Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HYC1

Protein Details
Accession A0A179HYC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-104TTSSGRISRRKSQKSREAKNRLGNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-93RKSQK
138-161AKAGRIRHRSMKMTKGALKRKERI
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG plj:VFPFJ_01645  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPRPPSSSAPKPSARALRQARVDGTIHPLLPSKLFRPDAAVSDSFLSTKRDRRTIRRSVFVSRVADSSSSARASSGGTTTSSGRISRRKSQKSREAKNRLGNLSALASALDDLEGEGYGGGASGDDADGGRDAGEAAKAGRIRHRSMKMTKGALKRKERIVRGEMQRFGVSMAKLAETGAGAAASTSAATPSAGLSGVKEAGKSRAKAGDVAMTEGAKEQPQQPTETGNRWAALRGYISSTMEQNPAFKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.6
3 0.61
4 0.61
5 0.62
6 0.62
7 0.63
8 0.56
9 0.5
10 0.48
11 0.39
12 0.38
13 0.33
14 0.27
15 0.24
16 0.25
17 0.22
18 0.25
19 0.26
20 0.22
21 0.27
22 0.29
23 0.28
24 0.31
25 0.32
26 0.32
27 0.34
28 0.32
29 0.25
30 0.25
31 0.25
32 0.2
33 0.19
34 0.21
35 0.2
36 0.27
37 0.31
38 0.39
39 0.45
40 0.54
41 0.62
42 0.68
43 0.71
44 0.71
45 0.69
46 0.67
47 0.66
48 0.62
49 0.55
50 0.46
51 0.4
52 0.32
53 0.29
54 0.24
55 0.21
56 0.17
57 0.15
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.18
72 0.24
73 0.29
74 0.37
75 0.47
76 0.55
77 0.63
78 0.71
79 0.77
80 0.8
81 0.85
82 0.86
83 0.85
84 0.82
85 0.81
86 0.77
87 0.68
88 0.59
89 0.49
90 0.39
91 0.3
92 0.23
93 0.15
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.04
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.06
126 0.08
127 0.09
128 0.14
129 0.18
130 0.21
131 0.29
132 0.34
133 0.39
134 0.42
135 0.49
136 0.48
137 0.5
138 0.54
139 0.55
140 0.58
141 0.6
142 0.63
143 0.61
144 0.65
145 0.67
146 0.64
147 0.61
148 0.58
149 0.57
150 0.58
151 0.61
152 0.53
153 0.48
154 0.44
155 0.38
156 0.34
157 0.28
158 0.2
159 0.15
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.07
166 0.07
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.19
190 0.25
191 0.26
192 0.27
193 0.3
194 0.31
195 0.32
196 0.32
197 0.31
198 0.26
199 0.27
200 0.25
201 0.19
202 0.19
203 0.18
204 0.18
205 0.13
206 0.14
207 0.16
208 0.22
209 0.24
210 0.27
211 0.27
212 0.33
213 0.37
214 0.39
215 0.4
216 0.36
217 0.35
218 0.33
219 0.34
220 0.28
221 0.26
222 0.23
223 0.19
224 0.21
225 0.22
226 0.24
227 0.23
228 0.25
229 0.25
230 0.26
231 0.26