Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J9D5V3

Protein Details
Accession J9D5V3    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
640-668EDPPVIKNRRKKELRRLMRQEKRKNKMIEBasic
916-955QQKKNDSKSVSDTRKKKNKIIVKDKKKTTKLNQEAVNKFFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
646-665KNRRKKELRRLMRQEKRKNK
929-942RKKKNKIIVKDKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, cyto 5, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
Amino Acid Sequences MENTTESCTNCGGITLFKDESNGQVLCTGCGHITTTFSPTASLEFNDNMLAGRMINLNSTQNLFNTVNKVEQLLMNICDLNYLPLQYATTAFRYYKLSSNFKLTKGKSILYSLVACLYLVCRLEKCMVLLVDLSCRMRIDCFYCAKMFLKIRDKLCVKIGVVDPSFYLEKYVDCLIDLSIKNGFVFSDNENVSLVENEFDEDLVDFNLFDYLSKIKQSDKDNESLENSENTDEKYKVCSDNSMDLSKNAENNNYLANFDENVVKSSNIPNYYDKSCDSGNVFNNFKVILDESLKICEKVGSFPTFDVCQDNNKHHNTNIVAPFLFGTEELTKSPGSSFDDARVRFPVEPSFLFENLEAINNINLEEIINSVNNQNDKNNIFTEKTNIVDKSSKTNTNKITEKNEKKVFVTKKQFKREMLTYSSRIVKWMKRDWIITGRRPNNVCGAAILLASRILYKKYSYTVVNVINSDANANKNGACSSLYNLSSKDSSTNNRLDLFESVYSIKLNNHDLNGIINQNSCTEIGSNNRQVLESNQKDIYITDNSHNQNLKNCKITVPFCEAYYNIISNNIPDNKSIFTEVNRVDDNIKSTVPLFTLNDVSCIVKGAPITIEKRLKEIDDTKTAKMTVEEFMEKWVNTDEDPPVIKNRRKKELRRLMRQEKRKNKMIEAMCKRRDSNYLKKNLLSQNCDENDINSMRNLENRGPFYFEENMCFNEDDSRNTEANRIVHPDSFSNVNSLLNCVNKDFFDTPMTPDNLPTDIYDNKNDNFVSNEINNIEIITSNDAKVNINSNSINNIDSYGKNKKSISTMTPNQLNTINQLTTNINTKNIIGMTPDYSSSLNKPTNYLSQQLPHFISTPSDISKNTQPNILNIQDPFYDIDFSTDSEIEEIILNESDSLRKKEIWYEMYSDYLNDKQQKKNDSKSVSDTRKKKNKIIVKDKKKTTKLNQEAVNKFFGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.21
4 0.2
5 0.23
6 0.22
7 0.24
8 0.26
9 0.23
10 0.18
11 0.21
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.13
20 0.16
21 0.17
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.2
26 0.19
27 0.2
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.16
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.15
44 0.16
45 0.17
46 0.2
47 0.2
48 0.18
49 0.23
50 0.23
51 0.24
52 0.26
53 0.27
54 0.27
55 0.26
56 0.27
57 0.22
58 0.21
59 0.23
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.24
81 0.26
82 0.32
83 0.37
84 0.42
85 0.41
86 0.51
87 0.53
88 0.54
89 0.61
90 0.55
91 0.57
92 0.53
93 0.53
94 0.46
95 0.45
96 0.42
97 0.36
98 0.35
99 0.26
100 0.24
101 0.21
102 0.18
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.15
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.21
114 0.2
115 0.19
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.21
120 0.21
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.2
126 0.2
127 0.24
128 0.27
129 0.29
130 0.3
131 0.32
132 0.32
133 0.36
134 0.37
135 0.39
136 0.44
137 0.48
138 0.49
139 0.55
140 0.56
141 0.52
142 0.52
143 0.49
144 0.4
145 0.39
146 0.4
147 0.38
148 0.37
149 0.34
150 0.29
151 0.27
152 0.27
153 0.21
154 0.19
155 0.12
156 0.12
157 0.14
158 0.16
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.1
172 0.13
173 0.13
174 0.18
175 0.18
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.13
201 0.14
202 0.17
203 0.23
204 0.29
205 0.37
206 0.39
207 0.43
208 0.43
209 0.45
210 0.43
211 0.39
212 0.35
213 0.27
214 0.24
215 0.2
216 0.19
217 0.18
218 0.2
219 0.18
220 0.17
221 0.19
222 0.21
223 0.23
224 0.23
225 0.25
226 0.25
227 0.32
228 0.35
229 0.34
230 0.31
