Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HBR0

Protein Details
Accession A0A179HBR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-99DEGQKQTSKSKSKKTKPELDTELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-278KAKSKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG plj:VFPFJ_01016  -  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MAPPKKNEFLDASDSEDDQIDAYDSDNEVAKGGRSAKRRKVDSDEDDDVISDAEQDASDAEGDDDEGESSKEAEAGDEGQKQTSKSKSKKTKPELDTELPDITRPLTKKNLVATDKAIKKSGVVFLSRIPPFMKPAKVRSLLEPYGTINRTFLAPEDPASHARRVRAGGNKKRLYTEGWIEFVRKKDAKAVCELLNARIIGGKKGSYYHDDIWNLVYLKGFKWHHLTEQIAAENAERASRMRAEISKATKENKEFVRNVEKAKMLDGMQAKAKSKKRKAADGDAEVAAAPAAAAGGERERARTFKQVQQVKKADVEDQPERVTRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.32
3 0.28
4 0.22
5 0.15
6 0.14
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.14
19 0.2
20 0.25
21 0.33
22 0.42
23 0.51
24 0.6
25 0.65
26 0.67
27 0.69
28 0.73
29 0.71
30 0.7
31 0.65
32 0.56
33 0.51
34 0.45
35 0.36
36 0.26
37 0.19
38 0.11
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.1
63 0.13
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.25
70 0.31
71 0.37
72 0.41
73 0.51
74 0.6
75 0.69
76 0.78
77 0.82
78 0.85
79 0.79
80 0.8
81 0.78
82 0.72
83 0.66
84 0.58
85 0.51
86 0.4
87 0.36
88 0.27
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.18
93 0.22
94 0.25
95 0.28
96 0.33
97 0.4
98 0.38
99 0.39
100 0.39
101 0.42
102 0.44
103 0.43
104 0.39
105 0.31
106 0.29
107 0.29
108 0.3
109 0.23
110 0.19
111 0.18
112 0.19
113 0.27
114 0.26
115 0.25
116 0.21
117 0.19
118 0.22
119 0.26
120 0.29
121 0.26
122 0.3
123 0.36
124 0.4
125 0.4
126 0.4
127 0.43
128 0.37
129 0.35
130 0.31
131 0.25
132 0.26
133 0.26
134 0.22
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.13
145 0.16
146 0.19
147 0.21
148 0.2
149 0.2
150 0.22
151 0.21
152 0.24
153 0.29
154 0.37
155 0.43
156 0.51
157 0.54
158 0.53
159 0.53
160 0.49
161 0.43
162 0.37
163 0.34
164 0.26
165 0.25
166 0.24
167 0.25
168 0.26
169 0.25
170 0.28
171 0.22
172 0.2
173 0.26
174 0.29
175 0.29
176 0.31
177 0.33
178 0.27
179 0.31
180 0.31
181 0.24
182 0.24
183 0.21
184 0.17
185 0.16
186 0.16
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.1
191 0.12
192 0.15
193 0.16
194 0.2
195 0.22
196 0.27
197 0.27
198 0.27
199 0.26
200 0.26
201 0.23
202 0.19
203 0.17
204 0.12
205 0.12
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.24
210 0.25
211 0.27
212 0.31
213 0.32
214 0.27
215 0.3
216 0.28
217 0.22
218 0.21
219 0.18
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.15
229 0.17
230 0.22
231 0.28
232 0.32
233 0.37
234 0.39
235 0.42
236 0.44
237 0.44
238 0.47
239 0.47
240 0.5
241 0.44
242 0.47
243 0.52
244 0.5
245 0.51
246 0.49
247 0.45
248 0.37
249 0.37
250 0.34
251 0.25
252 0.28
253 0.27
254 0.24
255 0.27
256 0.31
257 0.33
258 0.38
259 0.46
260 0.51
261 0.57
262 0.64
263 0.65
264 0.71
265 0.75
266 0.77
267 0.78
268 0.72
269 0.68
270 0.59
271 0.52
272 0.42
273 0.34
274 0.22
275 0.13
276 0.07
277 0.03
278 0.03
279 0.02
280 0.03
281 0.04
282 0.05
283 0.1
284 0.1
285 0.14
286 0.17
287 0.2
288 0.24
289 0.33
290 0.37
291 0.41
292 0.5
293 0.56
294 0.61
295 0.68
296 0.7
297 0.65
298 0.64
299 0.59
300 0.55
301 0.51
302 0.52
303 0.46
304 0.44
305 0.44
306 0.41
307 0.41
308 0.36
309 0.34
310 0.29