Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GT84

Protein Details
Accession A0A179GT84    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-101EEDVPAPKRRRGRPRKEEQRRAESPSFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-27RGRGGRRGRPPVRAGLGRG
48-56KRPRGRPRK
80-95APKRRRGRPRKEEQRR
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 10, nucl 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG plj:VFPFJ_09602  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSNNEQAPRGRGGRRGRPPVRAGLGRGRITVSGNAAGAEGEGVVTSAKRPRGRPRKEELLEEQRREEEEGKEGEEEDVPAPKRRRGRPRKEEQRRAESPSFFPALSDDDKDEDEQEDEDEKTEDQEGPEQGPSSSTHTFRAEEQMANNAAPEGRRFEALMRKNLAVAIDAGLESAERYYKRVKPRVSVGTKDLIDRMVGPPEPAMRIGWTQALEDEVQAQWAASDEKRSLEAASWIERVIALWKVSLQLFRCSPVAIMSPAYNLWIDASNPGEVFWPVTFCEALSHLVAHPIWRGNKALLRRAIQLAVACRTDNRASWTMDQPEMCGAIVAIAQFFLVDNREHAPKHWVEQAFKEVPNGKVACPEACFLRHLATVCSPKKPQRTDDTRFLVRRKDLVNITKAVETFGEGFFPSTNSVPAMYYAYLAARSGHTAPVGEARTKELHGLAWKHEMRRAKRRELGLPFDDASMALDNPEGHAASSTRRHGPVVHGNAQGAMGFVPQKQPPAPPTTSSSDADEETSESGDTIFMDAQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.73
3 0.73
4 0.75
5 0.75
6 0.76
7 0.74
8 0.68
9 0.63
10 0.62
11 0.64
12 0.57
13 0.54
14 0.47
15 0.4
16 0.38
17 0.35
18 0.29
19 0.22
20 0.2
21 0.19
22 0.17
23 0.16
24 0.13
25 0.1
26 0.07
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.05
32 0.08
33 0.13
34 0.21
35 0.27
36 0.34
37 0.45
38 0.56
39 0.66
40 0.72
41 0.75
42 0.79
43 0.77
44 0.78
45 0.76
46 0.77
47 0.75
48 0.69
49 0.63
50 0.54
51 0.52
52 0.49
53 0.43
54 0.34
55 0.31
56 0.29
57 0.28
58 0.26
59 0.25
60 0.22
61 0.19
62 0.19
63 0.14
64 0.19
65 0.19
66 0.27
67 0.3
68 0.35
69 0.43
70 0.51
71 0.61
72 0.66
73 0.76
74 0.78
75 0.86
76 0.92
77 0.94
78 0.96
79 0.94
80 0.92
81 0.86
82 0.84
83 0.79
84 0.71
85 0.62
86 0.57
87 0.5
88 0.39
89 0.34
90 0.27
91 0.24
92 0.23
93 0.22
94 0.18
95 0.18
96 0.19
97 0.2
98 0.19
99 0.16
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.16
113 0.16
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.18
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.24
125 0.25
126 0.25
127 0.31
128 0.27
129 0.25
130 0.25
131 0.26
132 0.25
133 0.24
134 0.22
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.17
144 0.25
145 0.3
146 0.35
147 0.34
148 0.34
149 0.33
150 0.34
151 0.3
152 0.21
153 0.16
154 0.11
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.16
166 0.22
167 0.32
168 0.4
169 0.44
170 0.46
171 0.54
172 0.62
173 0.62
174 0.59
175 0.53
176 0.51
177 0.48
178 0.43
179 0.36
180 0.26
181 0.2
182 0.18
183 0.16
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.04
208 0.05
209 0.07
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.09
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.14
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.18
284 0.21
285 0.26
286 0.27
287 0.28
288 0.29
289 0.29
290 0.28
291 0.26
292 0.24
293 0.2
294 0.18
295 0.16
296 0.14
297 0.13
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.19
302 0.2
303 0.21
304 0.24
305 0.29
306 0.28
307 0.29
308 0.28
309 0.23
310 0.2
311 0.18
312 0.15
313 0.1
314 0.07
315 0.05
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.09
328 0.12
329 0.12
330 0.14
331 0.19
332 0.19
333 0.21
334 0.27
335 0.28
336 0.27
337 0.3
338 0.36
339 0.34
340 0.33
341 0.34
342 0.31
343 0.28
344 0.33
345 0.31
346 0.24
347 0.25
348 0.26
349 0.23
350 0.21
351 0.21
352 0.17
353 0.17
354 0.18
355 0.14
356 0.15
357 0.16
358 0.15
359 0.17
360 0.2
361 0.28
362 0.3
363 0.34
364 0.37
365 0.42
366 0.51
367 0.54
368 0.55
369 0.56
370 0.63
371 0.65
372 0.69
373 0.69
374 0.68
375 0.68
376 0.65
377 0.61
378 0.54
379 0.52
380 0.44
381 0.43
382 0.42
383 0.44
384 0.45
385 0.41
386 0.4
387 0.37
388 0.36
389 0.3
390 0.23
391 0.18
392 0.15
393 0.13
394 0.12
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.1
403 0.11
404 0.1
405 0.11
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.11
416 0.12
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.19
422 0.2
423 0.2
424 0.19
425 0.22
426 0.24
427 0.24
428 0.25
429 0.19
430 0.2
431 0.25
432 0.27
433 0.26
434 0.33
435 0.36
436 0.37
437 0.41
438 0.47
439 0.49
440 0.56
441 0.62
442 0.62
443 0.65
444 0.69
445 0.73
446 0.72
447 0.72
448 0.64
449 0.6
450 0.51
451 0.44
452 0.38
453 0.29
454 0.23
455 0.16
456 0.13
457 0.09
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.12
462 0.1
463 0.09
464 0.11
465 0.11
466 0.16
467 0.22
468 0.26
469 0.3
470 0.32
471 0.33
472 0.33
473 0.4
474 0.45
475 0.47
476 0.49
477 0.46
478 0.44
479 0.43
480 0.41
481 0.33
482 0.23
483 0.15
484 0.1
485 0.09
486 0.1
487 0.15
488 0.16
489 0.21
490 0.23
491 0.28
492 0.31
493 0.37
494 0.4
495 0.38
496 0.42
497 0.45
498 0.47
499 0.44
500 0.43
501 0.38
502 0.35
503 0.33
504 0.28
505 0.23
506 0.19
507 0.18
508 0.14
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.09