231 0.29
232 0.32
233 0.29
234 0.3
235 0.24
236 0.22
237 0.2
238 0.2
239 0.23
240 0.19
241 0.18
242 0.15
243 0.15
244 0.13
245 0.13
246 0.16
247 0.14
248 0.15
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.19
253 0.23
254 0.2
255 0.23
256 0.24
257 0.28
258 0.3
259 0.3
260 0.27
261 0.25
262 0.23
263 0.23
264 0.22
265 0.24
266 0.27
267 0.31
268 0.31
269 0.29
270 0.29
271 0.27
272 0.24
273 0.19
274 0.15
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.18
280 0.19
281 0.17
282 0.16
283 0.16
284 0.14
285 0.16
286 0.2
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.21
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.16
295 0.21
296 0.23
297 0.29
298 0.34
299 0.37
300 0.39
301 0.35
302 0.4
303 0.35
304 0.39
305 0.36
306 0.31
307 0.26
308 0.25
309 0.24
310 0.19
311 0.17
312 0.09
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.11
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.2
326 0.26
327 0.26
328 0.28
329 0.27
330 0.25
331 0.24
332 0.24
333 0.22
334 0.19
335 0.18
336 0.21
337 0.22
338 0.2
339 0.21
340 0.19
341 0.17
342 0.14
343 0.15
344 0.1
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.09
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.16
363 0.17
364 0.18
365 0.19
366 0.19
367 0.19
368 0.19
369 0.23
370 0.2
371 0.21
372 0.22
373 0.21
374 0.21
375 0.23
376 0.24
377 0.27
378 0.29
379 0.35
380 0.35
381 0.41
382 0.43
383 0.46
384 0.5
385 0.47
386 0.52
387 0.55
388 0.58
389 0.6
390 0.6
391 0.55
392 0.52
393 0.57
394 0.54
395 0.53
396 0.57
397 0.58
398 0.62
399 0.7
400 0.73
401 0.67
402 0.67
403 0.61
404 0.55
405 0.52
406 0.47
407 0.4
408 0.38
409 0.39
410 0.33
411 0.31
412 0.3
413 0.27
414 0.29
415 0.34
416 0.36
417 0.35
418 0.36
419 0.36
420 0.42
421 0.44
422 0.44
423 0.48
424 0.46
425 0.48
426 0.49
427 0.46
428 0.42
429 0.37
430 0.3
431 0.21
432 0.18
433 0.13
434 0.12
435 0.11
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.09
445 0.1
446 0.13
447 0.13
448 0.15
449 0.19
450 0.21
451 0.21
452 0.2
453 0.19
454 0.16
455 0.15
456 0.14
457 0.1
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.14
474 0.14
475 0.15
476 0.13
477 0.15
478 0.2
479 0.22
480 0.22
481 0.23
482 0.23
483 0.22
484 0.2
485 0.19
486 0.14
487 0.13
488 0.12
489 0.11
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.13
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.09
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.12
512 0.17
513 0.19
514 0.2
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.22
519 0.28
520 0.24
521 0.25
522 0.24
523 0.23
524 0.23
525 0.23
526 0.23
527 0.15
528 0.15
529 0.14
530 0.2
531 0.21
532 0.26
533 0.27
534 0.25
535 0.29
536 0.33
537 0.34
538 0.31
539 0.31
540 0.29
541 0.32
542 0.33
543 0.3
544 0.32
545 0.29
546 0.26
547 0.27
548 0.24
549 0.22
550 0.22
551 0.19
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.17
557 0.17
558 0.16
559 0.16
560 0.17
561 0.16
562 0.17
563 0.19
564 0.14
565 0.13
566 0.19
567 0.19
568 0.21
569 0.2
570 0.2
571 0.19
572 0.19
573 0.21
574 0.16
575 0.15
576 0.12
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.12
581 0.1
582 0.1
583 0.14
584 0.13
585 0.14
586 0.14
587 0.14
