Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HLT4

Protein Details
Accession A0A179HLT4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-34AVPPPSRPSPKQKLKSSVQRSLRGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 24, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016437  MCT-1/Tma20  
IPR041366  Pre-PUA  
IPR002478  PUA  
IPR015947  PUA-like_sf  
IPR004521  Uncharacterised_CHP00451  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG plj:VFPFJ_03115  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17832  Pre-PUA  
PF01472  PUA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50890  PUA  
CDD cd11609  MCT1_N  
cd21155  PUA_MCTS-1-like  
Amino Acid Sequences MFKKEQVPPPAVPPPSRPSPKQKLKSSVQRSLRGSLLATYPLLTPHIDEILPKKASLSSMKLTDRNTLYVLDAEPLFYQQDVSSTILPHLRLVHRFPQSFPTIRIDRGAIRFVLSGATLMAPGLTSKGGRLPREGAHKAPLEEGKEMDQGVDEEGRWSRELAKGEPVVIMAEGKEEACAVGTLVTATDEVKAKGKGPVVEDAHFLGDGLWKLSTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.52
3 0.57
4 0.56
5 0.58
6 0.65
7 0.73
8 0.77
9 0.8
10 0.78
11 0.81
12 0.86
13 0.85
14 0.84
15 0.81
16 0.79
17 0.74
18 0.69
19 0.6
20 0.5
21 0.42
22 0.34
23 0.27
24 0.21
25 0.17
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.11
35 0.12
36 0.15
37 0.21
38 0.21
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.22
43 0.25
44 0.26
45 0.22
46 0.28
47 0.31
48 0.34
49 0.35
50 0.38
51 0.35
52 0.32
53 0.29
54 0.24
55 0.21
56 0.19
57 0.17
58 0.13
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.2
80 0.26
81 0.3
82 0.3
83 0.3
84 0.32
85 0.33
86 0.32
87 0.31
88 0.29
89 0.25
90 0.25
91 0.25
92 0.21
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.08
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.1
115 0.14
116 0.15
117 0.17
118 0.2
119 0.23
120 0.32
121 0.34
122 0.3
123 0.32
124 0.33
125 0.31
126 0.31
127 0.3
128 0.24
129 0.22
130 0.22
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.14
135 0.11
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.19
148 0.19
149 0.25
150 0.24
151 0.24
152 0.23
153 0.21
154 0.17
155 0.15
156 0.13
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.1
176 0.11
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.22
181 0.26
182 0.27
183 0.28
184 0.35
185 0.35
186 0.35
187 0.36
188 0.32
189 0.29
190 0.26
191 0.23
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.13