEAEAGNVQENGQPREDEGRDEGGQVYAGPSEVLAEALYTPQATSTSDGKGGTKSIATAADRAPTTNGEPGRAQDAVDPPHTSLSFNMSRDLFRAARAAAPGSAQSYWSHTLYRRVTPSGGVEKVRVHYCTSRHTMEHVCRKYFLGEPVLGLDLEWLPYASRAAGPRENVSLIQVASPGRIGLFHVAMFSDAGSAAERRRALSSKGTASSSASTSRKASDDLVAPTFRSIMEDPAVSKVGVHVQGDCTRLSNYLGVRPRGVFELSHLYKQVKYSAARTPRLINKIPVALSTQVEECLRLPLYKGDSVRSSNWMRPLNSEQLLYSASDAYAGIQLYYVLEGRRMELDPCPPRPHHAELGLPIPYVESEPESDDSSQEYSTSDDAAAVAPSTSKPATATPKRRPPKAAKSPSPAPKPRDARIAAAELRSREYRSSKQTPVSATPAALRAYYLWHTNDGLRPEPIAGLLRDPPLKVNTVVSYILDAITSERLPYDKARLGGEILPLLDAKLVGGRYRYLARACAADESRGAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.43
3 0.39
4 0.34
5 0.32
6 0.28
7 0.3
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.29
12 0.29
13 0.33
14 0.37
15 0.38
16 0.39
17 0.36
18 0.38
19 0.41
20 0.42
21 0.41
22 0.38
23 0.39
24 0.38
25 0.38
26 0.37
27 0.31
28 0.3
29 0.28
30 0.29
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.17
35 0.16
36 0.14
37 0.14
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.14
50 0.17
51 0.19
52 0.19
53 0.19
54 0.26
55 0.27
56 0.27
57 0.26
58 0.29
59 0.27
60 0.28
61 0.27
62 0.2
63 0.19
64 0.16
65 0.13
66 0.08
67 0.08
68 0.06
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.11
84 0.13
85 0.15
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.17
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.17
96 0.16
97 0.18
98 0.18
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.18
104 0.19
105 0.23
106 0.22
107 0.2
108 0.21
109 0.22
110 0.24
111 0.22
112 0.2
113 0.18
114 0.23
115 0.23
116 0.25
117 0.24
118 0.21
119 0.25
120 0.25
121 0.21
122 0.17
123 0.21
124 0.23
125 0.23
126 0.25
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.28
131 0.22
132 0.18
133 0.2
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.14
146 0.16
147 0.17
148 0.19
149 0.19
150 0.27
151 0.3
152 0.35
153 0.34
154 0.34
155 0.33
156 0.32
157 0.36
158 0.33
159 0.33
160 0.28
161 0.27
162 0.27
163 0.3
164 0.31
165 0.26
166 0.24
167 0.25
168 0.27
169 0.31
170 0.34
171 0.34
172 0.32
173 0.35
174 0.38
175 0.42
176 0.5
177 0.48
178 0.44
179 0.43
180 0.43
181 0.41
182 0.37
183 0.32
184 0.26
185 0.21
186 0.2
187 0.2
188 0.19
189 0.16
190 0.13
191 0.11
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.07
201 0.09
202 0.13
203 0.16
204 0.18
205 0.19
206 0.2
207 0.21
208 0.18
209 0.18
210 0.15
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.13
239 0.15
240 0.17
241 0.22
242 0.25
243 0.25
244 0.27
245 0.26
246 0.24
247 0.24
248 0.23
249 0.18
250 0.2
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.18
257 0.17
258 0.14
259 0.17
260 0.17
261 0.19
262 0.17
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.09
282 0.11
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.16
293 0.21
294 0.2
295 0.21
296 0.21
297 0.21
298 0.19
299 0.19
300 0.13
301 0.11
302 0.19
303 0.2
304 0.2
305 0.21
306 0.2
307 0.21
308 0.22
309 0.23
310 0.17
311 0.18
312 0.2
313 0.26
314 0.33
315 0.34
316 0.35
317 0.37
318 0.39
319 0.44
320 0.43
321 0.37
322 0.33
323 0.33
324 0.31
325 0.26
326 0.23
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.13
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.15
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.21
345 0.24
346 0.25
347 0.27
348 0.27
349 0.27
350 0.33
351 0.35
352 0.33
353 0.35
354 0.38
355 0.38
356 0.36
357 0.34
358 0.27
359 0.23
360 0.23
361 0.19
362 0.15
363 0.09
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.05
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.14
384 0.23
385 0.27
386 0.31
387 0.35
388 0.34
389 0.38
390 0.42
391 0.44
392 0.4
393 0.37
394 0.35
395 0.32
396 0.35
397 0.31
398 0.25
399 0.2
400 0.16
401 0.13
402 0.11
403 0.1
404 0.07
405 0.08
406 0.1
407 0.12
408 0.14
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.15
433 0.25
434 0.35
435 0.45
436 0.51
437 0.62
438 0.69
439 0.74
440 0.78
441 0.78
442 0.79
443 0.8
444 0.81
445 0.79
446 0.8
447 0.83
448 0.84
449 0.84
450 0.81
451 0.75
452 0.74
453 0.72
454 0.68
455 0.67
456 0.6
457 0.54
458 0.51
459 0.51
460 0.44
461 0.41
462 0.41
463 0.33
464 0.35
465 0.33
466 0.31
467 0.29
468 0.33
469 0.36
470 0.42
471 0.49
472 0.51
473 0.55
474 0.57
475 0.57
476 0.56
477 0.54
478 0.46
479 0.39
480 0.35
481 0.33
482 0.29
483 0.24
484 0.19
485 0.14
486 0.17
487 0.18
488 0.2
489 0.19
490 0.2
491 0.22
492 0.25
493 0.29
494 0.29
495 0.29
496 0.26
497 0.25
498 0.24
499 0.22
500 0.21
501 0.19
502 0.16
503 0.16
504 0.18
505 0.22
506 0.23
507 0.24
508 0.26
509 0.25
510 0.27
511 0.25
512 0.26
513 0.23
514 0.24
515 0.25
516 0.21
517 0.2
518 0.18
519 0.17
520 0.13
521 0.11
522 0.1
523 0.12
524 0.12
525 0.1
526 0.11
527 0.12
528 0.14
529 0.18
530 0.24
531 0.26
532 0.28
533 0.3
534 0.3
535 0.32
536 0.32
537 0.31
538 0.25
539 0.21
540 0.19
541 0.17
542 0.16
543 0.13
544 0.1
545 0.08
546 0.1
547 0.11
548 0.12
549 0.14
550 0.16
551 0.19
552 0.23
553 0.27
554 0.26
555 0.29
556 0.28
557 0.3
558 0.3
559 0.34
560 0.32
561 0.29
562 0.28