588 0.12
589 0.12
590 0.1
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.12
596 0.14
597 0.2
598 0.25
599 0.24
600 0.27
601 0.27
602 0.26
603 0.28
604 0.32
605 0.3
606 0.34
607 0.37
608 0.35
609 0.36
610 0.35
611 0.31
612 0.26
613 0.23
614 0.15
615 0.15
616 0.15
617 0.14
618 0.17
619 0.18
620 0.17
621 0.16
622 0.16
623 0.14
624 0.13
625 0.15
626 0.13
627 0.14
628 0.15
629 0.15
630 0.21
631 0.29
632 0.33
633 0.39
634 0.45
635 0.53
636 0.62
637 0.7
638 0.74
639 0.77
640 0.82
641 0.85
642 0.89
643 0.89
644 0.89
645 0.9
646 0.9
647 0.89
648 0.86
649 0.84
650 0.78
651 0.7
652 0.69
653 0.66
654 0.66
655 0.66
656 0.68
657 0.65
658 0.65
659 0.62
660 0.56
661 0.58
662 0.55
663 0.55
664 0.54
665 0.58
666 0.57
667 0.57
668 0.62
669 0.6
670 0.59
671 0.53
672 0.47
673 0.47
674 0.45
675 0.48
676 0.4
677 0.33
678 0.31
679 0.27
680 0.25
681 0.17
682 0.18
683 0.15
684 0.18
685 0.21
686 0.21
687 0.25
688 0.27
689 0.28
690 0.29
691 0.29
692 0.3
693 0.33
694 0.29
695 0.27
696 0.25
697 0.25
698 0.24
699 0.24
700 0.2
701 0.22
702 0.22
703 0.22
704 0.24
705 0.27
706 0.25
707 0.26
708 0.28
709 0.25
710 0.26
711 0.26
712 0.27
713 0.25
714 0.26
715 0.28
716 0.26
717 0.24
718 0.24
719 0.22
720 0.19
721 0.18
722 0.17
723 0.15
724 0.16
725 0.17
726 0.16
727 0.17
728 0.16
729 0.17
730 0.16
731 0.21
732 0.2
733 0.19
734 0.21
735 0.21
736 0.24
737 0.29
738 0.31
739 0.26
740 0.26
741 0.26
742 0.22
743 0.22
744 0.19
745 0.17
746 0.19
747 0.22
748 0.26
749 0.28
750 0.27
751 0.3
752 0.29
753 0.26
754 0.24
755 0.23
756 0.23
757 0.19
758 0.22
759 0.18
760 0.19
761 0.18
762 0.14
763 0.13
764 0.09
765 0.1
766 0.12
767 0.12
768 0.12
769 0.14
770 0.15
771 0.16
772 0.17
773 0.22
774 0.18
775 0.21
776 0.22
777 0.21
778 0.24
779 0.23
780 0.22
781 0.17
782 0.18
783 0.17
784 0.17
785 0.22
786 0.29
787 0.31
788 0.35
789 0.35
790 0.36
791 0.39
792 0.43
793 0.45
794 0.45
795 0.49
796 0.53
797 0.57
798 0.55
799 0.51
800 0.49
801 0.42
802 0.36
803 0.33
804 0.26
805 0.2
806 0.23
807 0.22
808 0.21
809 0.27
810 0.25
811 0.22
812 0.22
813 0.22
814 0.23
815 0.21
816 0.2
817 0.16
818 0.16
819 0.17
820 0.17
821 0.17
822 0.16
823 0.16
824 0.18
825 0.19
826 0.25
827 0.27
828 0.26
829 0.29
830 0.31
831 0.38
832 0.39
833 0.4
834 0.36
835 0.37
836 0.39
837 0.42
838 0.4
839 0.33
840 0.31
841 0.28
842 0.27
843 0.24
844 0.25
845 0.22
846 0.23
847 0.22
848 0.26
849 0.34
850 0.39
851 0.37
852 0.4
853 0.38
854 0.4
855 0.45
856 0.43
857 0.38
858 0.31
859 0.33
860 0.27
861 0.27
862 0.25
863 0.19
864 0.19
865 0.15
866 0.18
867 0.16
868 0.16
869 0.18
870 0.16
871 0.15
872 0.14
873 0.13
874 0.11
875 0.11
876 0.11
877 0.1
878 0.1
879 0.09
880 0.09
881 0.1
882 0.15
883 0.19
884 0.23
885 0.24
886 0.26
887 0.29
888 0.35
889 0.43
890 0.43
891 0.42
892 0.43
893 0.41
894 0.42
895 0.4
896 0.33
897 0.29
898 0.27
899 0.31
900 0.35
901 0.39
902 0.44
903 0.51
904 0.6
905 0.65
906 0.71
907 0.74
908 0.71
909 0.71
910 0.72
911 0.76
912 0.77
913 0.78
914 0.77
915 0.79
916 0.83
917 0.84
918 0.83
919 0.83
920 0.82
921 0.83
922 0.86
923 0.86
924 0.87
925 0.9
926 0.92
927 0.92
928 0.91
929 0.9
930 0.9
931 0.9
932 0.88
933 0.86
934 0.85
935 0.84
936 0.82
937 0.75